检测项目
1.SNP分型检测:覆盖rsID数据库收录的5000+单核苷酸多态性位点,分辨率≥99.7%,检出限达0.1%突变频率
2.STR分型检测:分析15个核心短串联重复序列(包含D5S818/D13S317等),重复单元数测定精度1个重复单位
3.HLA基因分型:针对HLA-A/B/C/DRB1/DQB1基因座进行高分辨率测序(4位数分型),覆盖IMGT/HLA数据库v3.45版本
4.拷贝数变异检测:采用MLPA技术验证50个目标基因的拷贝数变化,动态范围1-6拷贝数
5.线粒体单倍型分析:测定HVⅠ/HVⅡ区16,569bp全序列,识别16189T>C等12个特征性突变位点
检测范围
1.临床诊断样本:包括外周血(EDTA抗凝)、骨髓穿刺液(肝素抗凝)及羊水细胞培养物
2.法医学检材:涵盖唾液斑(滤纸载体)、毛发毛囊(带完整根鞘)及陈旧骨骼样本(脱钙处理)
3.肿瘤组织样本:新鲜冻存组织(-80℃保存)、FFPE切片(厚度5μm)及循环肿瘤DNA(ctDNA)提取物
4.古生物样本:化石粉末(≥20mg)、牙齿牙骨质(未脱矿处理)及陈旧皮革制品(鞣制工艺校正)
5.转基因生物材料:含CRISPR编辑细胞系(传代≤10次)、转基因小鼠尾尖组织(乙醇固定)及重组质粒标准品
检测方法
1.PCR-SSP法:依据GB/T29889-2013《人类基因原位杂交试剂盒》建立特异性引物体系
2.Sanger测序法:执行ISO/IEC17025:2017《检测和校准实验室能力通用要求》验证程序
3.NGS高通量测序:采用IlluminaMiseq平台进行双端150bp测序(Q30≥80%)
4.CapillaryElectrophoresis:应用ABI3500xL系统进行片段分析(精度1bp)
5.TaqMan探针法:参照GB/T30988-2014《多色荧光定量PCR方法通则》设置阈值循环数
检测设备
1.ThermoFisherQuantStudio6Pro:实时荧光定量PCR仪,支持96/384孔板快速热循环
2.IlluminaNovaSeq6000:高通量测序系统,单次运行通量达6Tb数据量
3.ABIVeriti96-WellThermalCycler:梯度PCR仪,温度均一性0.25℃
4.Agilent4200TapeStation:核酸质量分析仪,可检测DNA完整性指数(DIN≥7.0)
5.BeckmanCoulterBiomeki7:自动化液体处理工作站,移液精度CV≤2%
6.RocheLightCycler480II:多色荧光定量系统,支持6通道同步检测
7.QIAGENQIAxcelAdvanced:全自动电泳仪,分辨率达3-1000bp
8.EppendorfCentrifuge5430R:高速冷冻离心机,最大RCF30,000g
9.Bio-RadCFXOpus96:实时定量PCR系统,动态范围达10个数量级
10.NanodropOneCUV-Vis分光光度计:核酸浓度测定精度1ng/μL