检测项目
扩增性能检测:
- 扩增效率:Efficiency(90-110%)、阈值循环(Ct值变异系数≤5%,参照MIQE指南)
- 动力学范围:线性动态范围(LDR≥6logs)、平台期荧光强度
- 熔解曲线分析:Tm值(标准偏差≤0.5°C)、非特异性扩增阴性率≥95%
- 交叉反应测试:阴性对照无信号、同源序列干扰评估
- 检测限:LOD(copynumber≤10)、定量限LOQ(RSD≤20%)
- 低丰度样本响应:信号/噪声比≥3
- 标准曲线:R²≥0.99、斜率(-3.1至-3.6)
- 重复性验证:批内RSD≤10%、批间RSD≤15%
- 操作员间差异:CV≤12%、实验室间一致性
- 日间变异性:Ct值偏移≤1cycle
- 试剂稳定性:-20°C储存性能变化≤10%、冻融循环耐受性
- 样品稳定性:RNA完整性RIN≥7、DNA降解率≤5%
- Tm匹配:探针与引物Tm差≤5°C、浓度梯度优化
- 二级结构预测:自由能ΔG≥-5kcal/mol
- 核酸纯度:A260/A280比值(1.8-2.0)、A260/A230≥1.8
- 浓度测定:ng/μL偏差±10%
- 环境监控:阴性对照扩增阴性、气溶胶污染检测
- 系统空白:无模板对照(NTC)无Ct值
- 基线校正:自动/手动设置、阈值确定算法
- 扩增曲线拟合:指数期识别、PCR效率计算
检测范围
1.临床血液样本:检测病毒载量(如HIV、HJianCe),重点在于低浓度核酸提取效率和敏感性验证。
2.组织活检样本:肿瘤基因表达分析(如mRNA水平),侧重RNA完整性及降解控制。
3.环境水样:病原体监测(如大肠杆菌),核心检测水体污染物核酸富集方法。
4.食品样本:转基因成分定量(如大豆CP4-EPSPS),重点检测加工食品核酸稳定性。
5.法医样本:DNA定量(如STR分型),强调微量样本扩增成功率。
6.植物样本:病原真菌检测(如稻瘟病菌),核心评估植物组织抑制剂影响。
7.动物样本:传染病诊断(如禽流感病毒),侧重样品均质化及抑制物去除。
8.细胞培养物:基因沉默效率(如siRNA),重点检测转染后RNA回收率。
9.土壤样本:微生物丰度分析(如16SrRNA),核心优化腐殖酸干扰消除。
10.空气样本:气溶胶病毒监测(如SARS-CoV-2),侧重采样介质兼容性及低拷贝检测。
检测方法
国际标准:
- ISO20395:2019生物技术-核酸定量-实时荧光PCR方法
- ISO17822:2020体外诊断-微生物核酸检测性能评价
- GB/T37875-2019核酸定量检测方法-实时荧光PCR法
- GB/T34796-2017病毒核酸检测技术规范
检测设备
1.实时荧光定量PCR仪:CFX96型(温度范围:4-99°C,精度±0.1°C)
2.分光光度计:NanoDropOne型(波长190-840nm,检测限0.2ng/μL)
3.微量离心机:5424型(最大转速15000rpm,容量24×1.5mL)
4.恒温混匀器:ThermomixerC型(温度范围-10-99°C,振荡速度300-1500rpm)
5.超低温冰箱:DW-86L338型(温度-86°C,容积338L)
6.生物安全柜:A2型(气流速度0.5m/s,HEPA过滤效率99.99%)
7.微量移液器:Researchplus型(量程0.1-1000μL,精度±0.5%)
8.PCR板封膜机:Microseal'B'型(密封温度150-180°C,压力5-15psi)
9.核酸提取仪:QIAcube型(通量1-12样本,提取时间≤30分钟)
10.恒温水浴锅:WB-6型(温度范围室温-100°C,稳定性±0.2°C)
11.电泳系统:Mini-PROTEAN型(电压10-300V,胶浓度1-4%)
12.数据分析工作站:QuantStudio型(软件兼容ISO标准曲线拟合)
13.真空浓缩仪:SpeedVac型(温度范围室温-60°C,真空度<5mbar)
14.振荡培养箱:Innova42型(温度范围5-50°C,转速50-300rpm)
15.纯水系统:Milli-Q型(电阻率