检测项目
1.基因组DNA整体甲基化水平(5-mC含量0.1%-30%,检测限0.05%)
2.特定基因启动子区域甲基化状态(CpG岛覆盖率≥98%,分辨率1bp)
3.全基因组甲基化测序(测序深度≥30X,比对率≥95%)
4.羟甲基化与甲酰胞嘧啶定量分析(动态范围0.01-10nmol/mg)
5.血浆游离DNA甲基化标志物筛查(灵敏度0.1%,特异性≥99%)
检测范围
1.人类全血/血清/血浆样本
2.石蜡包埋组织切片(FFPE)
3.原代细胞与细胞系培养物
4.植物基因组DNA提取物
5.微生物宏基因组样本
检测方法
1.亚硫酸氢盐测序法(ISO17025:2017,GB/T37872-2019)
2.甲基化特异性PCR(GB/T30989-2014)
3.高效液相色谱-质谱联用(ASTME2820-11)
4.焦磷酸测序定量法(ISO/IEC17025:2005)
5.甲基化芯片分析(IlluminaInfiniumHD技术规范)
检测设备
1.IlluminaNovaSeq6000测序系统(全基因组甲基化分析)
2.ThermoQExactiveHF-X质谱仪(精确质量数测定)
3.Agilent4200TapeStation系统(DNA完整性评估)
4.EppendorfMastercyclerX50PCR仪(温度精度0.1℃)
5.QiagenPyroMarkQ48Autoprep焦磷酸测序仪
6.Bio-RadCFX96实时荧光定量PCR系统
7.CovarisM220超声破碎仪(DNA片段化控制)
8.NanodropOne超微量分光光度计(样品纯度检测)
9.BeckmanCoulterBiomeki7自动化工作站
10.OxfordNanoporeGridION测序平台(长读长甲基化分析)