检测项目
特异性检测:
- 甲基化阳性率:≥95%(参照ISO17025)
- 非甲基化抑制率:≤5%
- 交叉反应性:无非特异性扩增
- 检测下限:0.1%甲基化DNA
- 定量范围:0.1%-100%甲基化水平
- 稀释系列线性:R²≥0.98
- 批内变异系数:CV≤5%
- 批间变异系数:CV≤10%
- 扩增效率:90%-110%
- 甲基化水平偏差:±2%
- 阳性符合率:≥98%
- 阴性符合率:≥95%
- 最低DNA输入量:1ng
- 扩增产物浓度:≥10ng/μL
- 背景噪声控制:≤2%假阳性
- 降解样本恢复率:≥85%
- 抑制剂耐受:血红素≤1mg/mL
- pH适应范围:7.0-8.5
- 引物保存期:-20°C下≥12个月
- 酶活性保持:≥95%活性
- 缓冲液有效期:室温下≥6个月
- 退火温度精度:±0.5°C
- 变性温度稳定性:94°C±1°C
- 延伸时间误差:±5秒
- 扩增曲线阈值:Ct值≤35
- 熔解曲线峰宽:≤1°C
- 数据归一化:内参基因ΔΔCt法
- 阳性对照验证:100%检出率
- 阴性对照验证:0%假阳性
- 空白对照:无污染信号
检测范围
1.细胞培养DNA:涵盖HeLa、HEK293等细胞系,检测重点为培养过程甲基化漂移验证
2.组织切片DNA:包括福尔马林固定石蜡包埋样本,侧重DNA提取纯度与扩增抑制物清除
3.血液样本DNA:全血或血清来源,重点检测白细胞甲基化水平与溶血干扰排除
4.唾液样本DNA:口腔脱落细胞,关注细菌污染控制与低浓度DNA扩增
5.尿液样本DNA:泌尿系统细胞,检测重点为尿素抑制效应与甲基化位点稳定性
6.FFPE组织DNA:病理存档样本,侧重交联DNA修复与扩增效率优化
7.植物DNA:如拟南芥叶片,重点检测多糖杂质去除与甲基化模式验证
8.细菌DNA:研究用菌株,关注基因组甲基化同源性分析
9.法医样本DNA:微量或降解样本,检测重点为STR位点甲基化关联性
10.古DNA样本:考古来源,侧重脱氨基损伤校正与污染监控
检测方法
国际标准:
- ISO20395-2019分子诊断检测验证要求
- ISO17025-2017检测实验室能力要求
- CLSIMM19-A核酸扩增方法验证指南
- GB/T27417-2017合格评定分子检测方法验证
- GB/T34796-2017核酸扩增检测方法通则
- YY/T1596-2017甲基化检测试剂盒技术要求
检测设备
1.热循环PCR仪:AppliedBiosystems9700型(温度范围4°C-99°C,精度±0.1°C)
2.实时荧光定量PCR仪:Bio-RadCFX96型(检测通道6个,灵敏度0.1拷贝)
3.电泳设备:ThermoFisherE-Gel系统(电压范围50-150V,分辨率≤10bp)
4.分光光度计:NanoDropOneC型(波长260/280nm,检测限0.2ng/μL)
5.离心机:Eppendorf5424R型(转速14,000rpm,温控4°C-40°C)
6.恒温器:GrantInstrumentsJB系列(温度稳定性±0.2°C,范围20°C-100°C)
7.凝胶成像系统:SyngeneGBox(CCD分辨率5MP,曝光时间1-60秒)
8.DNA提取仪:QIAGENQiacube(通量12样本,提取效率≥90%)
9.微量移液器:GilsonPipetmanL型(体积范围0.1-1000μL,精度±1%)
10.恒温水浴:MemmertWNB14(温度精度±0.1°C,容量14L)
11.生物分析仪:Agilent2100型(片段分析范围25-12,000bp,CV≤5%)
12.测序仪:IlluminaMiSeq(读长2x300bp,通量25Mreads)
13.温控设备:VWRScientific1260型(梯度温控±0.3°C,程序存储10个)
14.数据记录仪:OmegaEngineeringRDXL系列(采样率1Hz,存储容量2GB)
15.振荡器:IKAKS260型(转速50-1500rpm,振幅3mm)