基因编辑药物免疫原性预测

检测项目

核酸组分免疫原性：

• CRISPR酶免疫识别：TLR3/7/9激活指数（阈值≥2.5倍对照）、IFN-γ释放量（ELISApg/mL）
• sgRNA二级结构预测：茎环区CpG基序密度（≥4个/100nt）、自由能值（ΔG≤-15kcal/mol）
• 载体骨架响应：抗载体IgG效价（EC50≤1:1000）、补体激活率（参照ISO10993-4）

• T细胞亚群活化：CD8+TEM扩增倍数（流式细胞术）、PD-1表达上调率（≥30%）
• 细胞因子风暴风险：IL-6/IFN-α峰值浓度（Luminex检测，标准曲线R²≥0.99）

• 中和抗体产生：抗药物抗体（ADA）阳性率（Elecsys法≥5%判定阳性）、表位扩散指数
• 交叉反应预测：人源蛋白同源度分析（BLASTE-value≤1e-5）

• LNP佐剂效应：PEG抗体产生时程（第7/14/21天滴度梯度）
• 病毒载体风险：腺病毒Hexon蛋白交叉反应（免疫印迹条带强度≥3+）

• AI风险评分：免疫原性指数（0-10分，XGBoostAUC≥0.85）
• 表位保守性分析：MHC-II结合亲和力（IC50≤500nM）

• 肝脏驻留免疫细胞：Kupffer细胞吞噬率变化（流式ΔMFI≥20%）
• 血脑屏障穿透性：CXCL10脑脊液浓度（LC-MS/MS检测限0.1pg/mL）

• 甲基化修饰效应：CpG岛去甲基化程度（WGBS覆盖度≥30X）
• 组蛋白标记：H3K27ac富集峰值（ChIP-seqFoldchange≥2）

• 记忆B细胞生成：CD27+IgD-细胞比例（流式±0.5%精度）
• T细胞耗竭指数：TIM-3/LAG-3共表达频率≥15%

• 人源化小鼠模型：免疫应答相关性系数（Pearsonr≥0.7）
• 食蟹猴攻毒试验：补体激活阈值（CH50≥40U/mL）

• 新抗原预测：非同义突变HLA结合亲和力（NetMHCpanv4.1）
• 可变剪接影响：外显子跳跃概率（SpliceAI评分≥0.8）

检测范围

1.CRISPR-Cas9核酸复合物：SpCas9/sgRNA核糖核蛋白复合体，侧重PAM邻近区序列的TLR7激活潜能检测

2.碱基编辑药物：BE4max-APOBEC融合蛋白体系，重点检测脱靶突变诱发的自身抗体生成

3.mRNA疫苗载体：5'帽修饰及UTR优化序列，分析dsRNA污染物触发的RIG-I通路响应

4.AAV递送系统：血清型AAV9/AAVrh74衣壳蛋白，评估预存抗体中和效应及肝脏嗜性

5.LNP封装制剂：可离子化脂质体（如DLin-MC3-DMA），检测PEG表面修饰诱导的加速血液清除现象

6.启动子元件：CMV/SFFV组成型启动子，测定NF-κB信号通路意外激活强度

7.表观遗传编辑器：dCas9-DNMT3A融合蛋白，监控CpG岛超甲基化导致的TLR9异常识别

8.自杀开关系统：HSV-TK/GCV安全开关，验证免疫清除机制触发效率

9.同源定向修复模板：ssDNA/dsDNA供体序列，扫描移码突变产生的新表位数量

10.基因驱动元件：常染色体连锁编辑组件，评估生殖细胞系特异性免疫应答

检测方法

国际标准：

• ICHS6(R1)生物技术药物临床前安全性评价（人源化模型验证要求）
• ISO10993-22:2017纳米材料免疫毒性测试（侧重TLR通路报告系统）
• EMA/CAT/80183/2014基因治疗免疫原性评估指南（中和抗体检测窗口期定义）

• GB/T39789-2021核酸药物免疫原性分析导则（要求设置假尿苷阳性对照）
• YY/T1824-2021基因编辑工具脱靶效应评价（包含ELISpotIFN-γ检测法）
• 药典2020版3448通则治疗性蛋白免疫原性（ADA检测灵敏度验证方案差异：国际标准要求≥100ng/mL，国标要求≥50ng/mL）

检测设备

1.高通量流式细胞仪：CytoFLEXSRT（检测通道32个，分辨率<3%CV）

2.液相芯片分析系统：Luminex200（同步检测100种细胞因子，动态范围3.5-32,000pg/mL）

3.单细胞测序平台：10XGenomicsChromium（单细胞捕获率≥65%，UMI错误率<0.1%）

4.表面等离子共振仪：Biacore8K（分子结合动力学检测范围ka=1E3-1E7M-1s-1）

5.超高分辨质谱仪：timsTOFPro2（质量精度<1ppm，扫描速度120Hz）

6.全自动酶联免疫仪：SpectraMaxiD5（吸光度检测范围0-4.0OD，温控精度±0.1℃）

7.数字PCR系统：QIAcuitydPCR（绝对定量精度±5%，分区数26,000）

8.冷冻电镜：GlaciosCryo-TEM（分辨率3.4Å，电子剂量率20e-/Ų/s）

9.生物分子相互作用仪：OctetRED96e（检测深度0.1-100nm，温控范围4-45℃）

10.蛋白组分析平台：OrbitrapExploris480（分辨率480,000@m/z200）

11.微流控芯片系统：FluidigmC1（单细胞捕获通量96样本/次）

12.人工智能计算集群：NVIDIADGXA100（显存640GB，FP64算力156TFLOPS）

13.组织成像分析仪：VectraPolaris（多光谱成像波段达7通道）

14.电旋转芯片：NanoViewExoViewR200（外泌体检测粒径下限50nm）

15.微量热泳动仪：MonolithX（分子结合常数检测范围Kd=1pM-500μM）

北检(北京)检测技术研究院【简称：北检院】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。

以上是与"基因编辑药物免疫原性预测"相关的简单介绍，具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。