检测项目
1.点突变筛查:包括同义/非同义突变(SNV),灵敏度≥99.9%,分辨率达0.1%突变频率
2.插入缺失突变分析:检测1-50bp长度变异(InDel),覆盖度≥30
3.移码突变验证:基于ORF开放阅读框完整性评估(读框偏移≥1bp)
4.密码子偏好性统计:计算RSCU值(相对同义密码子使用度)0.05误差范围
5.终止密码子早现检测:识别TAA/TAG/TGA异常出现(提前≥10个密码子)
检测范围
1.临床样本:全血/组织切片/FFPE样本(肿瘤基因panel覆盖500+位点)
2.微生物工程菌株:大肠杆菌/酵母基因组(CRISPR编辑区域500bp)
3.转基因作物:水稻Os基因家族/玉米Zm启动子区(转化载体同源臂200bp)
4.法医生物学样本:降解DNA样本(片段长度≥80bp)
5.模式生物模型:斑马鱼Zv9基因组/果蝇BDGP6组装版本
检测方法
1.ISO15189:2012《医学实验室质量和能力要求》第5.5条核酸扩增技术规范
2.GB/T30989-2014《转基因植物产品数字PCR检测方法》第7章定量分析条款
3.ASTME3136-18《高通量测序数据质量评估标准》第4.3节覆盖均一性要求
4.ISO/IEC17025:2017《检测和校准实验室能力通用要求》第6章技术要素
5.GB/T29824-2013《生物样品中核酸纯化方法验证规范》磁珠法吸附效率≥95%
检测设备
1.IlluminaNovaSeq6000:双流动槽系统(单次产出6Tb数据,读长2150bp)
2.ThermoFisherQuantStudio5:四通道qPCR仪(灵敏度5拷贝/μL)
3.Agilent4200TapeStation:DNA完整性检测(DIN值≥7.0判定合格)
4.BeckmanCoulterBiomeki7:自动化移液工作站(移液精度1%)
5.OxfordNanoporeGridIONX5:长读长测序仪(N50≥100kb)
6.QIAGENQIAcubeHT:高通量核酸提取系统(并行处理96样本)
7.RocheLightCycler480II:HRM高分辨率熔解曲线分析仪(温度分辨率0.01℃)
8.Bio-RadCFXOpus96:梯度PCR仪(温控精度0.1℃)
9.PacBioSequelIIe:HiFi测序模式(准确率≥99.9%)
10.PerkinElmerLabChipGXTouch:微流控电泳系统(DNA浓度检测范围0.1-200ng/μL)