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DNA甲基化检测

  • 原创官网
  • 2025-08-12 08:51:42
  • 关键字:北检研究院,DNA甲基化检测

相关:

概述:DNA甲基化检测聚焦于基因组中胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤(CpG)位点的甲基化修饰分析,核心检测对象包括全局甲基化水平、CpG岛甲基化状态及特异性甲基化位点。关键项目涵盖全基因组甲基化扫描、差异甲基化区域(DMRs)识别和甲基化百分比定量,应用于表观遗传调控、疾病标志物筛查等,采用高通量测序和芯片技术确保精确度≥99%。

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注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).

因篇幅原因,CMA/CNAS证书以及未列出的项目/样品,请咨询在线工程师。

☌ 询价

检测项目

基因组全局甲基化检测:

  • 全基因组甲基化扫描:甲基化密度(覆盖度≥98%)、平均甲基化率(0-100%)
  • 5-甲基胞嘧啶含量测定:总甲基化百分比(精度±1%,参照ENCODE标准)
位点特异性甲基化检测:
  • CpG位点甲基化分析:甲基化状态(二元值,0/1)、甲基化频率(0%-100%)
  • 差异甲基化区域识别:甲基化差异值(log2FC≥1.5)、DMR长度(≥100bp)
CpG岛甲基化分析:
  • CpG岛覆盖率:岛内甲基化比例(≥80%覆盖)、岛边界甲基化梯度
  • 启动子甲基化定量:甲基化抑制指数(0-1,参照UCSC数据库)
基因特异性甲基化检测:
  • 肿瘤抑制基因甲基化:甲基化水平阈值(≥30%为高甲基化)、位点一致性
  • 印记基因甲基化:父源/母源甲基化差异(Δ值≥0.2)
甲基化等位基因分析:
  • 等位基因特异性甲基化:甲基化等位频率(MAF≥0.1)、杂合性平衡
  • 单倍型甲基化检测:连锁甲基化块大小(≥5kb)
甲基化动态监测:
  • 时间序列甲基化变化:甲基化变化率(Δ%perday)、稳定性指数
  • 环境响应甲基化:诱导甲基化水平(响应因子≥2-fold)
甲基化与表达关联:
  • 基因表达抑制分析:甲基化-表达负相关度(r≤-0.7)、阈值检测
  • 增强子甲基化影响:增强子活性评分(0-10)
甲基化质量控制:
  • DNA完整性验证:片段大小分布(峰高≥50FU)、降解指数
  • 批次效应校正:批次变异系数(CV≤5%)
甲基化生物标志物筛选:
  • 疾病特异性甲基化标志:AUC值(≥0.85)、敏感度/特异度
  • 甲基化年龄预测:表观遗传时钟偏差(±2年)
甲基化数据处理:
  • 甲基化数据归一化:β值转换(0-1范围)、批次校正效率
  • 甲基化信号去噪:信噪比(SNR≥20dB)

检测范围

1.全血DNA样本:外周血白细胞DNA,重点检测全基因组甲基化图谱及循环肿瘤DNA甲基化标志

2.福尔马林固定石蜡包埋组织:FFPE组织DNA,侧重位点特异性甲基化恢复及降解DNA补偿检测

3.唾液DNA样本:口腔上皮细胞DNA,关注CpG岛甲基化变异及非侵入性筛查应用

4.细胞系DNA:培养细胞DNA,强调甲基化稳定性测试及传代甲基化漂移监测

5.新鲜冷冻组织:手术标本DNA,聚焦高分辨率甲基化扫描及肿瘤微环境分析

6.血浆游离DNA:cfDNA样本,检测低丰度甲基化信号及胎儿或肿瘤起源甲基化追踪

7.植物组织DNA:作物或模式植物DNA,重点在环境胁迫响应甲基化及转基因甲基化印记

8.微生物群落DNA:宏基因组样本,分析共生微生物甲基化模式及宿主-微生物互作

9.法医样本DNA:陈旧或微量DNA,侧重甲基化个体识别及组织来源推断

10.干细胞DNA:多能干细胞DNA,检测分化过程甲基化重置及表观遗传记忆

检测方法

国际标准:

  • ISO20395:2021高通量甲基化测序规范(覆盖深度≥30x)
  • ENCODEMethylC-seqProtocol全基因组亚硫酸氢盐测序(分辨率单碱基)
国家标准:
  • GB/T30988-2014DNA甲基化检测方法(基于亚硫酸氢盐转化)
  • GB/T37872-2019甲基化芯片分析指南(芯片探针密度≥850K)
方法差异说明:亚硫酸氢盐测序与芯片法在分辨率上差异显著(单碱基vs预定位点),国际标准强调深度覆盖,而国标侧重转化效率控制(≥95%效率要求),此外PCR扩增偏差在qMSP方法中需额外校准(国际标准使用数字PCR避免此问题)

检测设备

1.高通量测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量20Breads/run,精度99.9%)

2.甲基化芯片扫描仪:InfiniumMethylationEPIC(探针数>850,000,动态范围0-1)

3.亚硫酸氢盐处理系统:EZDNAMethylationKit(转化率≥98%,温度控制±0.5°C)

4.实时定量PCR仪:QuantStudio7Pro(检测限0.1%,循环数40)

5.焦磷酸测序仪:PyroMarkQ24(甲基化定量精度±2%,读长100bp)

6.显微切割系统:LeicaLMD700(组织定位精度5μm,DNA回收率≥80%)

7.DNA片段分析仪:AgilentBioanalyzer(片段大小检测范围35-7000bp,CV≤3%)

8.甲基化特异性电泳仪:QIAxcelAdvanced(甲基化敏感酶切分辨率1bp)

9.数字PCR系统:QX200(绝对甲基化拷贝数检测,精度0.001%)

10.自动化核酸提取仪:KingFisherFlex(样本通量96/run,DNA纯度A260/A280≥1.8)

11.甲基化数据服务器:High-PerformanceComputingCluster(运算速度1TFLOPS,存储100TB)

12.荧光显微镜:NikonEclipse(甲基化原位杂交灵敏度单细胞)

13.液相色谱仪:ThermoUltiMate(5-mC定量检测限0.01%)

14.微量分光光度计:NanoDropOne(DNA浓度测量范围2-3700ng/μl)

15.冷冻离心机:Eppendorf5430(转速30,000rpm,温度控制-20°C±1°C)

北检(北京)检测技术研究院【简称:北检院】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

以上是与"DNA甲基化检测"相关的简单介绍,具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。

    材料检测服务

    专业分析各类金属、非金属材料的成分、结构与性能,提供全面检测报告和解决方案。包括金属材料力学性能测试、高分子材料老化试验、复合材料界面分析等。

    化工产品分析

    精准检测各类化工产品的成分、纯度及物理化学性质,确保产品质量符合国家标准。服务涵盖有机溶剂分析、催化剂表征、高分子材料分子量测定等。

    环境检测服务

    提供土壤、水质、气体等环境检测服务,助力环境保护与污染治理,共建绿色家园。包括VOCs检测、重金属污染分析、水质生物毒性测试等。

    科研检测认证

    凭借专业团队和先进设备,致力于为企业研发、质量控制及市场准入提供精准可靠的技术支撑,助力品质提升与合规发展。