检测项目

1.染色质开放性检测：DNase-seq测序深度≥30Mreads，分辨率150bp
2.组蛋白修饰分析：H3K27acChIP-seq信噪比≥10:1，覆盖度≥5Mpeaks
3.转录因子结合位点：EMSA迁移率差异≥20%，抗体特异性验证（WesternBlot）
4.三维基因组互作：Hi-C数据有效交互对≥50M，分辨率10kb
5.增强子活性验证：荧光素酶报告基因系统（相对活性≥5倍对照）

检测范围

1.人类原代细胞系（HEK293T、HepG2等）
2.小鼠/大鼠动物模型组织样本
3.植物基因组DNA（拟南芥、水稻等）
4.临床FFPE病理样本（保存期≤5年）
5.合成生物学载体（质粒构建体≥10kb）

检测方法

1.ATAC-seq：ISO20186-3:2021开放染色质分析标准
2.ChIP-seq：ENCODE项目v3实验指南（2022修订版）
3.Hi-C：4DN联盟标准化流程（2023版）
4.DNase-seq：GB/T37872-2019核酸酶超敏位点检测规范
5.STARR-seq：ASTME3060-23高通量增强子筛选方法

检测设备

1.IlluminaNovaSeq6000：双通道测序平台（PE150模式）
2.Agilent2100Bioanalyzer：DNA/RNA完整性检测（RIN≥8.0）
3.CovarisM220：超声破碎仪（峰值功率175W）
4.ThermoFisherQubit4.0：微量核酸定量（检测限0.1pg/μL）
5.Bio-RadCFX96：实时荧光定量PCR（熔解曲线分析）
6.NanostringGeoMxDSP：空间转录组分析（ROI精度10μm）
7.10XGenomicsChromiumX：单细胞ATAC建库系统
8.PerkinElmerChemiDocMP：化学发光成像系统（16bit动态范围）
9.EppendorfMastercyclerX50s：梯度PCR仪（温控精度0.1℃）
10.OxfordNanoporePromethION48：长读长测序平台（N50≥100kb）