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概述:全转录组测序试验是一种高通量测序技术,用于全面分析生物样本中的RNA转录本。核心检测对象包括总RNA质量、转录本丰度、基因表达水平差异及功能注释。关键项目涵盖RNA完整性评估(RIN≥7.0)、基因表达定量(FPKM/TPM值)、差异表达基因筛选(FDR<0.05)、可变剪接事件检测及融合基因分析。该方法基于标准化生物信息学流程,适用于疾病机制研究、药物靶点鉴定及精准医疗应用。
注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).
CMA/CNAS等证书详情,因时间等不可抗拒因素会发生变更,请咨询在线工程师。
样本质量控制:
1.人类组织样本:新鲜或冷冻组织样本,重点检测RNA完整性及癌症相关基因表达谱
2.血液样本:全血或外周血单核细胞样本,侧重低丰度转录本检测及免疫基因表达分析
3.细胞培养物:哺乳动物或原代细胞样本,重点RNA提取效率及细胞周期基因表达
4.动植物组织样本:植物叶片或动物器官样本,侧重物种特异性转录本注释及发育基因分析
5.微生物样本:细菌或真菌样本,重点病原体RNA检测及抗菌基因表达
6.FFPE样本:福尔马林固定石蜡包埋样本,侧重降解RNA修复及肿瘤标志物表达
7.液体活检样本:血浆或血清样本,重点循环RNA定量及早期诊断基因检测
8.环境样本:土壤或水体微生物样本,侧重宏转录组分析及功能基因富集
9.临床样本:病理活检或体液样本,侧重疾病分型基因表达及生物标志物验证
10.模式生物样本:小鼠或斑马鱼样本,重点比较基因组转录本及模型验证
国际标准:
1.RNA提取仪:QiagenQIAcubeHT(提取效率≥95%,通量96样本/批)
2.分光光度计:ThermoFisherNanoDrop8000(波长范围190-840nm,精度±0.001)
3.生物分析仪:Agilent2100Bioanalyzer(电泳分辨率0.1bp,RIN评估精度)
4.测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量最高6Tb,读取长度2x150bp)
5.PCR仪:Bio-RadT100(温控精度±0.1℃,循环数40)
6.离心机:Eppendorf5810R(转速最高15000rpm,容量4x100ml)
7.冷冻储存设备:ThermoScientificJianCeTFreezer(温度范围-86°C,稳定性±1°C)
8.生物信息学服务器:DellPowerEdgeR750(处理器128核,内存2TB)
9.自动化液体处理系统:HamiltonSTARlet(移液精度0.1μl,通量384孔板)
10.凝胶成像系统:Bio-RadChemiDocMP(检测限0.1pg,分辨率6.5百万像素)
11.恒温震荡器:NewBrunswickInnova44(震荡速度50-400rpm,温度范围4-80°C)
12.紫外分光仪:ShimadzuUV-2600(波长范围190-1100nm,带宽1nm)
13.电泳系统:Bio-RadMini-PROTEANTetra(电压范围10-500V,凝胶大小10x10cm)
14.数据存储设备:SeagateExosX20(容量20TB,传输速度250MB/s)
15.环境控制箱:PanasonicMCO-19AIC(湿度控制30-80%,CO2浓度5%)
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。
以上是与"全转录组测序试验"相关的简单介绍,具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。