1.全基因组测序:30测序深度覆盖,单碱基分辨率≤0.01%,Q30≥85%
2.SNP/InDel筛查:灵敏度≥99.5%,特异性≥99.8%,最小检出频率0.5%
3.结构变异分析:可识别≥50bp的插入/缺失事件及染色体易位
4.线粒体基因组测序:环状基因组完整度≥98%,异质性检测限0.1%
5.病原微生物溯源:16S/ITS全长测序+宏基因组分析,物种注释至种水平
1.人类外周血样本:EDTA抗凝全血≥2mL或DNA浓度≥20ng/μL
2.动植物组织样本:新鲜/冻存组织≥50mg或FFPE切片≥10片
3.植物种子类材料:单粒种子DNA提取纯度A260/A280=1.8-2.0
4.微生物培养物:细菌/真菌纯培养物OD600≥0.8
5.法医物证样本:包括毛发根鞘、口腔拭子等微量DNA样本
ISO/IEC17025:2017《检测和校准实验室能力通用要求》
GB/T30988-2014《高通量基因测序技术规程》
ASTME3230-20《全基因组测序数据验证标准指南》
ISO20395:2019《生物技术-核酸定量方法要求》
GB/T34796-2017《单核苷酸多态性(SNP)分型技术规程》
1.IlluminaNovaSeq6000:双流动槽系统,单次运行输出6Tb数据
2.ThermoFisherIonS5XL:半导体芯片技术靶向测序平台
3.Agilent4200TapeStation:核酸完整性评估(DIN值测定)
4.Qubit4.0Fluorometer:高精度dsDNA定量(检测限0.2pg/μL)
5.CovarisM220Focused-ultrasonicator:DNA片段化CV值≤5%
6.BeckmanCoulterBiomeki7:自动化建库工作站(通量96样本/批次)
7.OxfordNanoporeGridIONX5:长读长测序(N50≥100kb)
8.RocheKAPAHyperPlusKit:低起始量DNA文库构建(1ng输入)
9.EppendorfMastercyclerX50s:梯度PCR扩增仪(温控精度0.1℃)
10.Bio-RadCFX96Touch:实时荧光定量PCR系统(动态范围10^9)
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。
以上是与三粒基因组检测相关的简单介绍,具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。