检测项目
1.碱基替换率测定:单核苷酸变异(SNV)≥0.01%分辨率
2.移码突变频率分析:插入/缺失(INDEL)检出限≤5bp
3.CpG岛甲基化水平:全基因组覆盖度≥90%
4.染色体结构变异:分辨率达50kb的CNV检测
5.转录组异常表达:差异基因检出阈值FC≥2.0
6.蛋白质翻译错误率:错义氨基酸检出限0.05%
检测范围
1.转基因作物种子及植株组织样本
2.重组蛋白药物表达载体系统
3.CRISPR-Cas9基因编辑细胞系
4.工业用基因工程菌发酵产物
5.病毒载体基因治疗制剂
6.合成生物学人工染色体构建体
检测方法
1.ISO10993-3:2014医疗器械遗传毒性评价标准
2.ASTMF1983-14医疗设备基因突变评估指南
3.GB/T16886.3-2019医疗器械生物学评价第3部分
4.GB15193.23-2014食品安全国家标准致突变试验
5.OECDTG488转基因啮齿类体细胞突变试验规范
6.ISO21750:2006分子生物学检测质量控制要求
检测设备
1.ThermoFisherQuantStudio5实时荧光定量PCR系统:SNP分型精度0.15%
2.IlluminaNovaSeq6000测序仪:双端150bp读长精度Q30≥80%
3.Agilent2100生物分析仪:DNA/RNA片段分析灵敏度0.1ng/μL
4.Bio-RadQX200微滴式数字PCR系统:绝对定量精度5%
5.PerkinElmerLabChipGXII核酸分析系统:片段大小检测范围25-5000bp
6.OxfordNanoporeGridION测序平台:长读长(≥10kb)结构变异检测
7.BeckmanCytoFLEX流式细胞仪:细胞转染效率分析精度0.5%
8.RocheLightCycler480II定量PCR仪:高分辨率熔解曲线分析(HRM)
9.QiagenQIAxcelAdvanced全自动电泳系统:核酸质量评估符合ISO/IEC17025标准
10.AppliedBiosystems3500xL基因分析仪:毛细管电泳分辨率1bp差异检出