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微生物群落分析

  • 原创官网
  • 2025-07-13 08:14:47
  • 关键字:北检研究院,微生物群落分析

相关:

概述:微生物群落分析采用高通量测序技术,评估样本中微生物的组成、多样性和功能特征。核心检测对象包括细菌、古菌、真菌等微生物分类群,关键项目涵盖16SrRNA测序丰度、α多样性指数(如Shannon指数)、β多样性分析及功能基因预测。检测涉及DNA提取、文库构建和生物信息学处理,确保数据准确性和可重复性。

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注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).

CMA/CNAS等证书详情,因时间等不可抗拒因素会发生变更,请咨询在线工程师。

☌ 询价

检测项目

宏基因组测序:

  • 测序深度:≥50Mreads/sample(参照ISO11737-1)
  • 覆盖度:≥99%目标区域(如:覆盖度≥99%)
  • GC含量偏差:±5%范围
多样性分析:
  • α多样性:Shannon指数(H'≥2.5)、Chao1指数(丰富度估计)
  • β多样性:Bray-Curtis距离(相似度评估)
丰度测定:
  • 物种相对丰度:门水平分类占比(如:变形菌门占比≥15%)
  • 绝对丰度:qPCR拷贝数(检测限10^2copies/μL)
功能预测:
  • KEGG通路分析:功能基因注释覆盖度(≥80%)
  • COG分类:功能类别分布(如:代谢功能占比≥40%)
质量控制:
  • DNA纯度:A260/A280比值(1.8-2.0)
  • 文库浓度:≥20ng/μL(参照GB/T35888)
抗性基因检测:
  • 抗生素抗性基因:ARG丰度(检测限0.01%)
  • 耐药性评估:耐药基因类型分类
微生物溯源:
  • 源跟踪分析:SourceTracker模型置信度(≥90%)
  • 指示微生物:大肠杆菌丰度阈值(如:≤100CFU/mL)
环境适应性:
  • pH相关性:微生物群落pH偏好指数(范围5.0-9.0)
  • 温度响应:OTU热稳定性(ΔT≤5°C)
病毒检测:
  • 病毒组分析:病毒序列丰度(参照ISO15216-1)
  • 噬菌体鉴定:宿主关联性评估
真菌群落:
  • JianCe测序:真菌多样性指数(Shannon≥3.0)
  • 病原真菌丰度:阈值控制(如:≤1%)

检测范围

1.土壤样本:检测重点是微生物群落结构与土壤有机质和重金属污染相关性。

2.水体样本:侧重水质指示微生物如大肠杆菌和蓝藻丰度变化。

3.人体微生物组:关注肠道菌群多样性与健康指标关联性。

4.空气样本:检测微生物孢子分布与环境空气质量相关性。

5.食品样本:侧重腐败微生物和致病菌如沙门氏菌检测。

6.工业废水:监测生物降解微生物丰度和效率评估。

7.农业环境:分析根际微生物与作物生长促进作用。

8.海洋沉积物:检测极端环境微生物适应性和生物地球化学循环。

9.生物膜样本:侧重微生物群落抗药性和附着机制。

10.发酵产品:监测益生菌丰度和功能稳定性。

检测方法

国际标准:

  • ISO11737-1灭菌微生物计数方法
  • ISO15216-1食品微生物病毒检测方法
  • ISO4833-1微生物计数通用指南
国家标准:
  • GB/T35888微生物DNA提取方法
  • GB/T4789.3食品微生物大肠菌群检验
  • GB/T5750.12生活饮用水微生物检验
(方法差异说明:国际标准如ISO11737-1强调高通量测序流程,国家标准如GB/T35888更注重基础DNA提取规范。)

检测设备

1.高通量测序仪:NovaSeq6000型(通量最高8Tb/run)

2.PCR仪:T100型(温度精度±0.2°C)

3.DNA提取仪:QIAcubeHT型(处理量96样本/批)

4.生物分析仪:2100型(片段大小检测范围35-7000bp)

5.离心机:Centrifuge5424型(最大转速15000rpm)

6.恒温培养箱:INCU-Line型(温度范围20-60°C,精度±0.5°C)

7.显微镜:DMi8型(放大倍数1000x)

8.分光光度计:NanoDropOne型(检测限0.2ng/μL)

9.超低温冰箱:JianCeT型(温度-80°C,稳定性±1°C)

10.自动化液体处理系统:Biomeki5型(移液精度±1%)

11.凝胶成像系统:GelDocXR+型(分辨率500万像素)

12.恒温摇床:Innova42型(转速范围20-300rpm)

13.生物安全柜:ClassII型(气流速度0.4m/s)

14.数据服务器:HPCCluster型(计算核心128个)

15.电泳仪:PowerPac型(电压范围10-300V)

北检(北京)检测技术研究院【简称:北检院】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

以上是与"微生物群落分析"相关的简单介绍,具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。

    材料检测服务

    专业分析各类金属、非金属材料的成分、结构与性能,提供全面检测报告和解决方案。包括金属材料力学性能测试、高分子材料老化试验、复合材料界面分析等。

    化工产品分析

    精准检测各类化工产品的成分、纯度及物理化学性质,确保产品质量符合国家标准。服务涵盖有机溶剂分析、催化剂表征、高分子材料分子量测定等。

    环境检测服务

    提供土壤、水质、气体等环境检测服务,助力环境保护与污染治理,共建绿色家园。包括VOCs检测、重金属污染分析、水质生物毒性测试等。

    科研检测认证

    凭借专业团队和先进设备,致力于为企业研发、质量控制及市场准入提供精准可靠的技术支撑,助力品质提升与合规发展。