检测项目

1.反向重复序列长度：检测范围20-500bp，分辨率1bp
2.回文对称性指数：计算对称轴两侧碱基匹配度（0-100%）
3.热力学稳定性：测定ΔG值（-50至0kcal/mol），精度0.5kcal/mol
4.发夹环结构参数：环区长度4-20nt，茎区配对率≥85%
5.同源重组概率：预测重组效率（0.01-99.99%），置信区间95%

检测范围

1.基因组DNA：包括人类/动物/植物全基因组提取物
2.质粒载体：各类原核/真核表达载体及克隆载体
3.合成寡核苷酸：长度≤200nt的单链/双链DNA片段
4.PCR产物：扩增产物纯度≥90%，浓度≥10ng/μL
5.病毒基因组：腺相关病毒（AAV）、慢病毒载体等

检测方法

1.ISO21571:2013食品微生物学-核酸提取与纯化
2.ASTME3025-16DNA测序质量评价标准
3.GB/T30989-2014高通量测序数据分析通则
4.GB/T35537-2017合成寡核苷酸质量要求
5.ISO/IEC17025:2017检测实验室通用要求

检测设备

1.IlluminaNovaSeq6000：全基因组测序平台（读长2150bp）
2.ThermoFisherQuantStudio7Pro：实时荧光定量PCR仪（灵敏度0.1pg）
3.Agilent4200TapeStation：核酸完整性分析系统（DIN值≥7）
4.BeckmanCoulterBiomeki7：自动化液体处理工作站（移液精度1%）
5.OxfordNanoporeGridION：长读长测序设备（读长≥10kb）
6.Bio-RadCFXOpus96：梯度PCR仪（温控精度0.1℃）
7.EppendorfMastercyclerX50s：热循环仪（升降温速率6℃/s）
8.QiagenQIAcubeHT：高通量核酸纯化系统（通量96样本/批次）
9.AppliedBiosystems3730xl：毛细管电泳仪（分辨率1bp）
10.RocheLightCycler480II：多重荧光定量系统（6色通道）