核酸样品污染测试

核酸样品污染测试是分子生物学实验质量控制的关键环节,重点检测外源核酸残留、酶污染、化学杂质及样品完整性。核心参数包括纯度比值(A260/A280)、浓度偏差、完整性指数(RIN)及特异性污染物(如RNase活性),确保样品符合下游应用如PCR、测序的严格要求。

原创阅读 02025-08-27工程师CMACNASISO高新技术企业

检测项目

1.外源DNA污染浓度:检测限≤0.01ng/μL,定量范围0.01-100ng/μL

2.RNA完整性数(RIN):评估值≥7.0,降解阈值≤5.0

3.蛋白质污染比率:A260/A280比值1.8-2.0,偏差允许±0.1

4.化学残留乙醇含量:浓度≤0.1%,气相色谱检测精度±0.01%

5.RNase酶活性检测:阴性结果要求,灵敏度0.001U/mL

6.颗粒物污染计数:粒径≥0.2μm,最大允许值≤100particles/mL

7.微生物污染水平:菌落形成单位≤10CFU/mL,厌氧菌检测included

8.pH值稳定性:范围7.0-8.0,测量精度±0.1pH单位

9.电泳纯度评估:条带清晰度无降解,smear指数≤10%

10.核酸浓度准确度:相对偏差±5%,绝对浓度范围5-5000ng/μL

11.荧光染料干扰测试:背景荧光值≤100RFU,激发波长485nm

12.金属离子残留:铁离子≤0.1ppm,镁离子≤1.0ppm,ICP-MS检测

检测范围

1.基因组DNA样品:来源于血液、组织,浓度范围10-200ng/μL

2.质粒DNA提取物:超螺旋比例≥90%,宿主DNA污染≤1%

3.总RNA样品:完整性RIN≥8.0,适用于转录组分析

4.mRNA纯化产物:polyA尾enrichment效率≥95%,rRNA残留≤2%

5.cDNA合成产物:全长率≥80%,逆转录酶残留检测

6.PCR扩增产物:非特异性条带≤5%,引物二聚体control

7.核酸提取试剂盒输出:包括硅胶柱法、磁珠法,回收率≥85%

8.测序文库构建样品:适配器连接效率≥90%,insertsize偏差±10bp

9.病毒核酸样品:如SARS-CoV-2RNA,检测限≤10copies/μL

10.细胞培养衍生核酸:避免培养基成分污染,FBS残留≤0.01%

11.环境样本核酸:土壤、水体提取,humicacid抑制物检测

12.临床样本核酸:FFPE组织、唾液,focusondegradationandinhibitorpresence

检测方法

国际标准:

ISO20395:2019Biotechnology—Requirementsforevaluatingtheperformanceofquantificationmethodsfornucleicacids

ASTME2885-19JianCeGuideforMicrovolumeQuantificationofNucleicAcidsusingFluorescenceDetection

ISO20184-1:2018Molecularbiomarkeranalysis—Nucleicacidextraction—Part1:Generalrequirements

ASTME3133-18JianCePracticeforDeterminingDetectionLimitsinNucleicAcidAmplificationTechniques

ISO22174:2005Microbiologyoffoodandanimalfeedingstuffs—Polymerasechainreaction(PCR)forthedetectionoffood-bornepathogens

ISO17822:2020Invitrodiagnosticsystems—Nucleicacidamplification-basedexaminationproceduresfordetectionandidentificationofmicrobialpathogens

ASTME1873-21JianCeGuideforDetectionofNucleicAcidSequencesbythePolymeraseChainReactionTechnique

ISO13073-1:2012Shipsandmarinetechnology—Riskassessmentforbiocontamination—Part1:Generalprinciples

ASTME3022-18JianCeGuideforNucleicAcidSequencingforMicrobialIdentificationandStrainTyping

ISO15189:2022Medicallaboratories—Requirementsforqualityandcompetence

国家标准:

GB/T34796-2017核酸纯度检测方法紫外分光光度法

GB/T37871-2019核酸检测试剂盒质量评价通则

GB/T37872-2019核酸提取纯化试剂盒性能要求

GB/T30989-2014测序用DNA文库构建试剂盒通用技术要求

GB/T37873-2019病原微生物核酸测序数据分析流程

GB/T34797-2017核酸浓度测定荧光染料法

GB/T37874-2019核酸样品中残留酶活性检测方法

GB/T37875-2019微生物核酸污染控制规范

GB/T37876-2019核酸测序数据质量评价指南

GB/T37877-2019临床样本核酸提取物质量要求

检测设备

1.紫外-可见分光光度计:型号UV-Pro-2600,波长范围190-800nm,A260/A280测量精度±0.01

2.荧光定量PCR仪:型号qPCR-Expert-96,温度控制精度±0.1°C,检测通道4-6个

3.超微量核酸分析仪:型号NanoCheck-100,样品体积0.5-2μL,浓度范围2-15000ng/μL

4.电泳系统:型号GelImage-3000,紫外透射波长302nm,图像分辨率1280x1024像素

5.颗粒计数器:型号ParticleScan-200,粒径检测范围0.1-10μm,计数精度±5%

6.微生物快速检测系统:型号MicroFast-50,ATP生物荧光法,检测限1CFU/mL

7.电感耦合等离子体质谱仪:型号ICP-MS-Nexus,元素检测下限0.1ppb,用于金属离子残留

8.pH计:型号pH-Precision-700,测量范围0-14,精度±0.01pH

9.酶标仪:型号PlateReader-480,波长范围400-700nm,读板速度10秒/96孔

10.高速离心机:型号CentriMax-5000,最大转速5000rpm,温度控制4-40°C

北检(北京)检测技术研究院【简称:北检院】

  • 报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
  • 检测周期:7~15工作日,可加急。
  • 资质:旗下实验室拥有CMA/CNAS/ISO资质。
  • 标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
  • 非标测试:支持定制化试验方案。
  • 售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

QUALIFICATIONS

旗下实验室 · 资质荣誉

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