可送检的样品类型与对应检测项目
| 样品类型 | 典型应用场景 | 主要检测项目 | 常用方法 / 参考 |
|---|---|---|---|
| 人源肿瘤细胞系 | HeLa、HepG2、A549、MCF-7、K562等传代培养、冻存复苏与实验室间转移 | 细胞系身份鉴定、误鉴与交叉污染排查、STR分型图谱建档 | 16-24个STR基因座复合扩增+毛细管电泳分型,参照ANSI/ATCC ASN-0002 |
| 人源胚肾与永生化细胞系 | HEK293、293T、HaCaT等稳转株建库与放行检验 | 主细胞库与工作细胞库身份一致性、性别基因座核对 | STR图谱比对,等位基因匹配率≥80%判为同源,辅以Amelogenin核对 |
| 动物源生产细胞系 | CHO-K1、CHO-S、BHK21、Vero等重组蛋白与疫苗表达体系 | 种属鉴别、人源与鼠源交叉污染排查、细胞库代次一致性 | 种属特异性STR复合扩增与人源图谱联合判定,参照ICH Q5D框架 |
| 干细胞与原代培养物 | 骨髓与脐带来源MSC、iPSC及其分化产物的批次放行 | 身份溯源、批次间一致性、供体来源核对 | STR基因座分型与已知供体参照图谱逐一比对 |
| 生物制品细胞基质 | 主细胞库、工作细胞库、生产终末期细胞的鉴定与稳定性监测 | 细胞基质身份鉴定、代次漂移评估 | 药典三部细胞基质检定相关通则要求下的STR指纹图谱 |
| 司法与法医生物检材 | 血斑、口腔拭子、组织切片等DNA检材的个体识别 | 个体识别与亲权关系分析的STR分型 | 复合STR扩增体系,参照SF/Z JD0105001-2016技术规范 |
检测项目
1. STR复合扩增分型:单次扩增16-24个基因座,目标等位基因片段范围约80-350bp
2. 图谱一致性判定:两份图谱等位基因匹配率≥80%判为同一来源,56%-79%属可疑区间需复核
3. 性别基因座核对:Amelogenin同源序列同步扩增,确认X或Y来源与细胞谱系记载相符
4. 种属间污染排查:人源与鼠源特异性基因座联合扩增,识别低比例种属交叉污染
5. 扩增均衡性控制:杂合基因座两等位基因峰高比通常≥0.6,stutter峰比例≤15%予以过滤
6. 检测灵敏度:模板DNA 0.5-1ng可获得完整图谱,0.05-0.1ng仍可检出部分等位基因
检测范围
1. 人源肿瘤细胞系:HeLa、HepG2、A549、MCF-7、K562、Jurkat等
2. 人源胚肾与永生化细胞系:HEK293、293T、HaCaT、IMR90等
3. 动物源细胞系:CHO-K1、CHO-S、BHK21、Vero、SP2/0等
4. 干细胞制剂:骨髓与脐带来源MSC、iPSC及其分化产物
5. 生物制品细胞库:主细胞库、工作细胞库、限定代次内生产细胞
6. 司法生物检材:血斑、口腔拭子、组织切片等DNA检材
检测方法
1. ANSI/ATCC ASN-0002-2011 人源细胞系鉴定用短串联重复序列图谱法标准
2. ICH Q5D 生物技术产品的细胞基质衍生与鉴定指导原则
3. 《中华人民共和国药典》2020年版三部 生物制品生产用细胞基质检定相关通则
4. SF/Z JD0105001-2016 亲权鉴定技术规范,STR体系分型与似然率评估
5. ISBER《生物样本库最佳实践》(第四版) 细胞系入库与放行的STR鉴定要求
检测设备
1. 毛细管电泳遗传分析仪:8道毛细管阵列,片段分型分辨率达1bp
2. 梯度PCR扩增仪:96孔模块,温度控制精度±0.2℃,升降温速率≥6℃/s
3. 荧光定量PCR仪:5荧光通道,用于模板DNA定量与扩增体系质控
4. 微量紫外分光光度计:dsDNA检测范围2-15000ng/μL
5. 荧光核酸定量仪:检测下限达pg级,适配低浓度模板精确定量
6. 二级生物安全柜:A2型,下降风速0.36-0.54m/s,满足细胞无菌操作要求
7. 恒温金属浴:温度范围室温-100℃,用于95℃双链变性孵育
8. 高速台式离心机:最高转速15000rpm,最大相对离心力21000×g
9. 凝胶成像系统:配合琼脂糖电泳进行扩增产物完整性预检
10. 超低温储存箱:-86℃深低温保存DNA模板与细胞冻存管