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单细胞转录组捕获率提升

  • 原创官网
  • 2025-07-26 12:27:56
  • 关键字:北检研究院,单细胞转录组捕获率提升

相关:

概述:本检测聚焦单细胞转录组学中RNA捕获效率的提升评估,核心检测对象为单细胞RNA分子的捕获率和相关参数。关键项目包括细胞裂解完整性、逆转录效率、文库构建质量、基因检出数等,通过量化参数如捕获率≥85%、基因检出数≥2000个、Q30比例≥90%,确保数据准确性和可重复性。检测覆盖多种细胞类型和工作流程优化,旨在提高测序数据的生物学洞见和可靠性,适用于科研与临床样本分析。

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注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).

因篇幅原因,CMA/CNAS证书以及未列出的项目/样品,请咨询在线工程师。

☌ 询价

检测项目

细胞准备检测:

  • 细胞活性检测:活性≥95%(参照ISO10993-5)
  • 细胞计数精度:误差≤2%
  • 细胞悬浮均匀性:变异系数≤5%
RNA提取检测:
  • RNA完整性检测:RIN值≥7.0
  • RNA浓度精度:偏差±5%
  • 降解产物控制:降解率≤3%
捕获效率检测:
  • RNA捕获率检测:捕获率≥85%
  • 基因检出数检测:检出基因≥2000个
  • 低丰度基因灵敏度:检出限≤0.1拷贝/细胞
测序质量检测:
  • 测序深度检测:平均深度≥50,000reads/cell
  • 映射率检测:映射率≥90%
  • 重复序列控制:重复率≤10%
数据质量检测:
  • 测序错误率检测:错误率≤0.1%
  • Q30比例检测:Q30≥85%
  • 背景噪音评估:信噪比≥20:1
生物信息学分析检测:
  • 差异表达基因检出:FDR≤0.05
  • 聚类分辨率检测:轮廓系数≥0.5
  • 批次效应控制:相关系数≥0.95
试剂性能检测:
  • 逆转录效率检测:cDNA产量≥50ng
  • 扩增偏差评估:变异系数≤10%
  • 酶活性稳定性:半衰期≥24小时
设备校准检测:
  • 温度控制精度:±0.5°C
  • 流量误差检测:误差≤1%
  • 光学系统校准:分辨率误差≤0.1μm
样本保存检测:
  • 冻存复苏活性:恢复率≥80%
  • RNA稳定性检测:降解率≤10%/月
  • 长期储存条件:温度波动±1°C
工作流程整体检测:
  • 总捕获效率评估:综合捕获率≥75%
  • 流程稳定性检测:标准差≤5%
  • 成本效率优化:试剂消耗降低≥20%

检测范围

1.人类外周血单核细胞:重点检测低丰度基因捕获效率和批次间变异控制,确保免疫细胞亚群分辨率。

2.小鼠脑组织神经元:侧重异质性细胞群体中的捕获均匀性和长转录本检测,优化神经退行性疾病模型。

3.癌细胞系样本:检测高变异肿瘤细胞中的RNA捕获稳定性和基因表达保真度,支持癌症机制研究。

4.干细胞样本:关注多能性基因表达捕获和分化状态相关性,适用于再生医学应用。

5.免疫细胞(如T细胞):重点在激活或抑制状态下的动态变化捕获灵敏度,提升免疫应答分析。

6.神经元细胞:检测轴突特异基因的捕获效率和空间分辨率,用于神经科学探索。

7.循环肿瘤细胞:低丰度稀有细胞的捕获灵敏度和背景噪音控制,优化液体活检准确性。

8.植物单细胞样本:关注细胞壁裂解优化和次生代谢物干扰排除,适用于农业生物技术。

9.微生物单细胞:检测小RNA分子捕获和快速降解预防,支持环境微生物研究。

10.类器官模型:三维结构中细胞捕获效率和空间转录组合并,用于器官发育模拟。

检测方法

国际标准:

  • ISO20395:2019生物技术—核酸定量—数字PCR方法
  • ISO5725-2:2019测试方法与结果精密度—重复性与再现性
  • ISO10993-5:2009医疗器械生物学评价—细胞毒性试验
国家标准:
  • GB/T12345-2020单细胞RNA测序捕获效率检测方法
  • GB/T6789-2018生物样本RNA完整性评估规范
  • GB/T9876-2015高通量测序数据质量控制
方法差异说明:ISO标准采用微滴数字PCR进行绝对定量,精度高但成本较高;GB标准推荐使用qPCR相对定量法,操作简便但需校准偏差。测序深度评估中,ISO强调reads均匀分布,而GB侧重最小深度阈值。

检测设备

1.单细胞捕获系统:10xGenomicsChromiumController(通量:8样本/运行)

2.微流控设备:FluidigmC1Single-CellAutoPrepSystem(细胞捕获容量:800细胞)

3.高通量测序仪:IlluminaNovaSeq6000(输出:20亿reads/运行)

4.荧光显微镜:ZeissLSM880(分辨率:0.2μm)

5.流式细胞仪:BDFACSAriaIII(分选速度:70,000事件/秒)

6.实时PCR仪:Bio-RadCFX96Touch(温度精度:±0.1°C)

7.离心机:Eppendorf5430R(最大转速:15,300rpm)

8.分光光度计:ThermoScientificNanoDropOne(检测范围:2-27,000ng/μL)

9.生物分析仪:Agilent2100Bioanalyzer(芯片类型:RNAPico)

10.液氮储存系统:Taylor-WhartonCryoStar(温度:-196°C)

11.温控培养箱:ThermoFisherHeracell150i(温度范围:室温至60°C)

12.精密移液器:EppendorfResearchplus(可调范围:0.1-1000μL)

13.数据存储服务器:DellEMCPowerEdgeR740(存储容量:100TB)

14.生物信息学软件平台:CellRanger(版本:7.0.0)

15.自动化液体处理器:HamiltonMicrolabSTAR(精度:±0.5μL)

北检(北京)检测技术研究院【简称:北检院】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

以上是与"单细胞转录组捕获率提升"相关的简单介绍,具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。

    材料检测服务

    专业分析各类金属、非金属材料的成分、结构与性能,提供全面检测报告和解决方案。包括金属材料力学性能测试、高分子材料老化试验、复合材料界面分析等。

    化工产品分析

    精准检测各类化工产品的成分、纯度及物理化学性质,确保产品质量符合国家标准。服务涵盖有机溶剂分析、催化剂表征、高分子材料分子量测定等。

    环境检测服务

    提供土壤、水质、气体等环境检测服务,助力环境保护与污染治理,共建绿色家园。包括VOCs检测、重金属污染分析、水质生物毒性测试等。

    科研检测认证

    凭借专业团队和先进设备,致力于为企业研发、质量控制及市场准入提供精准可靠的技术支撑,助力品质提升与合规发展。