种子抗旱性分子检测

检测项目

基因表达检测：

• 干旱响应基因表达量：相对表达水平（RT-qPCR，参照ISO20184）
• 转录因子活性：DNA结合能力测定（EMSA实验）
• microRNA表达谱：差异表达倍数（|log2FC|≥1.5）

蛋白质组学分析：

• 胁迫响应蛋白表达：丰度定量（Westernblot，检测限0.1ng）
• 磷酸化状态检测：磷酸化位点占比（免疫沉淀-质谱分析）
• 蛋白互作网络：互作评分（STRING数据库参照）

代谢物检测：

• 渗透调节物质：脯氨酸含量（μg/gDW，参照GB/T5009.XX）
• 抗氧化酶活性：SOD、POD活性（U/mgprotein）
• 次生代谢产物：黄酮类累积量（HPLC测定）

分子标记验证：

• SSR标记关联分析：多态性位点检出率（≥95%）
• SNP基因分型：等位基因频率（MAF≥0.05）
• InDel标记筛选：插入缺失长度（bp级精度）

酶活性测定：

• 过氧化物酶（POD）：酶活单位（参照ISOJianCe64）
• 超氧化物歧化酶（SOD）：抑制率法测定（≥80%）
• 过氧化氢酶（CAT）：底物消耗速率（μmol/min/mg）

细胞信号检测：

• ABA激素浓度：ELISA测定（pg/mgFW）
• 钙离子流动态：荧光探针响应（Ratio变化≥20%）
• ROS水平检测：H2O2累积量（μmol/g）

转录组分析：

• RNA-seq测序：差异表达基因筛选（FDR<0.05）
• 基因富集分析：GO、KEGG通路显著度（P≤0.01）
• 可变剪接事件：剪接异构体比例（≥5%）

表观遗传检测：

• DNA甲基化水平：甲基化比率（BS-seq测定）
• 组蛋白修饰：乙酰化修饰丰度（ChIP-qPCR）
• 非编码RNA调控：lncRNA表达量（≥2倍变化）

种子生理指标：

• 发芽率：干旱胁迫下发芽百分比（≥60%）
• 根系生长参数：根长测量（cm级精度）
• 幼苗存活率：水分缺失耐受度（%）

生物信息学分析：

• 抗旱候选基因预测：系统发育树构建（NJ法）
• 基因共表达网络：相关系数（r≥0.8）
• 表型关联分析：QTL定位精度（cM级）

检测范围

1.禾本科作物种子：包括小麦、水稻、玉米，重点检测DREB转录因子表达与抗旱关联

2.豆科植物种子：如大豆、豌豆，侧重ABA信号通路响应与氮代谢检测

3.蔬菜种子：番茄、辣椒等，关注脯氨酸积累量与耐旱性评估

4.经济作物种子：棉花、向日葵，聚焦酶活性变化与干旱胁迫耐受

5.林木种子：松树、桉树等，重点在长期干旱下的分子适应机制

6.药用植物种子：人参、黄芪，检测次生代谢产物对抗旱性的贡献

7.草种：草坪草、牧草，侧重根系发育基因表达与水分利用效率

8.花卉种子：玫瑰、菊花等，研究开花期抗旱相关分子标记

9.谷物种子：大麦、高粱，检测种子储藏蛋白与干旱响应关联

10.遗传资源种子：野生亲缘种，用于抗旱基因挖掘与多样性分析

检测方法

国际标准：

• ISO20184:2020分子生物学定量检测通则
• ISO5667-19:202X植物样品前处理规范
• ISOJianCe64:2015酶活性测定方法
• ISO21571:2020核酸提取与纯化标准

国家标准：

• GB/T3543.5-2020种子检验规程发芽试验
• GB/T5009.XX-202Y植物激素测定方法
• GB/T20300-202Z蛋白质组学分析通则
• GB/T19630-202W代谢物检测技术规范

（国际标准ISO20184强调高通量检测流程，而国家标准GB/T3543.5更注重基础样品处理校准；ISOJianCe64规定酶活单位计算，GB/T5009.XX引入特异性缓冲体系差异）

检测设备

1.荧光定量PCR仪：AppliedBiosystems7500（检测范围1-10^9copies，准确性±0.2%）

2.液相色谱-质谱联用仪：Agilent1290-6495（分辨率0.1Da，灵敏度fg级）

3.蛋白电泳系统：Bio-RadMini-PROTEAN（电压范围50-500V，凝胶孔径0.45μm）

4.酶标仪：ThermoFisherMultiskanGO（波长范围340-850nm，OD精度±0.01）

5.超高效液相色谱仪：WatersACQUITYUPLC（流速0.001-5mL/min，柱温控制±0.1°C）

6.DNA测序仪：IlluminaNovaSeq6000（通量高达20Tb/run，读长2x150bp）

7.冷冻离心机：Eppendorf5430R（转速max30,000rpm，温度范围-20°C至40°C）

8.生物分析仪：Agilent2100Bioanalyzer（RNA完整性检测，RIN≥8.0）

9.显微成像系统：ZeissAxioObserver（分辨率0.2μm，放大倍数40-1000x）

10.气候模拟箱：ConvironPGR15（温湿度控制精度±0.5°C，光照强度0-1000μmol/m²/s）

11.紫外分光光度计：ShimadzuUV-2600（波长范围190-1100nm，带宽1nm）

12.凝胶成像系统：Bio-RadChemiDoc（动态范围4.8OD，像素分辨率5MP）

13.振荡培养箱：NewBrunswickInnova42（转速50-400rpm，容量4L）

14.自动化工作站：HamiltonMicrolabSTAR（移液精度±0.1μL，样品通量96孔）

15.核酸提取仪：QIAGENQIAcube（处理量1-96样品，回收率≥95%）

北检(北京)检测技术研究院【简称：北检院】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。

以上是与"种子抗旱性分子检测"相关的简单介绍，具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。