检测项目

1. 供体粪便宏基因组耐药基因谱分析：全面筛查与鉴定细菌、古菌等微生物携带的各类耐药基因。

2. 核心耐药基因靶向定量检测：对碳青霉烯酶基因、超广谱β-内酰胺酶基因、万古霉素耐药基因等进行绝对定量分析。

3. 可移动遗传元件关联分析：检测耐药基因与质粒、整合子、转座子等可移动元件的共存与关联情况。

4. 多重耐药菌株筛查：基于基因组数据推断可能携带多重耐药基因的病原菌或条件致病菌。

5. 移植前供体菌液耐药基因检测：对制备完成的粪菌移植悬液进行终产品耐药基因负荷评估。

6. 移植后受体监测：追踪受体在接受移植后肠道菌群中特定耐药基因的动态变化。

7. 耐药基因丰度与多样性分析：计算样本中耐药基因的相对丰度、绝对拷贝数及基因型多样性指数。

8. 潜在病原体与耐药基因共现分析：分析特定耐药基因与已知肠道病原体或条件致病菌基因组的相关性。

9. 新型或罕见耐药基因挖掘：通过比对专业数据库，识别未知或罕见的耐药基因变异。

10. 抗生素抗性基因环境风险评估：综合评估供体样本所携带的耐药基因库的整体传播风险等级。

检测范围

健康供体初筛粪便样本、临床合格供体常规粪便样本、粪菌移植前供体粪便样本、粪菌移植制备用菌液、粪菌移植胶囊内容物、移植前受体基线粪便样本、移植后不同时间点受体随访粪便样本、模拟消化过程样本、菌群培养上清液、移植相关环境拭子样本

检测设备

1. 高通量测序平台：用于对样本微生物基因组进行深度测序，以无偏倚地发掘所有潜在的耐药基因序列。

2. 实时荧光定量聚合酶链式反应仪：对已知的关键耐药基因靶点进行高灵敏度、高特异性的绝对或相对定量分析。

3. 自动化核酸提取工作站：实现粪便等复杂样本中微生物基因组核酸的高通量、标准化提取与纯化。

4. 生物信息学分析服务器：运行专业分析流程与数据库，处理海量测序数据，完成耐药基因的鉴定、注释与统计分析。

5. 琼脂糖凝胶电泳系统：用于常规聚合酶链式反应产物的定性分析与大小确认。

6. 超微量核酸蛋白测定仪：精确测定提取后的核酸浓度与纯度，确保下游检测质量。

7. 高速低温离心机：用于样本预处理、核酸沉淀等实验步骤中的快速分离。

8. 恒温金属浴或干式恒温器：为酶反应等需要精确控温的实验步骤提供稳定的温度环境。

9. 生物安全柜：为涉及潜在生物传染性样本的操作提供无菌安全的工作环境。

10. 超低温冰箱：长期保存珍贵的核酸样本、菌株样本及测序文库，确保生物材料的稳定性。