核酸样品降解控制检测

检测项目

1.核酸完整性指数（RIN值）：评估RNA降解程度，RIN值范围1-10.理想值≥7.0.偏差允许±0.5

2.260/280吸光度比：测定核酸纯度，标准值1.8-2.0.蛋白质污染阈值≤1.7或≥2.2

3.260/230吸光度比：检测盐类或有机溶剂残留，合格范围2.0-2.4.下限警戒值1.5

4.总核酸浓度：使用紫外分光光度法，浓度测量精度±5ng/μL，线性范围10-1000ng/μL

5.降解产物百分比：通过电泳分析，降解片段占比≤10%，完整条带强度比率≥80%

6.片段大小分布：评估DNA或RNA片段长度，主带大小公差±50bp，小片段（<200bp）含量≤15%

7.酶活性残留检测：测定RNase或DNase活性，活性单位≤0.01U/μL，抑制率≥95%

8.pH值测定：样品pH范围7.0-8.5.允许偏差±0.3.极端值（pH<6.5或>9.0）视为不合格

9.电泳迁移率：分析核酸在凝胶中的迁移距离，迁移率相对标准偏差≤5%

10.热稳定性测试：加热至95°C并冷却，回收率≥90%，降解增量≤5%

11.荧光染料结合效率：用于定量PCR，结合效率≥98%，荧光信号偏差±2%

12.氧化损伤标记：检测8-oxo-dG等氧化产物，含量≤0.1%，使用HPLC-MS/MS法

13.微生物污染检测：通过qPCR测定细菌16SrRNA，拷贝数≤10³/μL，无特异性扩增

14.储存稳定性评估：-80°C储存30天，降解率≤5%，浓度变化±10%

15.离心沉淀物分析：离心后沉淀物重量≤0.1mg，悬浮液浊度OD600≤0.05

检测范围

1.基因组DNA样品：来源于人类、动物或植物组织，浓度范围50-500ng/μL，用于测序和PCR

2.总RNA样品：从细胞或血液中提取，RIN值≥7.0.适用于转录组分析

3.质粒DNA：超螺旋形式占比≥90%，用于克隆和转染实验

4.cDNA文库：合成自mRNA，片段大小1-5kb，用于高通量测序

5.PCR产物：扩增片段大小100-1000bp，纯化后浓度≥20ng/μL

6.细胞裂解液：包含粗提核酸，蛋白残留≤0.1mg/mL，用于快速检测

7.组织提取物：从福尔马林固定石蜡包埋组织中提取，降解控制RIN值≥5.0

8.血液样本DNA：抗凝血提取，浓度≥30ng/μL，血红蛋白污染OD414≤0.1

9.环境样本DNA：土壤或水样提取，微生物DNA占比≥70%，抑制剂含量≤5%

10.病毒RNA样品：如SARS-CoV-2RNA，浓度≥10copies/μL，用于诊断试剂开发

11.线粒体DNA：分离自细胞器，纯度A260/A280≥1.9.用于遗传病研究

12.合成寡核苷酸：长度20-100nt，纯度≥95%，用于探针或引物

13.FFPE样本核酸：脱蜡后提取，降解允许RIN值≥3.0.用于archival研究

14.唾液DNA样品：无创收集，浓度≥15ng/μL，细菌DNA污染≤10%

15.植物多糖污染样品：如作物提取物，多糖去除率≥99%，核酸回收率≥80%

检测方法

国际标准：

ISO20395:2019Biotechnology—Requirementsforevaluatingtheperformanceofquantificationmethodsfornucleicacidtargetsequences

ASTME2885-13JianCeGuideforRNAIntegrityAssessmentUsingElectrophoresis

ISO20186-1:2019Molecularinvitrodiagnosticexaminations—Specificationsforpre-examinationprocessesforvenouswholeblood—Part1:IsolatedcellularRNA

ASTME3133-18JianCePracticeforDeterminingDetectionLimitsandQuantitationLimitsinNucleicAcidTesting

ISO22174:2005Microbiologyoffoodandanimalfeedingstuffs—Polymerasechainreaction(PCR)forthedetectionoffood-bornepathogens—Generalrequirementsanddefinitions

ASTME2930-13JianCeGuideforAnalysisofNucleicAcidsUsingChromatography

ISO17822:2020Invitrodiagnosticmedicaldevices—Qualitativenucleicacid-basedtestingfordetectionandidentificationofmicrobialpathogens—Requirementsforpre-examinationprocesses

ASTME3134-18JianCeTestMethodforDeterminingtheIntegrityofDNAandRNAinBiologicalSamples

ISO20184-1:2018Molecularinvitrodiagnosticexaminations—Specificationsforpre-examinationprocessesforfrozentissue—Part1:IsolatedRNA

ASTME3182-18JianCePracticeforQualityAssuranceofNucleicAcidTestingforInfectiousDiseases

国家标准：

GB/T34796-2017核酸纯度和浓度测定方法紫外分光光度法

GB/T37872-2019生物样本中核酸提取纯化方法通则

GB/T38733-2020高通量测序用核酸样品质量要求

GB/T39100-2020分子诊断试剂盒核酸提取和纯化性能评价

GB/T37873-2019病原微生物核酸检测通用要求

GB/T38734-2020细胞和组织中RNA完整性检测方法

GB/T39101-2020合成寡核苷酸纯度及序列验证方法

GB/T37874-2019DNA甲基化检测方法通则

GB/T38735-2020环境样本微生物核酸提取和检测规范

GB/T39102-2020核酸样品储存和运输条件

检测设备

1.紫外可见分光光度计：型号ND-2000.功能：测量吸光度比值和核酸浓度，波长范围190-840nm，精度±0.001Abs

2.微流体电泳系统：型号BA-2100.功能：分析核酸完整性和片段分布，分辨率可达1bp，样本量1μL

3.实时荧光定量PCR仪：型号qPCR-7500.功能：检测降解产物和污染，动态范围10¹-10¹⁰拷贝，温度控制精度±0.1°C

4.高速冷冻离心机：型号CF-5804R.功能：分离核酸和去除沉淀，最大转速20000rpm，温度控制-20°C至40°C

5.酶标仪：型号MS-GO.功能：高通量吸光度测量，支持96孔板，检测速度10秒/板

6.自动化核酸提取仪：型号EX-M48.功能：处理多种样本类型，通量1-96样本，提取效率≥95%

7.热循环仪：型号TC-9700.功能：进行温度稳定性测试，温度范围4°C-99°C，梯度温差±0.5°C

8.pH计：型号PH-700.功能：精确测量样品pH，分辨率0.01pH，自动温度补偿

9.凝胶成像系统：型号GD-XR+.功能：可视化电泳结果，灵敏度0.1ng核酸，图像分析软件集成

10.HPLC-MS/MS系统：型号LCMS-8050.功能：检测氧化损伤标记，质量精度±0.1Da，流速范围0.1-2.0mL/min

北检(北京)检测技术研究院【简称：北检院】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。

以上是与"核酸样品降解控制检测"相关的简单介绍，具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检检测技术研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。