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概述:微生物群落结构分析通过高通量测序和生物信息学方法,检测环境或生物样本中微生物的组成、多样性和功能特性。核心检测对象包括细菌、古菌、真菌等微生物群的丰度分布、Alpha多样性指数(如Shannon指数)、Beta多样性差异(如Bray-Curtis距离),以及关键功能基因(如抗生素耐药基因ARGs)的相对丰度。项目聚焦于样本DNA提取、16SrRNA/JianCe扩增子测序、宏基因组组装等,确保数据质量控制(如读取深度≥10,000)和统计验证(如PERMANOVA分析),以揭示群落动态变化和生态功能关联。
注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).
CMA/CNAS等证书详情,因时间等不可抗拒因素会发生变更,请咨询在线工程师。
多样性分析:
1.土壤样本:涵盖农田、森林及污染场地土壤,重点检测微生物多样性梯度变化和重金属耐受基因丰度
2.水体样本:包括淡水河流、湖泊及废水,侧重污染物降解菌群组成和抗生素耐药基因分布
3.粪便样本:人类及动物肠道微生物组,核心检测益生菌与病原体平衡及功能代谢通路
4.生物膜样本:管道、医疗器械表面生物膜,关注耐药基因水平和群落结构稳定性
5.空气样本:室内外空气悬浮颗粒,重点分析真菌孢子丰度及潜在过敏原关联
6.食品样本:发酵食品如酸奶、泡菜,检测乳酸菌主导群落的变化规律和保质期影响
7.沉积物样本:海洋、河流底泥,侧重厌氧微生物组成及甲烷代谢基因丰度
8.植物根系样本:根际土壤及内生菌,核心检测微生物-植物互作网络和养分循环效率
9.工业废水样本:处理厂出水及污泥,重点分析降解菌群效能及毒性响应机制
10.临床样本:伤口、痰液等,检测病原微生物群落动态及耐药基因传播风险
国际标准:
1.高通量测序仪:IlluminaNovaSeq6000(通量1.5Tb/run,读长2x150bp)
2.PCR扩增仪:Bio-RadT100(温控精度±0.1℃,升降温速率3℃/s)
3.核酸提取仪:QIAGENQIAcube(提取效率≥98%,样本容量24个)
4.生物分析仪:Agilent2100(DNA片段分析范围35-7000bp,分辨率3bp)
5.离心机:Eppendorf5430R(转速300-15000rpm,容量4x100ml)
6.恒温培养箱:MemmertIN260(温度范围0-70℃,均匀度±0.5℃)
7.显微镜:OlympusBX53(放大倍数40-1000x,分辨率0.2μm)
8.紫外分光光度计:ThermoNanoDrop8000(检测波长260/280nm,样本量1μL)
9.电泳仪:Bio-RadPowerPac(电压范围10-300V,电流0-500mA)
10.冷冻干燥机:LabconcoFreeZone(冷阱温度-84℃,真空度<0.001mbar)
11.生物安全柜:EscoAirstream(气流速度0.3-0.5m/s,过滤效率99.999%)
12.恒温水浴锅:JulaboSW22(控温精度±0.1℃,容量22L)
13.振荡器:IKAKS260(转速50-500rpm,振幅20mm)
14.酸碱度计:MettlerToledoSevenCompact(测量范围0-14pH,精度±0.01)
15.荧光定量PCR仪:AppliedBiosystems7500(动态范围10^1-10^9拷贝,升温速率4.4℃/s)
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。
以上是与"微生物群落结构分析"相关的简单介绍,具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。
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