检测项目
1.16SrRNA基因测序：V3-V4区扩增测序，读长2300bp，覆盖度≥99%
2.全基因组测序：IlluminaNovaSeq平台PE150模式，测序深度≥100
3.毒力基因筛查：stx1/stx2、eaeA、hlyA等30种毒力因子PCR验证
4.抗生素耐药基因检测：blaCTX-M、tetA/B、qnrS等45种耐药基因探针杂交
5.多位点序列分型（MLST）：7个管家基因（adk,fumC,gyrB,icd,mdh,purA,recA）扩增测序
检测范围
1.食品样本：生鲜肉类（牛肉/禽肉）、乳制品（巴氏杀菌乳/奶酪）、即食蔬菜
2.医疗临床样本：粪便培养物、血液分离株、尿液标本
3.环境样本：污水处理厂出水体、养殖场土壤基质
4.药品原料：胰蛋白酶制剂、肝素钠粗品
5.化妆品原料：植物提取物（芦荟胶/洋甘菊浸膏）、动物源性胶原蛋白
检测方法
ISO16654:2001食品中大肠杆菌O157:H7分离鉴定法
GB/T4789.3-2016食品微生物学检验大肠菌群计数
ASTMD5246-19水样中大肠杆菌膜过滤法
ISO13136:2012食源性致病菌实时PCR检测规程
GB/T34796-2017核酸定量测定SYBRGreenI荧光法
检测设备
1.IlluminaNovaSeq6000：高通量双通道测序系统，通量6Tb/run
2.ThermoFisherQubit4.0：荧光计定量仪，检测范围0.1-60ng/μL
3.Bio-RadCFX96Touch：实时定量PCR仪，支持六色荧光通道
4.EppendorfMastercyclerX50s：梯度PCR仪，温控精度0.1℃
5.OxfordNanoporeGridIONX5：长读长测序平台，读长>10kb
6.BeckmanCoulterBiomeki7：自动化液体处理工作站，移液精度1%
7.Agilent4200TapeStation：核酸质量分析系统，DNA片段评估范围50-5000bp
8.MiltenyiBiotecGentleMACSOcto：组织样本均质系统，8通道并行处理
9.SartoriusIncuSafeCO170：恒温培养箱，温度波动0.2℃
10.HamiltonSTARletIVD：全自动微生物接种仪，划线速度200皿/小时