检测项目
RNA提取与纯化:
- RNA完整性检测:RIN值≥7.0(参照ISO20395:2019)
- RNA浓度检测:浓度≥20ng/μL,A260/A280比值1.8-2.0
- RNA纯度检测:DNA污染≤1%
- 反转录效率:效率≥90%
- cDNA产量:浓度≥10ng/μL
- 引物特异性:熔解曲线单峰
- Ct值分析:Ct≤35,扩增效率90-110%
- 相对定量:ΔΔCt法计算倍数变化
- 绝对定量:拷贝数≥10copies/μL
- 测序深度:≥30Mreads/sample
- 比对率:≥90%,参考基因组GRCh38
- 基因表达丰度:FPKM≥1.0
- 倍数变化:|log2FC|≥1.0
- 显著性阈值:p值<0.05,FDR校正
- 通路富集分析:KEGG或GO数据库
- miRNA浓度:≥5pg/μL
- 特异性探针杂交:信噪比≥10:1
- 差异miRNA筛选:|log2FC|≥2.0
- WesternBlot信号强度:灰度值线性范围
- ELISA浓度检测:灵敏度≥1pg/mL
- 质谱定量:肽段覆盖率≥50%
- 绝对拷贝数:变异系数≤5%
- 泊松分布分析:分区≥20000
- 稀有变异检测:检测限≤0.1%
- 敲除效率:≥80%
- 插入缺失分析:indel频率≥5%
- 脱靶效应评估:脱靶率≤1%
- 甲基化水平:β值范围0-1
- 基因表达相关性:r≥0.7
- 差异甲基化区域:DMR覆盖率≥90%
检测范围
1.细胞培养样本:涵盖哺乳动物细胞系如HEK293,重点检测生长因子相关基因表达动态变化。
2.组织活检样本:包括肿瘤或正常组织切片,侧重癌基因或抑癌基因的差异表达分析。
3.血液样本:全血或血清样本,焦点于免疫响应基因如细胞因子表达监控。
4.植物样本:叶片或根部组织,强调应激响应基因如干旱诱导因子表达。
5.微生物样本:细菌或真菌培养物,检测病原体耐药基因表达水平。
6.动物模型样本:转基因小鼠器官,评估特定基因过表达或敲除效果。
7.环境样本:土壤或水体微生物群落,分析功能基因表达多样性。
8.法医学样本:毛发或唾液,检测个体特异性基因表达标记。
9.药物处理样本:体外药物暴露细胞,监测药效相关基因表达变化。
10.发育生物学样本:胚胎或干细胞,聚焦发育阶段基因表达时序分析。
检测方法
国际标准:
- ISO20395:2019分子体外诊断检测性能评价方法
- ISO17025:2017检测和校准实验室能力的一般要求
- ENISO15189:2022医学实验室质量和能力要求
- ISO13485:2016医疗器械质量管理体系用于法规的要求
- ISO9001:2015质量管理体系要求
- GB/T37869-2019核酸定量检测方法通则
- GB/T34796-2017分子生物学检测用试剂盒通用技术要求
- GB/T27401-2008实验室质量控制规范
- GB/T15481-2015检测和校准实验室能力认可准则
- GB/T35428-2017高通量测序数据分析质量控制
检测设备
1.实时荧光定量PCR仪:QuantStudio5(检测通道:6个,动态范围0.01-1000ng)
2.高通量测序仪:NovaSeq6000(通量:20Breads/run,读长2x150bp)
3.分光光度计:NanoDrop2000(波长范围:190-840nm,精度±1%)
4.离心机:Centrifuge5418R(转速:18000rpm,容量24x1.5mL)
5.电泳系统:GelDocXR+(分辨率:2.0MP,凝胶类型琼脂糖)
6.生物分析仪:2100Bioanalyzer(芯片类型:RNANano,检测限0.1ng/μL)
7.显微镜:BX53(放大倍数:1000x,数值孔径0.9)
8.恒温培养箱:INCOmed(温度范围:4-60°C,稳定性±0.1°C)
9.自动核酸提取仪:QIAcube(样本容量:12,提取效率≥95%)
10.冷冻离心机:AvantiJXN-26(温度:-20°C,最大速度26000rpm)
11.数字PCR系统:QX200(分区数:20000,灵敏度0.001%)
12.质谱仪:QExactiveHF(分辨率:240000,质量精度<3ppm)
13.微孔板阅读器:SpectraMaxi3x(检测模式:荧光、吸光,波长200-1000nm)
14.恒温混匀仪:ThermoMixerC(温度范围:-10-100°C,振荡频率3000rpm)
15.超低温冰箱:JianCeTFreezer(温度:-80°C,容量700L)