检测项目
1.全基因组测序(WGS):覆盖深度≥30,单碱基准确率≥99.9%,插入片段长度100-500bp
2.靶向区域测序(PanelSequencing):覆盖500+疾病相关基因区域,灵敏度达0.1%突变频率
3.SNP/InDel分析:可识别≥3bp插入缺失及单核苷酸多态性(MAF≥1%)
4.病原微生物宏基因组测序:检出限≤50CFU/mL,物种注释分辨率达种水平
5.表观遗传学分析:包括DNA甲基化(覆盖≥850,000CpG位点)及组蛋白修饰检测
检测范围
1.人类临床样本:外周血、组织切片、FFPE样本及循环肿瘤DNA(ctDNA)
2.动植物遗传材料:种子种质资源鉴定、品种真实性验证及转基因成分分析
3.微生物培养物:细菌16SrRNA全长测序、真菌ITS区序列测定及病毒全基因组组装
4.环境样本:土壤/水体宏基因组中微生物群落结构解析及功能基因筛查
5.法医物证:STR分型(包含23个常染色体位点)及线粒体DNA超变区测序
检测方法
1.ISO/IEC17025:2017《检测和校准实验室能力的通用要求》
2.ISO20395:2018《生物技术-核酸测序用文库制备技术要求》
3.GB/T30988-2014《高通量基因测序技术规程》
4.GB/T34796-2017《核酸定量测定-紫外分光光度法》
5.ASTME3136-18《二代测序数据分析标准指南》
检测设备
1.IlluminaNovaSeq6000:双流动槽设计,单次运行输出量达6Tb,适用于全基因组测序
2.ThermoFisherIonS5XL:半导体测序技术,支持500bp长读长靶向测序
3.ABI3500xL基因分析仪:毛细管电泳平台,完成STR分型及片段分析
4.Agilent4200TapeStation:自动化电泳系统,进行DNA/RNA完整性评估(RIN≥7)
5.Qubit4.0Fluorometer:高灵敏度核酸定量仪,检测范围0.1-60ng/μL
6.CovarisM220Focused-ultrasonicator:DNA片段化仪,CV值≤5%的片段控制
7.BeckmanCoulterBiomeki7:自动化液体处理工作站,移液精度1%
8.OxfordNanoporeGridIONX5:实时单分子测序系统,支持超长读长(N50>100kb)
9.RocheLightCycler480II:实时荧光定量PCR仪,用于文库质控及拷贝数变异验证
10.EppendorfCentrifuge5430R:高速冷冻离心机,最大RCF达30,130g