超甲基化作用检测概述:检测项目1.CpG岛甲基化密度测定:覆盖≥200bp区域,分辨率达单碱基水平2.基因启动子区域甲基化位点定位:精确识别-2000至+500bp范围内的5mC修饰3.全基因组甲基化水平分析:检测精度≥30测序深度4.差异甲基化区域(DMR)筛选:设置Δβ值≥0.2为显著性阈值5.甲基转移酶活性测定:灵敏度达0.01U/μg蛋白检测范围1.肿瘤组织样本(FFPE/新鲜冷冻)2.外周血游离DNA(ctDNA)3.植物基因组DNA(≥500ng/样本)4.环境污染物暴露模型(PM2.5暴露细胞系)5.药物干预后表
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1.CpG岛甲基化密度测定:覆盖≥200bp区域,分辨率达单碱基水平
2.基因启动子区域甲基化位点定位:精确识别-2000至+500bp范围内的5mC修饰
3.全基因组甲基化水平分析:检测精度≥30测序深度
4.差异甲基化区域(DMR)筛选:设置Δβ值≥0.2为显著性阈值
5.甲基转移酶活性测定:灵敏度达0.01U/μg蛋白
1.肿瘤组织样本(FFPE/新鲜冷冻)
2.外周血游离DNA(ctDNA)
3.植物基因组DNA(≥500ng/样本)
4.环境污染物暴露模型(PM2.5暴露细胞系)
5.药物干预后表观遗传修饰评估(HDAC抑制剂处理组)
1.ISO20387:2018亚硫酸盐测序法(BSP)
2.GB/T37872-2019甲基化特异性PCR(MSP)技术规范
3.ASTME3136-18焦磷酸测序定量分析标准
4.ISO/TS20922:2021甲基化芯片数据分析指南
5.GB/T40182-2021全基因组重亚硫酸盐测序技术规程
1.IlluminaNovaSeq6000:全基因组甲基化测序平台(PE150模式)
2.ThermoFisherQubit4.0:微量DNA浓度测定(灵敏度0.1pg/μL)
3.Agilent4200TapeStation:DNA完整性评估(DIN值≥7.0)
4.QiagenPyroMarkQ48Autoprep:焦磷酸定量分析(CV≤5%)
5.RocheLightCycler480II:实时荧光定量PCR(退火温度梯度控制)
6.CovarisM220:DNA片段化系统(峰值能量50W)
7.Bio-RadCFX96:甲基化特异性扩增监测(熔解曲线分析)
8.OxfordNanoporePromethION:长读长甲基化测序(>100kb读长)
9.EppendorfMastercyclerX50s:亚硫酸盐转化反应控制(温控精度0.1℃)
10.PerkinElmerLabChipGXTouch:片段分布分析(1-10000bp范围)
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。
以上是与超甲基化作用检测相关的简单介绍,具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。