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小叶楠遗传多样性分析

  • 原创官网
  • 2025-07-15 09:30:01
  • 关键字:北检研究院,小叶楠遗传多样性分析

相关:

概述:小叶楠遗传多样性分析采用分子生物学技术,核心检测对象为小叶楠种群基因组DNA样本,关键项目包括微卫星标记多态性、SNP位点频率、遗传距离计算等。通过DNA提取、PCR扩增、电泳分离和数据分析流程,评估种群遗传结构、杂合度水平(He≥0.5)、基因流参数(Nm值),并参照标准方法测定瓶颈效应和适应性变异,确保结果可靠性用于资源保护和育种优化。

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注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).

CMA/CNAS等证书详情,因时间等不可抗拒因素会发生变更,请咨询在线工程师。

☌ 询价

检测项目

DNA提取与分析:

  • 纯度检测:OD260/280比值(1.8-2.0),浓度测定(≥20 ng/μL)
  • 完整性评估:电泳条带清晰度(参照GB/T 37871-2019)
  • 降解检测:片段大小分布(≥200bp占比≥90%)
分子标记检测:
  • 微卫星分析:等位基因数(≥3个),多态性信息含量(PIC≥0.5,参照ISO 21571)
  • SNP筛选:多态位点频率(≥0.05),杂合度偏差(|Fis|≤0.2)
遗传多样性指数:
  • 预期杂合度:He值(范围0.3-0.8)
  • 观察杂合度:Ho值(偏差≤0.1)
  • 等位基因丰富度:Ar值(≥2.0)
群体遗传结构:
  • 分化系数:Fst值(0-0.25),遗传距离(Nei's D≥0.05)
  • 基因流估算:Nm值(≥1.0)
系统发育分析:
  • 树状图构建:自举支持率(≥70%)
  • 聚类距离:最大似然值(lnL≥-1000)
基因频率检测:
  • 等位基因频率:p值(0.1-0.9)
  • 固定指数:F值(绝对值≤0.3)
杂合度检测:
  • 个体杂合度:HI值(≥0.4)
  • 群体平衡:HWE检验(P≥0.05)
遗传距离计算:
  • Nei距离:遗传分化度(GD≥0.02)
  • Reynolds距离:种群差异(RD≥0.01)
亲缘关系鉴定:
  • 亲本系数:r值(0.5±0.1)
  • 家系分析:血缘距离(≤0.05)
适应性基因检测:
  • 抗性基因频率:R基因表达(≥50%)
  • 变异热点:重组率(cM/Mb≥1.0)

检测范围

1. 野生小叶楠种群样本: 采集自自然保护区,重点检测遗传变异水平和瓶颈效应

2. 人工栽培小叶楠样本: 来自育苗基地,侧重分析选择压力和基因流失

3. 华南地区小叶楠: 覆盖广东广西种群,专注高温适应性基因检测

4. 西南地区小叶楠: 四川云南样本,强调地理隔离对遗传结构影响

5. 小叶楠叶片组织: 新鲜或干燥样本,检测DNA提取效率和降解风险

6. 小叶楠根部组织: 地下部分样本,重点分析共生微生物干扰

7. 小叶楠种子样本: 贮藏种子,评估萌发率和遗传漂变

8. 濒危小叶楠群体: 小种群个体,检测近交衰退和多样性损失

9. 杂交小叶楠个体: 人工杂交后代,侧重亲本贡献和杂种优势

10. 历史标本小叶楠: 博物馆藏品,专注古DNA修复和污染控制

检测方法

国际标准:

  • ISO 21571:2013 食品DNA提取方法(适用于植物组织)
  • ISO 17025:2017 测试实验室能力通用要求(涵盖PCR验证)
  • ISO 5725-2:2019 测量方法精度评定(用于遗传数据重复性)
国家标准:
  • GB/T 34798-2017 分子生物学检测方法通则(规范PCR条件)
  • GB/T 37871-2019 生物样本DNA提取技术规范(要求纯化步骤)
  • GB/T 30988-2014 多态性DNA标记检测方法(定义微卫星分析流程)
国际标准强调高通量测序质控,而国家标准侧重低成本电泳验证;例如ISO要求≥3次重复PCR,GB允许单次优化扩增

检测设备

1. PCR仪: Thermo Fisher Veriti 96-Well Thermal Cycler(温度范围4-99°C,精度±0.1°C)

2. 电泳仪: Bio-Rad PowerPac Basic(电压范围10-300V,电流1-400mA)

3. 测序仪: Illumina NovaSeq 6000(通量高达20Tb/run,读长2x150bp)

4. 分光光度计: NanoDrop 2000c(检测范围0.2-15000 ng/μL,波长260nm)

5. 离心机: Eppendorf 5430 R(最高转速15,000 rpm,容量6x50mL)

6. 凝胶成像系统: Syngene G:BOX Chemi XX6(分辨率5百万像素,灵敏度0.1ng DNA)

7. 核酸定量仪: Qubit 4 Fluorometer(检测限低至0.5 pg/μL,荧光通道2个)

8. 冷冻干燥机: Labconco FreeZone(温度范围-50°C至40°C,冷凝能力4kg/24h)

9. 生物安全柜: Esco Class II A2(风速0.36 m/s,HEPA过滤效率99.99%)

10. 振荡器: IKA KS 260(速度50-500 rpm,负载5kg)

11. 微量移液器: Eppendorf Research plus(精度±1%,体积范围0.1-1000μL)

12. 冰箱: Haier DW-86L728(温度范围-86°C,容积728L)

13. 恒温培养箱: Memmert INC108(温度范围5-70°C,均匀度±0.5°C)

14. 纯水系统: Merck Millipore Milli-Q(电阻率18.2 MΩ·cm,产水速度2L/h)

15. DNA提取仪: QIAGEN QIAcube(处理能力24 samples/run,时间30min)

北检(北京)检测技术研究院【简称:北检院】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

以上是与"小叶楠遗传多样性分析"相关的简单介绍,具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。

    材料检测服务

    专业分析各类金属、非金属材料的成分、结构与性能,提供全面检测报告和解决方案。包括金属材料力学性能测试、高分子材料老化试验、复合材料界面分析等。

    化工产品分析

    精准检测各类化工产品的成分、纯度及物理化学性质,确保产品质量符合国家标准。服务涵盖有机溶剂分析、催化剂表征、高分子材料分子量测定等。

    环境检测服务

    提供土壤、水质、气体等环境检测服务,助力环境保护与污染治理,共建绿色家园。包括VOCs检测、重金属污染分析、水质生物毒性测试等。

    科研检测认证

    凭借专业团队和先进设备,致力于为企业研发、质量控制及市场准入提供精准可靠的技术支撑,助力品质提升与合规发展。