质体基因组检测概述:检测项目1.叶绿体基因组结构分析:IR区长度测定(114-160kbp)、基因排列顺序验证、反向重复区完整性评估2.线粒体基因组组装质量检测:contigN50值≥100kb、环状结构闭合验证、异质性位点识别(阈值0.5%)3.功能基因注释验证:rbcL/atpB/matK等核心基因覆盖度≥99%、ORF预测准确性检验4.重复序列特征分析:SSR位点识别(≥10个重复单元)、长片段重复序列(≥50bp)定位5.SNP/InDel变异筛查:单核苷酸多态性分辨率≤1%、插入缺失长度检测范围1-50bp检测范围
注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).
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1.叶绿体基因组结构分析:IR区长度测定(114-160kbp)、基因排列顺序验证、反向重复区完整性评估
2.线粒体基因组组装质量检测:contigN50值≥100kb、环状结构闭合验证、异质性位点识别(阈值0.5%)
3.功能基因注释验证:rbcL/atpB/matK等核心基因覆盖度≥99%、ORF预测准确性检验
4.重复序列特征分析:SSR位点识别(≥10个重复单元)、长片段重复序列(≥50bp)定位
5.SNP/InDel变异筛查:单核苷酸多态性分辨率≤1%、插入缺失长度检测范围1-50bp
1.高等植物叶片样本:适用于被子植物/裸子植物的系统发育研究
2.藻类全细胞样本:涵盖绿藻门/红藻门/褐藻门的分类鉴定
3.农作物种子样本:水稻/小麦/玉米等作物的品种纯度验证
4.中药材原料:人参/黄芪/当归等药用植物的基源鉴定
5.转基因作物材料:外源基因插入位点的质体定位分析
ISO17025:2017《检测和校准实验室能力的通用要求》
GB/T34796-2017《核酸提取纯化试剂盒质量评价技术规范》
ASTME3136-18《全基因组测序数据质量评估标准》
IlluminaNovaSeqPE150双端测序方案(读长2150bp)
PacBioSequelII三代测序技术(CCS模式≥Q30)
1.IlluminaNovaSeq6000:高通量双通道测序仪,通量20Breads/run
2.PacBioSequelII:长读长测序系统,平均读长10-25kb
3.Qubit4.0Fluorometer:核酸浓度精确定量(检测限0.1ng/μL)
4.Agilent4200TapeStation:DNA完整性评估(DIN值≥7.0)
5.CovarisM220超声破碎仪:DNA片段化控制(目标片段500bp)
6.OxfordNanoporeGridIONX5:实时纳米孔测序装置
7.ABI3500xLGeneticAnalyzer:Sanger法验证平台
8.EppendorfMastercyclerX50s:PCR扩增系统(温控精度0.1℃)
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。
以上是与质体基因组检测相关的简单介绍,具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。