大肠杆菌测序检测

检测项目

1.16SrRNA基因测序：V3-V4区扩增测序，读长2300bp，覆盖度≥99%

2.全基因组测序：IlluminaNovaSeq平台PE150模式，测序深度≥100

3.毒力基因筛查：stx1/stx2、eaeA、hlyA等30种毒力因子PCR验证

4.抗生素耐药基因检测：blaCTX-M、tetA/B、qnrS等45种耐药基因探针杂交

5.多位点序列分型（MLST）：7个管家基因（adk,fumC,gyrB,icd,mdh,purA,recA）扩增测序

检测范围

1.食品样本：生鲜肉类（牛肉/禽肉）、乳制品（巴氏杀菌乳/奶酪）、即食蔬菜

2.医疗临床样本：粪便培养物、血液分离株、尿液标本

3.环境样本：污水处理厂出水体、养殖场土壤基质

4.药品原料：胰蛋白酶制剂、肝素钠粗品

5.化妆品原料：植物提取物（芦荟胶/洋甘菊浸膏）、动物源性胶原蛋白

检测方法

ISO16654:2001食品中大肠杆菌O157:H7分离鉴定法

GB/T4789.3-2016食品微生物学检验大肠菌群计数

ASTMD5246-19水样中大肠杆菌膜过滤法

ISO13136:2012食源性致病菌实时PCR检测规程

GB/T34796-2017核酸定量测定SYBRGreenI荧光法

检测设备

1.IlluminaNovaSeq6000：高通量双通道测序系统，通量6Tb/run

2.ThermoFisherQubit4.0：荧光计定量仪，检测范围0.1-60ng/μL

3.Bio-RadCFX96Touch：实时定量PCR仪，支持六色荧光通道

4.EppendorfMastercyclerX50s：梯度PCR仪，温控精度0.1℃

5.OxfordNanoporeGridIONX5：长读长测序平台，读长>10kb

6.BeckmanCoulterBiomeki7：自动化液体处理工作站，移液精度1%

7.Agilent4200TapeStation：核酸质量分析系统，DNA片段评估范围50-5000bp

8.MiltenyiBiotecGentleMACSOcto：组织样本均质系统，8通道并行处理

9.SartoriusIncuSafeCO170：恒温培养箱，温度波动0.2℃

10.HamiltonSTARletIVD：全自动微生物接种仪，划线速度200皿/小时

北检(北京)检测技术研究院【简称：北检院】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。

以上是与"大肠杆菌测序检测"相关的简单介绍，具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检检测技术研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。