检测项目
常规细胞遗传学检测:
- 核型分析:分辨率≥550条带(参照ISCN2020)
- 染色体G显带:条带清晰度≥400bp
- 染色体计数:异常检出率≥98%
- 荧光原位杂交(FISH):探针特异性≥99%(分辨率50kb-1Mb)
- 多重连接探针扩增(MLPA):拷贝数变异检出精度±0.5倍
- 染色体涂染:全染色体覆盖率≥95%
- 染色体微阵列(CMA):分辨率≤100kb(检出限0.1Mb)
- 单核苷酸多态性芯片(SNParray):杂合性缺失检出率≥99.9%
- 比较基因组杂交(CGH):动态范围±2倍
- 全外显子组测序(WES):覆盖度≥99.9%(平均深度100x)
- 目标区域测序:突变检出灵敏度≥95%
- 低深度全基因组测序:拷贝数变异分辨率≤500kb
- 快速非整倍体检测(QF-PCR):扩增效率≥95%
- 羊水细胞培养核型:成功率≥90%
- 无创产前检测(NIPT):假阳性率≤0.1%
- 融合基因FISH:探针信号强度≥500RFU
- 肿瘤染色体不稳定分析:变异频率检出限≥5%
- 循环肿瘤DNA检测:突变等位频率≥0.1%
- 亚端粒FISH:端粒长度变异检出精度±1kb
- 着丝粒探针杂交:信号一致性≥98%
- 端粒长度定量PCR:变异系数≤5%
- 单细胞全基因组扩增:扩增偏差≤10%
- 单细胞测序:覆盖率≥85%
- 胚胎植入前遗传筛查(PGT-A):非整倍体检出率≥95%
- 甲基化特异性PCR:甲基化水平精度±2%
- 亚硫酸氢盐测序:转化效率≥99%
- 印记缺陷分析:变异检出灵敏度≥90%
- 微缺失综合征MLPA:缺失/重复检出限≥100kb
- 动态突变分析:重复扩增大小精度±5重复单位
- 嵌合体定量:嵌合比例检出下限≥5%
检测范围
1.外周血样本:应用于常规染色体核型分析和FISH,重点检测白血病相关易位和先天异常。
2.羊水样本:用于产前诊断,侧重核型分析识别非整倍体及CMA检测微缺失。
3.绒毛膜样本:早期妊娠检测,核心为快速QF-PCR和细胞培养核型,避免母体污染。
4.流产组织样本:分析胚胎染色体异常,重点采用CMA和核型检测非整倍体及结构重排。
5.肿瘤组织样本:检测实体瘤遗传变异,核心项目为FISH融合基因和NGS突变筛查。
6.脐带血样本:新生儿遗传病筛查,侧重于核型分析和MLPA检测微缺失综合征。
7.口腔拭子样本:非侵入性采集,用于FISH和PCR为基础的家系分析,检测特定序列变异。
8.精液样本:男性不育检测,重点分析染色体非整倍体和Y染色体微缺失。
9.细胞培养物:体外扩增样本,应用于核型分析和单细胞遗传检测,确保细胞活力≥90%。
10.存档石蜡样本:回顾性研究,采用FISH和提取DNA进行CMA,关注DNA降解补偿。
检测方法
国际标准:
- ISCN2020国际细胞遗传学命名系统(核型分析规范)
- ISO15189:2012医学实验室质量和能力要求(质控流程)
- ISO17025:2017检测和校准实验室能力通用要求(设备校准)
- ACMGSFv3.0基因组变异解读指南(序列变异分类)
- GB/T39725-2020高通量测序技术规范(测序深度控制)
- GB/T37871-2019荧光原位杂交检测方法(探针杂交条件)
- GB/T34798-2017细胞遗传学检测通用要求(细胞培养标准)
- GB/T29475-2012产前筛查技术规范(风险计算算法)
检测设备
1.倒置荧光显微镜:NikonEclipseTi2-E(分辨率0.2μm,放大倍数1000x)
2.染色体扫描系统:MetaSystemsMetafer5(扫描速度≥50细胞/分钟,精度±1μm)
3.FISH工作站:AbbottStatSpinCytoFuge(离心力3000g,温度控制±0.5°C)
4.微阵列扫描仪:AgilentSureScanG4900DA(分辨率2μm,动态范围>10^4)
5.高通量测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量20Tb/run,错误率<0.1%)
6.实时定量PCR仪:RocheLightCycler480II(温控精度±0.1°C,通道数6)
7.细胞培养离心机:EppendorfCentrifuge5910R(转速范围100-15000rpm,容量4x100ml)
8.CO2培养箱:ThermoScientificHeracell150i(温度稳定性±0.1°C,CO2控制±0.1%)
9.核酸提取系统:QiagenQIAcubeHT(提取效率≥95%,通量96样本/批次)
10.生物分析仪:Agilent2100Bioanalyzer(DNA片段分析范围100bp-50kb,精度±5bp)
11.单细胞操作平台:FluidigmC1(单细胞捕获率≥85%,扩增偏差≤10%)
12.自动化移液系统:HamiltonMicrolabSTAR(精度±0.5μl,通量384孔)
13.低温存储箱:HaierDW-86L388(温度范围-86°C,稳定性±1°C)
14.凝胶成像系统:Bio-RadChemiDocMP(灵敏度0.1pgDNA,分辨率4.2MP)
15.生物安全柜:EscoAirstreamAC2-4S1(气流速度0.45m/s,过滤效率99.99%)