单细胞变异体检测概述:检测项目1.单细胞基因组异质性分析:覆盖SNV(单核苷酸变异)、CNV(拷贝数变异)及SV(结构变异)检测,分辨率达0.1%突变频率2.转录组层面基因表达差异:检测≥20,000个基因的表达量差异阈值设定为log2FC≥1.5且p值<0.053.表观遗传学特征解析:包括5mC甲基化水平(覆盖CpG位点≥1M)、染色质开放性区域(ATAC-seq峰值≥50,000)4.蛋白质组表达丰度验证:采用质谱法检测低至1fg/μL的蛋白浓度5.代谢组小分子定量分析:可识别>500种代谢物种类(LC-MS/MS动态范围
注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).
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1.单细胞基因组异质性分析:覆盖SNV(单核苷酸变异)、CNV(拷贝数变异)及SV(结构变异)检测,分辨率达0.1%突变频率
2.转录组层面基因表达差异:检测≥20,000个基因的表达量差异阈值设定为log2FC≥1.5且p值<0.05
3.表观遗传学特征解析:包括5mC甲基化水平(覆盖CpG位点≥1M)、染色质开放性区域(ATAC-seq峰值≥50,000)
4.蛋白质组表达丰度验证:采用质谱法检测低至1fg/μL的蛋白浓度
5.代谢组小分子定量分析:可识别>500种代谢物种类(LC-MS/MS动态范围1-10^6)
1.临床样本:外周血单个核细胞(PBMC)、实体瘤组织切片(≥5μm厚度)、骨髓穿刺液
2.细胞培养物:原代培养细胞(存活率≥90%)、永生化细胞系(传代次数≤20)
3.微生物样本:细菌单细胞(直径0.5-5μm)、真菌孢子悬液(浓度110^6CFU/mL)
4.生物制品:CAR-T治疗产品(CD3+纯度≥95%)、病毒载体转导效率验证
5.环境样本:水样/土壤中微生物单细胞(过滤孔径0.22μm)
ISO20391-2:2017《单细胞测序技术流程规范》
ASTME3060-23《流式细胞术单细胞分选质量控制标准》
GB/T37875-2019《单细胞基因组扩增技术规范》
ISO/IEC17025:2017《单细胞测序数据质控体系》
GB4789.15-2023《微生物单细胞分离培养方法》
1.IlluminaNovaSeq6000:双通道流动槽实现单细胞文库≥200Gb数据产出
2.BDFACSAriaIII:配备7激光器系统实现30参数同步检测及分选纯度>99%
3.10xGenomicsChromiumX:支持百万级单细胞捕获与多组学联合分析
4.ThermoFisherQExactiveHF-X:分辨率达240,000的蛋白质组学质谱仪
5.Agilent6495CTripleQuadrupoleLC/MS:动态范围达6个数量级的代谢物定量
6.NanostringGeoMxDSP:空间转录组学组织切片800μmROI定位精度
7.OxfordNanoporePromethION48:实时超长读长测序(N50>100kb)
8.BeckmanCoulterCytoFLEXLX:13色荧光通道的单细胞表型分析系统
9.MGIDNBSEQ-T7:单日数据产出达6Tb的高通量测序平台
10.FluidigmC1HT:集成式微流控芯片实现800单细胞/次自动捕获
报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。
检测周期:7~15工作日,可加急。
资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。
标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。
非标测试:支持定制化试验方案。
售后:报告终身可查,工程师1v1服务。
以上是与单细胞变异体检测相关的简单介绍,具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。