检测项目
1.CEAmRNA定量检测:灵敏度≤10copies/μL,线性范围10^2-10^7copies/μL2.KRAS基因突变分析(G12D/G13D):检出限0.1%突变频率3.miR-21-5p/miR-92a相对表达量测定:CV值<5%4.APC基因长链非编码RNA(lncRNA-APC1)稳定性评估:降解率阈值≤15%/24h5.肿瘤组织全转录组测序:覆盖度≥95%(PE150模式)
检测范围
1.血清/血浆游离RNA样本(采集量≥2mL)2.福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织切片3.新鲜结直肠癌手术切除标本(保存温度-80℃)4.体外培养肿瘤细胞系(需提供传代代数及培养基成分)5.粪便样本中脱落细胞RNA提取物(保存液为RNAlater)
检测方法
1.ISO20186-1:2019分子体外诊断检验-人源样本处理规范2.GB/T37876-2019核酸定量测定用数字PCR法通则3.ASTME3027-22肿瘤相关miRNA荧光定量PCR检测指南4.ISO15189:2022医学实验室质量体系实时荧光PCR验证要求5.GB/T34796-2017核酸提取试剂盒性能评价标准
检测设备
1.ThermoFisherQuantStudio6Pro:支持高分辨率熔解曲线分析(HRM)2.Rochecobasz480:具备TaqMan探针多重荧光检测通道3.Bio-RadQX200DropletDigitalPCR系统:微滴生成分辨率达0.001%4.Agilent4200TapeStation:RNA完整性指数(RIN值)测定模块5.IlluminaNovaSeq6000:全转录组测序通量≥800Mreads/run6.EppendorfMastercyclerX50s:梯度PCR温控精度0.1℃7.HamiltonMicrolabSTARlet:自动化核酸提取工作站8.NanoDropOneC超微量分光光度计:测量范围2-3700ng/μL9.BeckmanCoulterCytoFLEXS:流式细胞术RNA-FISH联用平台10.LeicaCM1950冷冻切片机:低