检测项目
1.DNA复制起始点定位:采用qPCR/NGS技术测定Ori区域坐标(50bp精度)
2.起始点活性验证:通过荧光素酶报告系统测量启动子活性(RLU≥10^4)
3.拷贝数变异分析:数字PCR定量检测单位基因组内复制起点数量(CV≤5%)
4.蛋白质结合位点鉴定:ChIP-seq测定起始识别复合体结合强度(IP效率≥70%)
5.甲基化状态评估:亚硫酸氢盐测序分析CpG岛甲基化水平(覆盖深度≥30)
检测范围
1.哺乳动物细胞系(HEK293、HeLa等)染色体DNA
2.原核生物质粒载体(pUC19、pET系列等)
3.临床分离病原微生物基因组(HPV16/18、EBV等)
4.PCR扩增产物(长度100bp-10kbp)
5.合成生物学构建体(BAC/YAC文库)
检测方法
ASTME3132-18核酸定量分析标准指南
ISO20395:2019生物技术-核酸靶序列定量要求
GB/T30988-2014DNA拷贝数变异检测技术规范
GB/T37872-2019高通量测序数据质量评价指南
ENISO21571:2005食品微生物学-核酸提取方法
检测设备
1.ThermoFisherQuantStudio6Pro:实时荧光定量PCR(分辨率0.01℃)
2.IlluminaNovaSeq6000:高通量双端测序(PE150模式)
3.Agilent4200TapeStation:核酸片段分析(灵敏度0.1ng/μL)
4.Bio-RadQX200DropletDigitalPCR:绝对定量系统(线性范围0.1%-100%)
5.NanoDropOneCUV-Vis分光光度计:核酸纯度测定(A260/A280比值)
6.CovarisM220Focused-ultrasonicator:DNA片段化仪(精度5bp)
7.EppendorfMastercyclerX50:梯度PCR仪(升温速率6℃/s)
8.MiltenyiBiotecMACSQuantTyto:细胞分选系统(分选纯度≥99%)