可送检的样品类型与对应检测项目
| 样品类型 | 典型应用场景 | 主要检测项目 | 常用方法 / 参考 |
|---|---|---|---|
| 近岸河口沉积物 | 入海排污口周边底质生物监测、海洋功能区本底调查 | 总核酸提取量、核酸浓度与纯度、宏基因组测序、原核微生物16S rRNA多样性 | GB/T 40226-2021《环境微生物宏基因组检测 高通量测序法》；GB 17378.5-2007 箱式采泥器采样与前处理 |
| 水产养殖池塘底泥 | 对虾、贝类养殖区底质病原筛查与休养期评估 | 弧菌属、肝肠胞虫等靶标基因qPCR定量、核酸纯度A260/A230 | GB/T 19495.5-2018 实时荧光定量PCR法；GB/T 40458-2021 核酸提取技术规范 |
| 疏浚与吹填底泥 | 航道疏浚物倾倒区生态影响评估、吹填区底质本底 | 微生物群落结构、烃降解等功能基因丰度、宏基因组组装质量 | GB/T 12763.6-2007 海洋生物调查；GB/T 46205-2025 宏基因组数据处理 |
| 海洋牧场与海草床底质 | 人工鱼礁投放区、海草床生态修复效果监测 | 底栖生物环境DNA条形码鉴定、物种丰富度、群落均匀度 | GB/T 42642-2023 底栖动物种群生态修复监测；DNA条形码高通量测序 |
| 溢油与污染事件底泥 | 溢油区、化工排污口沉积物微生物响应与修复评估 | 抗性基因与降解基因qPCR、宏基因组物种与功能注释 | GB/T 40226-2021；HJ 442.9-2020 近岸海域应急与专题监测 |
| 深海与柱状沉积物 | 深海底栖生命过程研究、极地海洋环境本底调查 | 分层核酸提取、古菌群落分析、核酸完整性评估 | GB/T 20260-2006 海底沉积物化学分析；GB 17378.5-2007 柱状样分层前处理 |
检测项目
1. 核酸浓度与纯度：荧光定量法测定浓度不低于5 ng/μL，A260/A280比值1.7~2.0，A260/A230比值不小于2.0
2. 核酸完整性：琼脂糖凝胶电泳主带不小于23 kb，数字电泳DIN值不低于7，满足宏基因组建库要求
3. 宏基因组测序数据量：单样品clean data 6~10 Gb，Q30碱基比例不低于85%，序列嵌合体比例不高于5%
4. 微生物多样性指标：16S rRNA基因V3~V4区有效序列数不低于30000条，ASV聚类相似度97%，Good覆盖率不低于0.97
5. 靶标基因荧光定量：qPCR扩增效率90%~110%，标准曲线R²不低于0.99，检出限不高于100 copies每反应
检测范围
1. 海洋沉积物：潮间带滩涂泥、河口三角洲沉积物、陆架泥质区表层样
2. 养殖底泥：对虾精养塘、滩涂贝类养殖区、深水网箱区底质
3. 疏浚底泥：航道疏浚物、港口回淤泥、吹填淤泥
4. 生态修复区底质：人工鱼礁区、海草床、红树林区沉积物
5. 特殊沉积物：溢油污染底泥、排污口邻近沉积物、柱状分层样
检测方法
1. GB/T 40226-2021 环境微生物宏基因组检测 高通量测序法
2. GB 17378.5-2007 海洋监测规范 第5部分：沉积物分析（样品采集与前处理）
3. HJ 442.4-2020 近岸海域环境监测技术规范 第4部分：近岸海域沉积物监测
4. GB/T 37874-2019 核酸提取纯化方法评价通则
5. GB/T 40458-2021 用于病原微生物高通量检测的核酸提取技术规范
6. GB/T 19495.5-2018 转基因产品检测 实时荧光定量聚合酶链式反应（PCR）检测方法（靶标基因定量参照）
7. GB/T 46205-2025 宏基因组数据处理和加工要求
检测设备
1. 高通量测序仪(Illumina NovaSeq 6000)：PE150/PE250双端读长，单次运行数据产出最高约6 Tb
2. 实时荧光定量PCR仪(Thermo QuantStudio 5)：96孔，温控精度±0.25℃，5色荧光通道
3. 超微量分光光度计(Thermo NanoDrop One)：核酸浓度测量范围2~37500 ng/μL，样品量0.5~2 μL
4. 荧光计(Thermo Qubit 4)：dsDNA HS模式检测下限达pg级，用于精确核酸定量
5. 全自动磁珠法核酸提取仪(Thermo KingFisher Flex)：24~96样本通量，单批提取约40~60 min
6. 高速冷冻离心机(Eppendorf 5922R)：最大相对离心力约26000 g，温控范围-10~40℃
7. 梯度PCR仪(Bio-Rad T100)：温控范围4~99℃，最高升温速率5℃/s，支持12列温度梯度
8. 数字微流控电泳仪(Agilent 4200 TapeStation)：DNA片段分析范围35~60000 bp，可输出DIN完整性值
9. 超声波细胞粉碎仪：功率100~600 W连续可调，用于沉积物匀浆与细胞裂解辅助
10. 超低温冰箱(Haier DW-86L959)：控温范围-40~-86℃，用于底泥与核酸样品长期保存