检测项目
1.基因位点覆盖度:SNP分型准确率≥99.9%,最低检出限0.1%突变频率
2.等位基因比例偏差:相对偏差≤5%(浓度范围1-1000copies/μL)
3.杂合性丢失(LOH)频率:分辨率达1:1000杂合/纯合比例
4.引物二聚体干扰:熔解曲线Tm值偏差≤0.5℃
5.非特异性扩增率:阴性对照Ct值≥35循环数
检测范围
1.外周血样本:EDTA抗凝全血DNA浓度≥5ng/μL
2.肿瘤组织切片:石蜡包埋样本DNA片段≥200bp
3.FFPE样本:交联DNA修复成功率≥85%
4.细胞系培养物:传代次数≤20代的稳定基因组
5.微生物混合群落:16SrRNA基因V3-V4区扩增效率≥90%
检测方法
1.荧光定量PCR:ISO17025:2017体系验证,退火温度梯度2℃验证特异性
2.Sanger测序:GB/T30989-2014双向测序覆盖率≥98%
3.NGS文库构建:IlluminaTruSeqNanoDNAprotocol(350-550bp插入片段)
4.数字PCR分析:基于QX200™的微滴分割技术(20,000droplets/样本)
5.HRM分型:LightCycler480II高分辨率模式(0.01℃/s升温速率)
检测设备
1.IlluminaNovaSeq6000:双通道SBS测序技术,通量6Tb/run
2.ThermoFisherQuantStudio7Pro:六色荧光通道,温控精度0.1℃
3.Bio-RadQX200DropletDigitalPCR:微滴生成效率98%,CV值<5%
4.Agilent4200TapeStation:DNA完整性DIN值测定范围1-10
5.BeckmanCoulterBiomeki7:移液精度CV≤1%(1-1000μL)
6.RocheLightCycler480II:384孔板HRM分析分辨率0.001ΔF
7.EppendorfMastercyclerX50s:梯度PCR温度均匀性0.3℃
8.QiagenQIAcubeHT:核酸提取通量96样本/批次,回收率≥90%
9.PerkinElmerLabChipGXTouch:DNA浓度测定精度5%(0.5-200ng/μL)
10.SartoriusCubisIIMSA:天平称量精度0.01mg(最大量程220g)