检测项目
1.启动子活性强度测定:采用荧光素酶报告系统(Luminescence≥10000RLU/μg),β-半乳糖苷酶活性(OD420≥0.8)
2.融合基因长度验证:琼脂糖凝胶电泳(1%胶体浓度),DNA片段分辨率达50-10000bp
3.转录起始位点确认:5'RACE扩增(扩增效率≥90%),测序覆盖率≥30
4.核糖体结合位点(RBS)效率:GFP荧光强度测定(激发波长488nm/发射波长509nm)
5.终止子泄露率检测:反向转录定量PCR(Ct值差异≤3个循环)
检测范围
1.原核生物基因工程菌株(大肠杆菌/枯草芽孢杆菌)
2.真核表达载体(哺乳动物/昆虫细胞系统)
3.合成生物学标准化元件(BioBrick/iGEM标准部件)
4.重组质粒构建产物(插入片段≥15kb)
5.CRISPR-Cas9基因编辑系统调控单元
检测方法
1.ISO21571:2005分子生物学核酸提取规范
2.ASTME2148-18重组DNA构建体定量分析方法
3.GB/T34796-2017合成生物学元件功能验证指南
4.ISO20395:2018高通量测序质量控制系统要求
5.GB/T37872-2019荧光定量PCR技术通则
检测设备
1.ThermoFisherQuantStudio6Pro:实时荧光定量PCR仪(温度均一性0.25℃)
2.Agilent2100Bioanalyzer:核酸片段分析系统(灵敏度0.1ng/μL)
3.PromegaGloMaxDiscover:多功能酶标仪(动态范围6个数量级)
4.IlluminaNovaSeq6000:高通量测序平台(单次运行输出3TB数据)
5.EppendorfMastercyclerX50s:梯度PCR仪(升降温速率6℃/秒)
6.Bio-RadChemiDocMP:化学发光成像系统(像素分辨率4.2MP)
7.NanodropOneC:微量核酸定量仪(测量范围2-27000ng/μL)
8.BeckmanCoulterCytoFLEXS:流式细胞仪(检测灵敏度<100MESF)
9.AppliedBiosystems3500xL:基因分析仪(毛细管阵列长度50cm)
10.LI-COROdysseyCLx:红外荧光扫描仪(双色通道同步成像)