检测项目
RNA提取质量控制:
- RNA浓度:检测限2-15000ng/μl,纯度OD260/280比值1.8-2.0
- RNA完整性:RIN值≥7.0(参照Agilent2100标准)
- cDNA产量:定量范围5-500ng,效率偏差≤5%
- 引物特异性:解链温度Tm值60-65°C
- Ct值:检测范围10-40循环,线性动态范围5logs
- 扩增效率:90-110%,R²值≥0.98
- 熔解曲线分析:单峰检测,峰宽≤1°C
- 非特异性扩增:阴性对照Ct值≥35
- 检测限LOD:1copy/μl,定量限LOQ:5copies/μl
- 背景噪声:荧光信号强度≤100RFU
- 批内变异系数CV:≤5%,批间CV≤10%
- 回收率:85-115%
- 斜率:-3.1至-3.6,截距范围-5至5
- 线性范围:R²≥0.99
- 表达稳定性:M值≤0.5,geNorm算法
- 内参Ct值变异:SD≤0.5
- foldchange:对数转换值|log2FC|≥1
- p值:≤0.05,t检验或ANOVA
- 相对表达量:ΔΔCt方法计算,单位foldchange
- 质量控制参数:通过率≥95%
检测范围
1.人类血清样本:检测循环miRNA作为癌症生物标志物,重点评估样本稳定性和低丰度RNA提取
2.肿瘤组织样本:分析FFPE或新鲜组织中miRNA表达谱,侧重肿瘤特异性miRNA差异检测
3.细胞培养上清液:外泌体miRNA检测,强调外泌体分离纯化和表达一致性
4.脑脊液样本:神经疾病相关miRNA定量,重点处理低体积样本和高背景干扰
5.尿液样本:非侵入性miRNA检测,侧重尿液保存条件和抑制剂去除
6.全血样本:全血RNA中miRNA表达,重点红细胞裂解和RNA稳定性控制
7.福尔马林固定石蜡包埋组织:FFPE样本miRNA提取优化,检测重点为RNA碎片化补偿
8.植物组织样本:植物miRNA研究,侧重多酚和多糖干扰去除
9.动物模型样本:疾病模型miRNA表达分析,重点跨物种一致性验证
10.微生物样本:细菌或病毒miRNA检测,检测重点为高GC含量RNA处理
检测方法
国际标准:
- MIQE2020实时荧光定量PCR实验最小信息指南(强调实验设计细节报告)
- ISO20395-2019生物样本中核酸定量方法(侧重灵敏度验证)
- GB/T30988-2014微小RNA检测技术规范(侧重临床样本处理)
- GB/T37871-2019分子生物学检测通用要求(强调数据分析标准)
检测设备
1.分光光度计:Nanodrop2000(波长范围190-840nm,精度±0.001OD)
2.离心机:Eppendorf5424R(转速范围100-15000rpm,温度控制-10至40°C)
3.实时荧光定量PCR仪:Bio-RadCFX96(检测通道6个,温度精度±0.1°C)
4.热循环仪:AppliedBiosystemsVeriti(温度范围4-99°C,升温速率5°C/s)
5.电泳系统:Bio-RadPowerPacBasic(电压范围10-300V,电流0-400mA)
6.核酸提取仪:QIAcube(通量1-12样本,提取效率≥95%)
7.恒温培养箱:MemmertIN110(温度范围室温至60°C,稳定性±0.5°C)
8.超低温冰箱:ThermoScientificTSX(温度-86°C,容量700L)
9.移液器:EppendorfResearchplus(量程0.1-1000μl,精度±0.5%)
10.显微镜:OlympusBX53(放大倍数40-1000x,分辨率0.2μm)
11.外泌体分离系统:qEVoriginal(粒径分离范围50-200nm,回收率≥80%)
12.荧光显微镜:NikonEclipseTi(激发波长400-700nm,检测灵敏度0.1ng)
13.恒温混匀仪:EppendorfThermoMixer(转速300-1400rpm,温度4-99°C)
14.纯水系统:Milli-QIntegral(电阻率18.2MΩ·cm,TOC≤5ppb)
15.数据分析软件:CFXMaestro(算法支持ΔΔCt计算,兼容MIQE报告)