检测项目

1.DNA甲基化分析：CpG岛覆盖率≥98%，单碱基分辨率≤0.1%，覆盖范围5mC/5hmC/5fC/5caC。

2.组蛋白修饰定量：H3K4me3/H3K27ac等12种修饰类型，质谱灵敏度≤1fmol。

3.RNAm6A甲基化检测：m6A位点识别精度2nt，定量误差≤5%。

4.染色质可及性评估：ATAC-seq测序深度≥50Mreads/样本。

5.长链非编码RNA调控验证：CLIP-seq结合位点重复性R≥0.95。

检测范围

1.临床样本：全血/组织切片/FFPE样本（肿瘤标志物验证）。

2.细胞模型：原代细胞/永生化细胞系（表观遗传机制研究）。

3.基因编辑产物：CRISPR/Cas9修饰细胞（脱靶效应评估）。

4.生物制药：重组蛋白/疫苗（翻译后修饰质量控制）。

5.模式生物：小鼠/斑马鱼胚胎（发育表观遗传学分析）。

检测方法

1.DNA甲基化：ISO20395:2018（全基因组亚硫酸盐测序），GB/T30987-2014（焦磷酸测序验证）。

2.组蛋白修饰：ASTME3066-16（质谱定量），ISO21348:2021（ChIP-seq标准化流程）。

3.RNA修饰：GB/T36053-2018（m6A-seq建库规范），ISO21572:2019（LC-MS/MS确证）。

4.染色质结构：ENCODEConsortium标准（ATAC-seq数据质控），GB/T37873-2019（Hi-C实验指南）。

5.功能验证：ISO10993-22:2017（报告基因活性测试），ASTMF2998-14（RNA干扰效率评估）。

检测设备

1.IlluminaNovaSeq6000：双通道S4流动槽，通量≥2400Gb/run（全基因组甲基化测序）。

2.ThermoFisherQExactiveHF-X：分辨率240,000FWHM（组蛋白修饰质谱定量）。

3.Agilent4200TapeStation：DNA/RNA完整性指数DIN≥8.5/RIN≥9.0。

4.NanoStringGeoMxDSP：单次实验分析＞1000个ROI（空间表观组学）。

5.PacBioSequelIIe：读长≥50kb（甲基化单分子实时测序）。

6.Bio-RadCFX96Touch：qPCR扩增效率90-110%（靶向甲基化验证）。

7.PerkinElmerChemiDocMP：化学发光灵敏度＜1pg（Westernblot定量）。

8.OxfordNanoporeGridIONX5：直接检测5mC修饰（无需亚硫酸盐处理）。

9.BeckmanCoulterCytoFLEXLX：13激光38色配置（单细胞表观表型分析）。

10.BrukertimsTOFPro2：PASEF模式采集速度＞120Hz（翻译后修饰鉴定）。