检测项目
1.质粒浓度测定:紫外分光光度法测定A260/A280比值(1.8-2.0),荧光定量法检测灵敏度≥0.2ng/μL
2.超螺旋结构比例:琼脂糖凝胶电泳分析(0.8%凝胶),毛细管电泳法分辨率≤10bp
3.宿主DNA残留量:qPCR定量检测限≤0.1ng/mg质粒DNA
4.内毒素水平:鲎试剂法测定EU/mg值(标准≤10EU/μg)
5.抗生素抗性验证:LB平板培养法(卡那霉素50μg/mL,氨苄青霉素100μg/mL)
检测范围
1.克隆载体质粒:pUC系列、pET系列等大肠杆菌表达载体
2.病毒包装质粒:腺相关病毒(AAV)辅助质粒系统
3.CRISPR基因编辑质粒:sgRNA表达载体及Cas9载体
4.重组蛋白表达质粒:哺乳动物细胞表达载体(如pcDNA3.1)
5.疫苗开发用质粒:DNA疫苗载体(含强启动子元件)
检测方法
ISO21571:2005食品微生物学-核酸提取方法(质粒纯化)
ASTME3027-15超螺旋DNA定量分析标准指南
GB/T34796-2017质粒DNA提取试剂盒检测通则
GB4789.41-2020食品微生物检验肠杆菌科检验(宿主菌检测)
ISO11737-1:2018灭菌过程生物负载测定(内毒素检测)
检测设备
1.NanoDropOne超微量分光光度计:波长范围190-850nm,样品量1-2μL
2.Agilent4200TapeStation系统:DNA完整性分析(DIN值≥7.0)
3.ThermoFisherQubit4.0荧光计:高灵敏度核酸定量(dsDNAHS检测试剂盒)
4.Bio-RadCFX96实时定量PCR仪:宿主残留DNA定量(SYBRGreen法)
5.Eppendorf5430高速离心机:最大转速30,000rpm(质粒沉淀分离)
6.GEHealthcareKTApure层析系统:亲和层析法纯化质粒DNA
7.LonzaResolute电泳仪:脉冲场电泳分析大分子量质粒
注意事项
1.BSL-2级实验室操作含抗生素抗性基因的质粒材料
2.DNase/RNase-free环境进行电泳及PCR相关实验
3.长期储存应使用TE缓冲液(pH8.0)于-80℃冻存
4.酶切验证需设置未酶切对照及分子量标准品对照
5.内毒素检测前需进行样品预处理(离子交换去除干扰物)