可送检的样品类型与对应检测项目
| 样品类型 | 典型应用场景 | 主要检测项目 | 常用方法 / 参考 |
|---|---|---|---|
| 野生动物新鲜粪便 | 野外种群监测、栖息地生物多样性调查、食性研究辅助 | 动物物种鉴定、种属归属确认、物种溯源 | GB/T 43650-2024样品采集与储存要求;95%乙醇或硅胶干燥保存;线粒体12S rRNA、COI条形码区扩增测序 |
| 实验动物粪便 | 实验动物个体标识、笼位混养排查、遗传背景确认 | 个体识别、微卫星分型、亲缘关系分析 | NY/T 1673-2008微卫星分型规程;毛细管电泳片段分析 |
| 畜禽粪便 | 养殖场种群管理、引种检疫辅助、畜禽源性成分核查 | 牛、羊、猪、鸡、鸭、鹅等畜禽源成分定性 | GB/T 38164-2019实时荧光PCR法 |
| 宠物粪便 | 犬猫个体身份确认、繁育管理辅助 | 种属鉴定、个体基因型分析 | SN/T 4626-2016条形码操作规程;12S rRNA与Cytb基因测序 |
| 动物制品关联粪便样本 | 野生动物保护研究、种群归属溯源研究 | 粪便与制品DNA序列比对、物种一致性判定 | LY/T 2501-2015物种鉴定规范;序列相似度与系统发育分析 |
检测项目
1. 动物物种鉴定:线粒体COI基因条形码区658bp扩增测序,种级序列相似度≥98%~99%判定物种
2. 12S/16S rRNA基因片段分析:短片段扩增子100~300bp,适用于降解样本,属级相似度≥95%
3. 细胞色素b基因分析:Cytb片段307~464bp,支撑种级判定与系统发育关系分析
4. 微卫星分型:8~15个位点毛细管电泳,等位基因判读精度1bp,用于个体识别与亲缘分析
5. 粪便DNA质量评估:提取浓度0.1~10ng/μL,主片段分布100~400bp,A260/A280比值1.7~2.0
6. 畜禽源性成分定性:荧光PCR筛查牛、羊、猪、鸡、鸭、鹅等成分,检出限低至0.1%
检测范围
1. 野生动物粪便:鹿科、猫科、熊科等陆生哺乳动物及鸟类、爬行动物等
2. 畜禽粪便:猪、牛、羊、马、驴、鸡、鸭、鹅、兔等
3. 实验动物粪便:小鼠、大鼠、豚鼠、仓鼠、兔等
4. 宠物粪便:犬、猫等伴侣动物
5. 圈养及水生动物粪便:动物园圈养个体、鲸豚类等水生哺乳动物
检测方法
1. GB/T 43650-2024 野生动物及其制品DNA物种鉴定技术规程(2024年7月1日实施,规定样品采集储存、鉴定程序、结果表述与污染防控)
2. LY/T 2501-2015 野生动物及其产品的物种鉴定规范(鉴定原则、鉴定指标与程序要求)
3. GB/T 38164-2019 常见畜禽动物源性成分检测方法 实时荧光PCR法
4. SN/T 4626-2016 DNA条形码物种鉴定操作规程
5. NY/T 1673-2008 畜禽微卫星DNA遗传多样性检测技术规程
检测设备
1. 实时荧光定量PCR仪(Bio-Rad CFX96):96孔通量,控温精度±0.2℃,激发通道5个
2. 高通量测序仪(Illumina MiSeq):双端读长2×300bp,单次运行数据量大于15Gb
3. 毛细管电泳测序仪(Thermo Fisher 3500系列):24~96道毛细管,片段判读精度1bp
4. 普通PCR扩增仪(Bio-Rad T100):温控范围4~100℃,最大升降温速率5℃/s
5. 超微量分光光度计(Thermo NanoDrop One):检测浓度2~20000ng/μL,光程0.03~1.0mm
6. 荧光定量仪(Thermo Qubit 4):DNA浓度检测下限0.01ng/μL,适配低丰度模板定量
7. 凝胶成像分析系统(Bio-Rad GelDoc Go):DNA条带判读范围100~15000bp
8. 高速冷冻离心机:最大转速≥20000rpm,温控范围-20~40℃
9. 超低温冰箱:-86℃长期保存,腔体温度波动≤5℃
10. 生物安全柜:工作区洁净度达到ISO 5级,用于核酸提取防污染操作