核酸样品降解控制检测

核酸样品降解控制检测是评估生物样本质量的核心环节,专注于完整性、纯度和降解程度的量化分析。关键检测要点包括电泳迁移率、吸光度比值、片段分布和酶残留检测,确保样本适用于下游分子生物学应用,如PCR、测序和克隆。

原创阅读 02025-08-28工程师CMACNASISO高新技术企业

检测项目

1.核酸完整性指数(RIN值):评估RNA降解程度,RIN值范围1-10.理想值≥7.0.偏差允许±0.5

2.260/280吸光度比:测定核酸纯度,标准值1.8-2.0.蛋白质污染阈值≤1.7或≥2.2

3.260/230吸光度比:检测盐类或有机溶剂残留,合格范围2.0-2.4.下限警戒值1.5

4.总核酸浓度:使用紫外分光光度法,浓度测量精度±5ng/μL,线性范围10-1000ng/μL

5.降解产物百分比:通过电泳分析,降解片段占比≤10%,完整条带强度比率≥80%

6.片段大小分布:评估DNA或RNA片段长度,主带大小公差±50bp,小片段(<200bp)含量≤15%

7.酶活性残留检测:测定RNase或DNase活性,活性单位≤0.01U/μL,抑制率≥95%

8.pH值测定:样品pH范围7.0-8.5.允许偏差±0.3.极端值(pH<6.5或>9.0)视为不合格

9.电泳迁移率:分析核酸在凝胶中的迁移距离,迁移率相对标准偏差≤5%

10.热稳定性测试:加热至95°C并冷却,回收率≥90%,降解增量≤5%

11.荧光染料结合效率:用于定量PCR,结合效率≥98%,荧光信号偏差±2%

12.氧化损伤标记:检测8-oxo-dG等氧化产物,含量≤0.1%,使用HPLC-MS/MS法

13.微生物污染检测:通过qPCR测定细菌16SrRNA,拷贝数≤10³/μL,无特异性扩增

14.储存稳定性评估:-80°C储存30天,降解率≤5%,浓度变化±10%

15.离心沉淀物分析:离心后沉淀物重量≤0.1mg,悬浮液浊度OD600≤0.05

检测范围

1.基因组DNA样品:来源于人类、动物或植物组织,浓度范围50-500ng/μL,用于测序和PCR

2.总RNA样品:从细胞或血液中提取,RIN值≥7.0.适用于转录组分析

3.质粒DNA:超螺旋形式占比≥90%,用于克隆和转染实验

4.cDNA文库:合成自mRNA,片段大小1-5kb,用于高通量测序

5.PCR产物:扩增片段大小100-1000bp,纯化后浓度≥20ng/μL

6.细胞裂解液:包含粗提核酸,蛋白残留≤0.1mg/mL,用于快速检测

7.组织提取物:从福尔马林固定石蜡包埋组织中提取,降解控制RIN值≥5.0

8.血液样本DNA:抗凝血提取,浓度≥30ng/μL,血红蛋白污染OD414≤0.1

9.环境样本DNA:土壤或水样提取,微生物DNA占比≥70%,抑制剂含量≤5%

10.病毒RNA样品:如SARS-CoV-2RNA,浓度≥10copies/μL,用于诊断试剂开发

11.线粒体DNA:分离自细胞器,纯度A260/A280≥1.9.用于遗传病研究

12.合成寡核苷酸:长度20-100nt,纯度≥95%,用于探针或引物

13.FFPE样本核酸:脱蜡后提取,降解允许RIN值≥3.0.用于archival研究

14.唾液DNA样品:无创收集,浓度≥15ng/μL,细菌DNA污染≤10%

15.植物多糖污染样品:如作物提取物,多糖去除率≥99%,核酸回收率≥80%

检测方法

国际标准:

ISO20395:2019Biotechnology—Requirementsforevaluatingtheperformanceofquantificationmethodsfornucleicacidtargetsequences

ASTME2885-13JianCeGuideforRNAIntegrityAssessmentUsingElectrophoresis

ISO20186-1:2019Molecularinvitrodiagnosticexaminations—Specificationsforpre-examinationprocessesforvenouswholeblood—Part1:IsolatedcellularRNA

ASTME3133-18JianCePracticeforDeterminingDetectionLimitsandQuantitationLimitsinNucleicAcidTesting

ISO22174:2005Microbiologyoffoodandanimalfeedingstuffs—Polymerasechainreaction(PCR)forthedetectionoffood-bornepathogens—Generalrequirementsanddefinitions

ASTME2930-13JianCeGuideforAnalysisofNucleicAcidsUsingChromatography

ISO17822:2020Invitrodiagnosticmedicaldevices—Qualitativenucleicacid-basedtestingfordetectionandidentificationofmicrobialpathogens—Requirementsforpre-examinationprocesses

ASTME3134-18JianCeTestMethodforDeterminingtheIntegrityofDNAandRNAinBiologicalSamples

ISO20184-1:2018Molecularinvitrodiagnosticexaminations—Specificationsforpre-examinationprocessesforfrozentissue—Part1:IsolatedRNA

ASTME3182-18JianCePracticeforQualityAssuranceofNucleicAcidTestingforInfectiousDiseases

国家标准:

GB/T34796-2017核酸纯度和浓度测定方法紫外分光光度法

GB/T37872-2019生物样本中核酸提取纯化方法通则

GB/T38733-2020高通量测序用核酸样品质量要求

GB/T39100-2020分子诊断试剂盒核酸提取和纯化性能评价

GB/T37873-2019病原微生物核酸检测通用要求

GB/T38734-2020细胞和组织中RNA完整性检测方法

GB/T39101-2020合成寡核苷酸纯度及序列验证方法

GB/T37874-2019DNA甲基化检测方法通则

GB/T38735-2020环境样本微生物核酸提取和检测规范

GB/T39102-2020核酸样品储存和运输条件

检测设备

1.紫外可见分光光度计:型号ND-2000.功能:测量吸光度比值和核酸浓度,波长范围190-840nm,精度±0.001Abs

2.微流体电泳系统:型号BA-2100.功能:分析核酸完整性和片段分布,分辨率可达1bp,样本量1μL

3.实时荧光定量PCR仪:型号qPCR-7500.功能:检测降解产物和污染,动态范围10¹-10¹⁰拷贝,温度控制精度±0.1°C

4.高速冷冻离心机:型号CF-5804R.功能:分离核酸和去除沉淀,最大转速20000rpm,温度控制-20°C至40°C

5.酶标仪:型号MS-GO.功能:高通量吸光度测量,支持96孔板,检测速度10秒/板

6.自动化核酸提取仪:型号EX-M48.功能:处理多种样本类型,通量1-96样本,提取效率≥95%

7.热循环仪:型号TC-9700.功能:进行温度稳定性测试,温度范围4°C-99°C,梯度温差±0.5°C

8.pH计:型号PH-700.功能:精确测量样品pH,分辨率0.01pH,自动温度补偿

9.凝胶成像系统:型号GD-XR+.功能:可视化电泳结果,灵敏度0.1ng核酸,图像分析软件集成

10.HPLC-MS/MS系统:型号LCMS-8050.功能:检测氧化损伤标记,质量精度±0.1Da,流速范围0.1-2.0mL/min

北检(北京)检测技术研究院【简称:北检院】

  • 报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
  • 检测周期:7~15工作日,可加急。
  • 资质:旗下实验室拥有CMA/CNAS/ISO资质。
  • 标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
  • 非标测试:支持定制化试验方案。
  • 售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

QUALIFICATIONS

旗下实验室 · 资质荣誉

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