基因编辑工具载体完整性

检测项目

物理完整性检测：

• 电泳分析：片段大小一致性（偏差≤5%）、纯度（A260/A280比值1.8-2.0，参照ISO21571)
• 浓度测定：紫外吸收值（A260精度±0.005）、杂质残留（内毒素<0.1EU/μg）

• 全基因组测序：覆盖率≥30x（错误率<0.01%，参照ASTME3039)
• 变异筛查：插入/缺失检测（频率阈值<0.1%）、点突变分析（灵敏度0.1%)

• 转染效率：细胞摄取率≥90%（参照ISO10993-5)、切割活性（IC50值≤10nM）
• 表达验证：蛋白产出量（Westernblot强度≥2倍背景）、RNA转录水平（RT-qPCRCt值≤25)

• GC含量测定：比例40-60%（偏差±2%)
• 杂质检测：溶剂残留（乙醇<0.5%）、重金属含量（铅<1ppm，参照GB/T5009.74）

• 热稳定性：融化温度Tm（范围60-80°C）、冻融循环耐受性（活性损失≤5%）
• 储存稳定性：保质期（≥12个月，常温存储）、降解速率（每月<1%)

• 无菌测试：微生物生长阴性（参照GB/T14233.2)、生物负载（CFU<10/样本）
• 细胞毒性：IC50值（≥100μM）、免疫原性（抗体滴度<1:100）

• 二级结构：圆二色谱CD分析（α-螺旋比例≥30%)
• 三级结构：X-ray衍射（分辨率≤2.0Å）、动态光散射DLS（粒径分布PDI<0.2）

• 缓冲液兼容性：pH耐受范围6.5-7.5、离子强度影响（活性保留≥95%)
• 酶兼容性：限制酶消化效率（≥98%）、连接酶反应速率（时间≤30min）

• 转录水平：mRNA完整性（RIN值≥8.0）、启动子活性（荧光强度≥10000RFU）
• 翻译产物：融合蛋白表达（纯度≥95%）、功能域折叠（正确率≥99%)

• 包封率：纳米载体负载效率（≥90%）、释放动力学（半衰期≥24h）
• 靶向性：细胞特异性结合率（≥80%）、脱靶效应（频率<0.5%)

检测范围

1.质粒DNA载体：涵盖CRISPR-Cas9编辑系统，重点检测超螺旋结构比例（≥90%）和抗生素抗性基因完整性，确保无线性化或开环缺陷。

2.腺相关病毒（AAV）载体：用于基因治疗递送，侧重滴度测定（≥1e12vg/mL）和外源DNA残留检测，保障无重组风险。

3.慢病毒载体：适用于干细胞工程，核心检测整合位点准确性（偏差<1bp）和逆转录酶活性，防止插入突变。

4.逆转录病毒载体：用于细胞转化研究，重点评估包装效率（≥80%）和基因组稳定性，监控长期表达一致性。

5.合成DNA载体：包括寡核苷酸构建体，检测合成错误率（<0.05/碱基）和修饰基团完整性，优化CRISPR引导RNA性能。

6.mRNA载体：应用于疫苗开发，聚焦5'帽结构和polyA尾完整性（长度≥100nt），确保翻译效率和免疫原性控制。

7.脂质体载体：用于核酸递送，核心检测粒径分布（PDI<0.15）和包封率（≥85%），提升体内靶向性。

8.纳米颗粒载体：涵盖金纳米粒和聚合物系统，侧重zeta电位（±30mV）和负载量验证，评估递送效率和生物分布。

9.细菌人工染色体（BAC）：用于大片段克隆，检测插入大小（≥100kb）和拷贝数稳定性，防止重组或缺失。

10.酵母人工染色体（YAC）：基因组编辑应用，重点监测端粒完整性（缺失≤1%）和有丝分裂稳定性，确保长期遗传保真度。

检测方法

国际标准：

• ISO21571:2020核酸载体纯度与完整性检测
• ASTME3039-19高通量测序变异分析方法
• ISO10993-5:2009生物材料细胞毒性试验

• GB/T5009.74-2014食品接触材料重金属检测
• GB/T14233.2-2005医疗器械无菌试验方法
• GB/T37845-2019基因编辑载体功能验证指南

检测设备

1.电泳系统：Bio-RadGelDocXR+（分辨率0.1ng，凝胶类型琼脂糖1-4%）

2.纳米滴分光光度计：ThermoNanoDropOne（波长范围190-850nm，样品体积1-2μL）

3.实时荧光定量PCR仪：AppliedBiosystems7500（动态范围10^9，温控精度±0.1°C）

4.高通量测序仪：IlluminaNovaSeq6000（产出6Tb/run，读长2x150bp）

5.流式细胞仪：BDFACSCantoII（检测通道18个，灵敏度<1000cells）

6.倒置显微镜：OlympusIX83（放大倍数40-1000x，CCD分辨率5MP）

7.高速离心机：Eppendorf5424R（最大转速15000rpm，容量24x1.5mL）

8.恒温培养箱：MemmertINCO108（温度范围4-70°C，湿度控制±2%）

9.紫外分光光度计：ShimadzuUV-1900i（光度精度±0.002Abs，波长扫描190-1100nm）

10.CO2培养箱：ThermoHeracellVIOS（CO2浓度控制±0.1%，温度均匀性±0.5°C）

11.冻干机：LabconcoFreeZone（真空度<0.1mbar，冷阱温度-85°C）

12.高效液相色谱仪：Agilent1260Infinity（流速范围0.001-10mL/min，检测限0.01μg）

13.质谱分析仪：ThermoQExactiveHF-X（分辨率240,000，质量精度<1ppm）

14.生物反应器：SartoriusBIOSTATSTR（体积控制精度±1%，搅拌速度10-1000rpm）

15.微流控芯片系统：FluidigmC1（单细胞捕获率>90%，通量96样本/run）

北检(北京)检测技术研究院【简称：北检院】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。

以上是与"基因编辑工具载体完整性"相关的简单介绍，具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。