miRNA表达测试

miRNA表达测试是一种用于量化微小RNA(miRNA)在生物样本中表达水平的技术检测。核心检测对象包括特定miRNA序列的表达量,关键项目涉及RNA提取质量控制(如浓度和纯度)、逆转录效率验证、实时荧光定量PCR(qPCR)扩增参数(如Ct值和扩增效率)、差异表达分析(如foldchange计算)以及特异性检测(如熔解曲线分析)。该测试适用于疾病生物标志物研究、基因调控机制分析,确保高灵敏度和重复性。

原创阅读 62025-07-11工程师CMACNASISO高新技术企业

检测项目

RNA提取质量控制:

  • RNA浓度:检测限2-15000ng/μl,纯度OD260/280比值1.8-2.0
  • RNA完整性:RIN值≥7.0(参照Agilent2100标准)
逆转录效率验证:
  • cDNA产量:定量范围5-500ng,效率偏差≤5%
  • 引物特异性:解链温度Tm值60-65°C
qPCR扩增检测:
  • Ct值:检测范围10-40循环,线性动态范围5logs
  • 扩增效率:90-110%,R²值≥0.98
特异性分析:
  • 熔解曲线分析:单峰检测,峰宽≤1°C
  • 非特异性扩增:阴性对照Ct值≥35
灵敏度评估:
  • 检测限LOD:1copy/μl,定量限LOQ:5copies/μl
  • 背景噪声:荧光信号强度≤100RFU
重复性测试:
  • 批内变异系数CV:≤5%,批间CV≤10%
  • 回收率:85-115%
标准曲线构建:
  • 斜率:-3.1至-3.6,截距范围-5至5
  • 线性范围:R²≥0.99
内参基因验证:
  • 表达稳定性:M值≤0.5,geNorm算法
  • 内参Ct值变异:SD≤0.5
差异表达计算:
  • foldchange:对数转换值|log2FC|≥1
  • p值:≤0.05,t检验或ANOVA
数据分析报告:
  • 相对表达量:ΔΔCt方法计算,单位foldchange
  • 质量控制参数:通过率≥95%

检测范围

1.人类血清样本:检测循环miRNA作为癌症生物标志物,重点评估样本稳定性和低丰度RNA提取

2.肿瘤组织样本:分析FFPE或新鲜组织中miRNA表达谱,侧重肿瘤特异性miRNA差异检测

3.细胞培养上清液:外泌体miRNA检测,强调外泌体分离纯化和表达一致性

4.脑脊液样本:神经疾病相关miRNA定量,重点处理低体积样本和高背景干扰

5.尿液样本:非侵入性miRNA检测,侧重尿液保存条件和抑制剂去除

6.全血样本:全血RNA中miRNA表达,重点红细胞裂解和RNA稳定性控制

7.福尔马林固定石蜡包埋组织:FFPE样本miRNA提取优化,检测重点为RNA碎片化补偿

8.植物组织样本:植物miRNA研究,侧重多酚和多糖干扰去除

9.动物模型样本:疾病模型miRNA表达分析,重点跨物种一致性验证

10.微生物样本:细菌或病毒miRNA检测,检测重点为高GC含量RNA处理

检测方法

国际标准:

  • MIQE2020实时荧光定量PCR实验最小信息指南(强调实验设计细节报告)
  • ISO20395-2019生物样本中核酸定量方法(侧重灵敏度验证)
国家标准:
  • GB/T30988-2014微小RNA检测技术规范(侧重临床样本处理)
  • GB/T37871-2019分子生物学检测通用要求(强调数据分析标准)
方法差异说明:MIQE指南要求完整实验参数报告,而GB/T30988-2014更注重样本前处理规范;ISO20395-2019设定检测限标准为1copy/μl,GB/T37871-2019允许5copies/μl定量限。

检测设备

1.分光光度计:Nanodrop2000(波长范围190-840nm,精度±0.001OD)

2.离心机:Eppendorf5424R(转速范围100-15000rpm,温度控制-10至40°C)

3.实时荧光定量PCR仪:Bio-RadCFX96(检测通道6个,温度精度±0.1°C)

4.热循环仪:AppliedBiosystemsVeriti(温度范围4-99°C,升温速率5°C/s)

5.电泳系统:Bio-RadPowerPacBasic(电压范围10-300V,电流0-400mA)

6.核酸提取仪:QIAcube(通量1-12样本,提取效率≥95%)

7.恒温培养箱:MemmertIN110(温度范围室温至60°C,稳定性±0.5°C)

8.超低温冰箱:ThermoScientificTSX(温度-86°C,容量700L)

9.移液器:EppendorfResearchplus(量程0.1-1000μl,精度±0.5%)

10.显微镜:OlympusBX53(放大倍数40-1000x,分辨率0.2μm)

11.外泌体分离系统:qEVoriginal(粒径分离范围50-200nm,回收率≥80%)

12.荧光显微镜:NikonEclipseTi(激发波长400-700nm,检测灵敏度0.1ng)

13.恒温混匀仪:EppendorfThermoMixer(转速300-1400rpm,温度4-99°C)

14.纯水系统:Milli-QIntegral(电阻率18.2MΩ·cm,TOC≤5ppb)

15.数据分析软件:CFXMaestro(算法支持ΔΔCt计算,兼容MIQE报告)

北检(北京)检测技术研究院【简称:北检院】

  • 报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
  • 检测周期:7~15工作日,可加急。
  • 资质:旗下实验室拥有CMA/CNAS/ISO资质。
  • 标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
  • 非标测试:支持定制化试验方案。
  • 售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

QUALIFICATIONS

旗下实验室 · 资质荣誉

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