表观遗传修饰分析

检测项目

1.DNA甲基化水平检测：全基因组甲基化扫描，CpG岛甲基化百分比0-100%，检测下限0.1%

2.组蛋白乙酰化程度分析：聚焦H3K9ac、H3K14ac位点，乙酰化丰度测量范围0.1-100nmol/mg

3.组蛋白甲基化定量：检测H3K4me3、H3K27me3等修饰，丰度精度±0.05pmol/μg

4.DNA羟甲基化检测：5-hmC含量测定，线性范围0.01-10ng/μL，回收率≥95%

5.染色质可及性评估：ATAC-seq分析开放区域，测序深度≥30Mreads，分辨率±50bp

6.非编码RNA表达profiling：miRNA、lncRNA定量，表达量检测下限0.1copies/μL

7.蛋白质-DNA相互作用检测：ChIP-seq用于转录因子结合，抗体效率≥90%，信噪比≥10:1

8.RNA修饰分析：m6A甲基化检测，修饰位点识别精度±1nt，覆盖率≥95%

9.表观遗传时钟计算：基于甲基化年龄预测，误差范围±2years，相关性R²≥0.95

10.表观遗传变异筛查：群体多态性分析，变异频率检测下限0.5%，测序错误率≤0.1%

11.组蛋白磷酸化检测：测量H3S10ph等位点，磷酸化水平范围0.01-100pmol/mg

12.全基因组表观遗传图谱：整合多组学数据，分辨率至单碱基水平，重复性CV≤5%

检测范围

1.人类外周血样本：用于疾病biomarker发现，样本量≥1mL，DNA完整性指数≥7

2.肿瘤组织切片：福尔马林固定石蜡包埋组织，厚度5-10μm，肿瘤细胞占比≥70%

3.细胞系培养物：包括HEK293、HeLa等，传代次数≤20，活力≥95%

4.植物组织样本：如拟南芥叶片，新鲜重量≥100mg，无降解

5.动物模型组织：小鼠脑、肝组织，取样后-80°C保存，RNAintegritynumber≥8

6.唾液样本：无创收集，体积≥0.5mL，细菌污染≤1%

7.尿液样本：用于表观遗传标志物监测，离心后上清，蛋白含量≤0.1mg/mL

8.法医样本：陈旧血液或组织，用于年龄估计，DNA浓度≥0.1ng/μL

9.环境微生物样本：土壤或水体提取DNA，宏表观遗传分析，物种多样性指数≥2

10.药物处理样本：表观遗传药物效应测试，处理时间24-72h，浓度梯度0.1-100μM

11.干细胞样本：多能干细胞表观状态评估，多能性标志物表达≥80%

12.胚胎发育样本：早期胚胎组织，关注印记基因修饰，取样时间点精确至小时级

检测方法

国际标准：

ISO20395:2019生物技术-核酸测序方法验证要求

EN15634:2010食品检测-分子生物学方法验证

ASTME3027-18表观遗传学检测方法标准指南

ISO20166:2018分子体外诊断检验-测序性能评估

ENISO15189:2022医学实验室-质量和能力要求

ASTME3130-18高通量测序数据质量控制

ISO23118:2021蛋白质组学-质谱分析方法

EN12687:1998生物技术-修饰生物体检测

ISO20184:2018冷冻组织样本处理规范

ASTME3231-19染色质免疫沉淀实验标准

国家标准：

GB/T34796-2017核酸定量测序方法通则

GB/T37872-2019生物样本中DNA甲基化检测方法

GB/T39100-2020组蛋白修饰检测技术规范

GB/T38506-2020实时荧光定量PCR方法

GB/T37871-2019微生物基因组测序方法

GB/T34797-2017RNA测序文库构建规范

GB/T39101-2020表观遗传学数据分析和报告

GB/T38507-2020细胞染色质可及性检测方法

GB/T37873-2019生物样本库质量和控制

GB/T39102-2020非编码RNA表达检测技术

检测设备

1.高通量测序仪：型号NovaSeq-6000，功能全基因组测序，通量最高6Tb/run，读长2x150bp

2.质谱仪：型号Orbitrap-Fusion，功能组蛋白修饰分析，质量精度≤1ppm，分辨率≥500,000

3.液相色谱仪：型号LC-1260，功能核酸和蛋白质分离，流速范围0.1-10mL/min，压力上限600bar

4.实时PCR系统：型号QuantStudio-7，功能基因表达定量，动态范围10^7，温度均匀性±0.1°C

5.流式细胞仪：型号CytoFLEX，功能细胞表型分析，检测通道≥13，灵敏度≤100MESF

6.微阵列扫描仪：型号ArrayScan-GT，功能芯片检测，分辨率5μm，扫描速度≤10min/slide

7.生物分析仪：型号BioAnalyzer-2100，功能核酸质量检测，样本量1-12μL，DNAintegrity评分范围1-10

8.紫外分光光度计：型号NanoDrop-One，功能核酸浓度测量，波长范围190-850nm，精度±1ng/μL

9.冷冻离心机：型号Centrifuge-5800，功能样本预处理，最大转速5800rpm，温度控制-20°C至40°C

10.自动化液体处理系统：型号LiquidHandler-200，功能高通量样本制备，通量≥96样本/run，移液精度±0.5%

北检(北京)检测技术研究院【简称：北检院】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。

以上是与"表观遗传修饰分析"相关的简单介绍，具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检检测技术研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。