检测项目
核酸质量检测:
- 片段大小分布:范围200-500bp(参照ISO20395)
- 浓度精度:偏差±5%(参照GB/T34044)
- 分子完整性:无降解迹象(参照ISO17025)
- OD260/280比值:1.8-2.0(参照GB/T30989)
- 污染物水平:≤0.1%(参照ISO20395)
- 内毒素含量:<0.1EU/μL(参照ISO17025)
- 连接率:≥95%(参照GB/T34044)
- 接头完整性:全序列匹配(参照ISO20395)
- 条形码唯一性:100%unique(参照GB/T30989)
- 扩增偏倚:≤2倍差异(参照ISO20395)
- GC含量偏差:±5%(参照GB/T34044)
- 扩增效率:CV≤10%(参照ISO17025)
- 存储稳定性:-20°C下≥6个月(参照GB/T30989)
- 冻融循环耐受:≤3次(参照ISO20395)
- 温度敏感性:偏差±1°C(参照GB/T34044)
- 无病原体:检测限10^3CFU/mL(参照ISO17025)
- 无核酸酶:活性≤0.01U/μL(参照GB/T30989)
- 样本追溯性:标识清晰(参照ISO20395)
- 测序深度一致性:CV≤10%(参照GB/T34044)
- 错误率:≤1%(参照ISO20395)
- 读长一致性:偏差±5%(参照GB/T30989)
- 反转录效率:≥90%(参照ISO17025)
- 片段化均匀度:CV≤5%(参照GB/T34044)
- 捕获特异性:≥95%(参照ISO20395)
- 通过率:≥98%(参照GB/T30989)
- 重复性:CV≤5%(参照ISO20395)
- 回收率:≥80%(参照GB/T34044)
- 湿度敏感性:RH40-60%(参照ISO17025)
- 光照稳定性:无光降解(参照GB/T30989)
- 压力耐受:≤100kPa(参照ISO20395)
检测范围
1.基因组DNA文库:涵盖全基因组测序样本,重点检测片段大小完整性和浓度准确性,确保无降解。
2.RNA测序文库:包括mRNA和总RNA样本,重点检测反转录效率和rRNA去除率,提升转录本覆盖率。
3.宏基因组文库:涉及环境或微生物样本,重点检测多样性覆盖和抑制物去除,减少偏差。
4.FFPE样本文库:针对福尔马林固定石蜡包埋组织,重点检测片段化修复效率和DNA完整性。
5.单细胞文库:包括单细胞分离样本,重点检测细胞捕获率和扩增偏差,保证数据均一性。
6.长读长文库:适用于PacBio或Nanopore平台,重点检测大片段大小(>10kb)和低GC偏差。
7.靶向捕获文库:涉及外显子或特定区域,重点检测捕获效率和特异性,避免脱靶效应。
8.表观遗传文库:包括甲基化或修饰样本,重点检测修饰保留和扩增偏倚,确保表观标记准确。
9.微生物组文库:针对肠道或土壤样本,重点检测物种代表性和污染物控制。
10.临床样本文库:涵盖血液或组织样本,重点检测病原体检测限(≤10^3CFU/mL)和交叉污染控制。
检测方法
国际标准:
- ISO20395:2019生物技术-DNA测序-文库制备要求
- ISO17025:2017检测和校准实验室能力的一般要求
- ISO13485:2016医疗器械质量管理体系
- GB/T34044-2017高通量测序文库制备技术规范
- GB/T30989-2014生物样本库质量管理规范
- GB/T37864-2019生物样本核酸提取纯化技术规范
检测设备
1.分光光度计:Nanodrop8000(波长范围220-750nm,精度±1%)
2.荧光计:Qubit4.0(检测限0.1pg/μL,动态范围0.1-1000ng/μL)
3.生物分析仪:Agilent2100(片段大小范围25-12000bp,分辨率1bp)
4.实时PCR仪:AppliedBiosystems7500(动态范围10^7,温控精度±0.1°C)
5.测序仪:PacBioSequelII(读长>10kb,精度Q30,通量8Mreads)
6.离心机:Eppendorf5424R(最大RCF21000xg,转速精度±10rpm)
7.恒温混匀器:ThermomixerC(温度范围4-99°C,混匀速度300-1500rpm)
8.电泳系统:Bio-RadCHEF-DRIII(脉冲场电泳,电压6V/cm,运行时间1-24h)
9.自动化工作站:HamiltonMicrolabSTAR(移液精度±0.5μL,通量96样本)
10.低温存储设备:ThermoScientific-80°C冰箱(温度稳定性±1°C,容量500L)
11.核酸提取仪:MagMAX96(通量96样本/运行,回收率≥90%)
12.片段仪:CovarisM220(聚焦超声,片段大小可调50-2000bp,功率峰值18W)
13.热循环仪:Veriti96-Well(温控精度±0.1°C,升温速率4°C/s)
14.凝胶成像系统:SyngeneG:BOX(分辨率1.4百万像素,检测限0.1ng)
15.质谱仪:ABSciex5600+(质量精度1ppm,检测范围50-40000m/z)