检测项目
1.mRNA表达降低率检测:采用qRT-PCR定量分析,要求沉默效率≥70%,内参基因GAPDH/β-actinCt值偏差≤0.5
2.蛋白表达抑制率测定:通过WesternBlot或ELISA检测,目标蛋白表达量降低≥60%,灰度分析软件ImageJ验证
3.细胞转染效率验证:使用荧光标记siRNA(如FAM标记),流式细胞术检测转染效率≥80%
4.半衰期稳定性测试:37℃血清环境中孵育,要求24小时内降解率≤20%
5.脱靶效应评估:全转录组测序分析,非目标基因表达变化幅度≤15%
6.细胞毒性检测:CCK-8法测定细胞存活率≥90%,LD50值≥100μM
7.最小有效浓度确定:浓度梯度实验(1-100nM),ED50值≤20nM
8.沉默持续时间监测:单次转染后作用持续时间≥96小时
9.干扰特异性验证:ScrambledsiRNA对照组与实验组差异≥50倍
10.细胞内定位追踪:共聚焦显微镜观察胞质分布比例≥85%
11.RISC加载效率检测:AGO2蛋白免疫沉淀后NorthernBlot验证siRNA加载量
12.二级结构影响分析:熔点温度Tm值≥60℃,自由能ΔG≤-35kcal/mol
检测范围
1.化学合成siRNA:21-23nt双链结构,3'端dTdT悬垂,HPLC纯度≥95%
2.慢病毒载体表达shRNA:拷贝数≥10⁸TU/mL,空载体转染效率对照
3.脂质体包裹siRNA复合物:粒径100-200nm,Zeta电位+20~+30mV
4.纳米颗粒递送系统:PLGA材料包裹率≥80%,缓释时间≥72小时
5.稳定转染细胞系:嘌呤霉素筛选浓度1-10μg/mL,抗性维持≥15代
6.原代细胞转染样本:神经元/肝细胞原代培养≤P5代,电转参数300V/10ms
7.动物组织标本:裸鼠肿瘤模型瘤内注射,组织切片厚度5μm
8.体液样本中siRNA检测:血浆样本RNase抑制剂添加浓度1U/μL
9.冻干粉制剂:复溶后活性保留≥90%,水分含量≤3%
10.阳离子聚合物复合物:氮磷比(N/P)4:1-8:1,凝胶电泳阻滞完全
11.器官特异性递送系统:肝靶向配体GalNAc修饰率≥3分子/siRNA
12.温度敏感型水凝胶:相变温度34-37℃,包封率≥95%
检测方法
国际标准:
ISO20395:2019分子生物学检测-定量PCR方法验证要求
ASTME2935-18基因沉默效率评估标准指南
ISO20184-1:2018冷冻组织样本中RNA提取与质量控制
ASTMF2998-14细胞转染效率流式细胞术检测规范
ISO23118:2021蛋白质免疫印迹定量分析原则
国家标准:
GB/T34796-2017核酸定量测定-紫外分光光度法
GB/T37871-2019基因敲低效率检测指南
GB/T42076.1-2022细胞存活率检测-CCK-8法
GB/T42752-2023小干扰RNA产物纯度高效液相色谱分析法
GB/T43239-2023脱靶效应全转录组测序评估规范
检测设备
1.实时荧光定量PCR仪:型号QuantStudio7Pro,检测通道数6个,温度均一性±0.2℃
2.流式细胞仪:型号CytoFLEXS,检测灵敏度FITC≤100MESF,分析速度≥35,000细胞/秒
3.激光共聚焦显微镜:型号LSM900,Z轴分辨率0.35μm,荧光通道数5个
4.蛋白免疫印迹系统:型号iBlot2,转印时间7分钟,膜孔径0.2μm
5.高效液相色谱仪:型号1260InfinityII,色谱柱C18,检测波长260nm,保留时间偏差≤0.1min
6.纳米颗粒跟踪分析仪:型号NanoSightNS300,粒径检测范围10-2000nm,浓度检测下限10⁶particles/mL
7.超灵敏化学发光成像系统:型号AmershamImager680,像素分辨率4.3MP,动态范围4.8OD
8.细胞电转染系统:型号NeonNxT,电压范围100-2000V,脉冲宽度10-100ms
9.酶标仪:型号SpectraMaxiD5,检测波长范围200-1000nm,振荡速度1000rpm
10.生物分析系统:型号2100,RNA完整性指数(RIN)≥8.0,灵敏度0.5pg/μL