染色质检测

检测项目

1.染色质完整性分析：DNA断裂指数（DFI）、彗星尾距（TailMoment）

2.组蛋白修饰检测：H3K27me3甲基化率、H4K16乙酰化水平

3.核小体定位图谱：MNase-seq测序深度≥30X

4.染色质可及性测试：ATAC-seq开放区域覆盖率≥85%

5.三维构象解析：Hi-C互作矩阵分辨率≤10kb

检测范围

1.哺乳动物细胞系（HEK293、HeLa等）

2.临床组织样本（肿瘤/正常配对组织）

3.模式生物胚胎（斑马鱼、果蝇早期胚胎）

4.血液样本（外周血单个核细胞）

5.冷冻保存的生物样本（液氮速冻组织）

检测方法

1.彗星实验：ISO10993-5:2009生物相容性测试标准

2.ChIP-seq：ENCODE联盟标准化流程v2.0

3.ATAC-seq：BuenrostroNatMethods2013改良方案

4.Hi-C技术：DovetailGenomicsHi-C试剂盒方案

5.MNase-seq：GB/T37871-2019核酸酶消化规范

检测设备

1.BDFACSCantoII流式细胞仪：多色荧光信号采集（635nm/488nm双激光）

2.ThermoFisherNanoDropOne超微量分光光度计：1μL样本浓度测定

3.Agilent4200TapeStation系统：DNA完整性数值（DIN≥7.0）分析

4.IlluminaNovaSeq6000测序仪：双端150bp测序模式

5.ZeissLSM880共聚焦显微镜：63油镜NA1.4光学系统

6.BeckmanCoulterCytoFLEX流式细胞仪：405/488/638nm三激光配置

7.CovarisM220超声破碎仪：峰值功率175W可调聚焦超声

8.Bio-RadCFX96实时定量PCR仪：熔解曲线分析精度0.2℃

9.EppendorfCentrifuge5430R高速离心机：最大转速30,000g

10.OxfordNanoporePromethION测序平台：超长读长（N50＞100kb）测序