肠道菌群检测

检测项目

细菌丰度：测量特定属水平丰度百分比，精度±0.1%，范围0-100%

多样性指数：计算香农指数或辛普森指数，分辨率0.01，范围0-10

病原体检测：筛查大肠杆菌、沙门氏菌等，检出限<100CFU/g，置信度99%

功能基因分析：识别抗生素耐药基因，覆盖200+基因，灵敏度0.01%丰度

短链脂肪酸浓度：测定乙酸、丙酸、丁酸，检测下限1μM，线性范围0-100mM

菌群结构分类：门、纲、目、科、属水平划分，准确率>99%，基于16SrRNA

肠道屏障标志物：检测脂多糖结合蛋白，定量范围0.1-100ng/mL，误差±2%

益生菌数量：乳酸杆菌、双歧杆菌计数，标准偏差±5%，单位CFU/mL

代谢产物谱：丁酸盐、丙酸盐等分析，HPLC法，动态范围0.01-10μM

病毒组多样性：肠道病毒丰度评估，阈值0.001%，覆盖率95%

真菌群落分析：念珠菌属比例检测，精度±0.05%，范围0-50%

古菌丰度：产甲烷古菌定量，检出限0.01%，方法特异性99%

炎症因子水平：IL-6、TNF-α测量，ELISA法，灵敏度1pg/mL

菌群稳定性：时间序列变化评估，变异系数<5%，基于重复测试

噬菌体检测：特定细菌病毒识别，最低丰度0.001%，置信区间95%

检测范围

人类粪便样本：新鲜或-80°C冷冻保存，临床研究用途

肠道活检组织：内窥镜获取，黏膜微生物分析

动物模型粪便：小鼠、大鼠、猪等实验样本，疾病模型研究

益生菌补充剂：胶囊、粉末、液体形式，活菌计数验证

发酵食品：酸奶、泡菜、康普茶，微生物组成评估

环境样本：土壤、水体中肠道相关菌群，生态学研究

临床腹泻样本：患者粪便，病原体溯源诊断

婴儿粪便：新生儿肠道菌群发育监测，年龄分段

老年人粪便：老化过程菌群变化分析，队列研究

特殊饮食人群样本：素食者、高脂饮食者，营养干预评估

肠道内容物：手术直接采集，原位微生物分析

粪便DNA提取物：纯化核酸，宏基因组测序输入

母乳样本：婴儿菌群关联研究，乳成分分析

水处理系统：废水微生物检测，卫生标准验证

饲料添加剂：动物营养产品，菌群影响测试

检测方法

宏基因组测序：全基因组分析，依据ISO20395标准，错误率<0.1%

定量PCR：SYBRGreen法，执行GB/T37850-2019，循环数阈值精确

16SrRNA基因测序：V3-V4区域扩增，参照MiSeq协议，相似度>97%

代谢组学分析：液相色谱-质谱联用，符合ASTME1657，分辨率0.01Da

厌氧培养法：选择培养基培养，基于GB4789.3，培养时间24-48h

荧光原位杂交：特异性探针标记，采用ISO15216-1，显微镜观察

酶联免疫吸附试验：炎症标志物检测，依据GB/T40982-2021，吸光度读数

气相色谱法：短链脂肪酸定量，ASTMD5508标准，保留时间校准

流式细胞术：细菌绝对计数，ISO19344规范，荧光标记

生物信息学流程：QIIME2分析，参考标准流程，α多样性计算

高通量测序：Illumina平台，遵循ISO20395，覆盖深度30x

质谱成像：空间分布分析，ASTME3019，像素分辨率10μm

微滴数字PCR：绝对定量，GB/T37851-2019，分区精度高

培养组学：多条件培养，参考标准方法，生长曲线监测

纳米孔测序：实时分析，ISO20395兼容，读长>10kb

检测设备

IlluminaNovaSeq6000测序仪：高通量测序，通量20Breads/run，用于宏基因组

ThermoFisherQuantStudio7FlexqPCR系统：96孔实时定量，精度±0.1Cq

Agilent1290InfinityII液相色谱仪：代谢物分离，流速范围0.001-5mL/min

BDFACSCantoII流式细胞仪：细菌计数，多激光检测，速率10,000细胞/s

ShimadzuGC-2030气相色谱仪：短链脂肪酸分析，柱温控制±0.1°C

OlympusBX53荧光显微镜：FISH观察，放大倍数1000x，图像捕获

EppendorfCentrifuge5430离心机：样本预处理，最大转速15,000rpm

Bio-RadCFX96TouchqPCR仪：热循环控制，温度均匀性±0.2°C

NanodropOne分光光度计：DNA浓度测量，波长260nm，精度1ng/μL

CovarisM220超声破碎仪：DNA片段化，频率500kHz，片段大小控制

北检(北京)检测技术研究院【简称：北检院】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。

以上是与"肠道菌群检测"相关的简单介绍，具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。