连缀转录物检测概述:检测项目1.序列完整性分析:采用Agilent2100生物分析仪检测RNA完整性数值(RIN≥7.0),片段分布范围200-6000nt2.表达水平定量:基于RT-qPCR的绝对定量(Ct值0.5),动态范围10^1-10^8copies/μL3.剪接变异体鉴定:IlluminaNovaSeq6000平台进行150bp双端测序,覆盖深度≥304.多聚腺苷酸化位点定位:PacBioSequelII系统进行全长转录本测序(准确度≥Q30)5.融合转录本筛查:ArcherFusionPlexPanel捕获建库(
注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).
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1.序列完整性分析:采用Agilent2100生物分析仪检测RNA完整性数值(RIN≥7.0),片段分布范围200-6000nt
2.表达水平定量:基于RT-qPCR的绝对定量(Ct值0.5),动态范围10^1-10^8copies/μL
3.剪接变异体鉴定:IlluminaNovaSeq6000平台进行150bp双端测序,覆盖深度≥30
4.多聚腺苷酸化位点定位:PacBioSequelII系统进行全长转录本测序(准确度≥Q30)
5.融合转录本筛查:ArcherFusionPlexPanel捕获建库(灵敏度0.1%VAF)
1.哺乳动物细胞系(HEK293、HeLa等)培养物提取的总RNA
2.临床组织样本(福尔马林固定石蜡包埋组织)的微量RNA
3.外周血单个核细胞(PBMC)分离的循环RNA
4.植物组织(拟南芥叶片)低温保存样本
5.微生物群落(土壤/肠道宏转录组)复杂样本
ISO20184-1:2019《分子体外诊断检验-冷冻组织标本中RNA的分离纯化》
ASTME3133-18《核酸测序数据质量评估标准指南》
GB/T34796-2017《核酸定量测定用物质的量浓度标准物质》
ISO20395-2019《生物技术-核酸靶序列定量方法的验证要求》
GB/T37872-2019《高通量基因测序数据质量要求》
ThermoFisherQuantStudio6Pro:实时荧光定量PCR系统(温度均一性0.25℃)
Agilent4200TapeStation:自动化电泳系统(灵敏度1pg/μLRNA)
IlluminaNovaSeq6000:高通量测序平台(单次运行输出6Tb数据)
NanoporeGridIONX5:长读长测序设备(读长≥4Mb)
BeckmanCoulterBiomeki7:自动化液体处理工作站(移液精度1%)
QiagenQIAcubeConnect:核酸纯化系统(最大通量12样本/批次)
SartoriusCubisIIMSA:微量天平(分辨率0.1μg)
EppendorfMastercyclerX50:梯度PCR仪(升降温速率6℃/s)
Bio-RadCFXOpus96:实时定量PCR系统(多色荧光检测通道)
CovarisM220:聚焦式超声破碎仪(DNA片段化精度50bp)
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。
以上是与连缀转录物检测相关的简单介绍,具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。