检测项目

1.序列比对率:≥98%有效reads比对率(hg38参考基因组)

2.拷贝数变异频率:0.1%~50%动态范围检测

3.GC含量偏差:5%内GC偏好性校正

4.绝对定量精度:CV≤2%(10^2~10^7copies/μL)

5.嵌合体识别:≥50bp片段嵌合率分析

6.批次间差异:RSD≤3%(同源样本三次重复)

检测范围

1.基因组DNA:全基因组/靶向区域拷贝数分析

2.细胞系样本:STR分型验证后的永生化细胞

3.临床FFPE组织:肿瘤纯度≥30%的病理切片

4.质粒标准品:10^1~10^9copies/μL梯度稀释体系

5.mRNA药物:体外转录产物的完整性验证(RIN≥7.0)

6.微生物培养物:16SrRNA基因拷贝数校正

检测方法

1.ddPCR:ISO20395-2018生物技术标准

2.qPCR:GB/T30988-2014多色荧光检测法

3.NGS:ISO/IEC23041-2020高通量测序规范

4.MLPA:MRC-HollandSALSA技术方案v7

5.Sanger测序:GB/T29889-2013双向验证规程

6.微流控芯片:ASTME3025-18流体控制标准

检测设备

1.ThermoFisherQuantStudio6Pro:六通道荧光定量系统

2.Bio-RadQX200DropletDigitalPCR:微滴生成/读取一体机

3.IlluminaNovaSeq6000:双流动槽高通量测序仪

4.Agilent4200TapeStation:核酸完整性分析仪

5.BeckmanCoulterBiomeki7:自动化液体处理工作站

6.RocheLightCycler480II:96孔实时定量模块

7.OxfordNanoporeGridIONX5:长读长测序平台

8.EppendorfMastercyclerX50s:梯度PCR扩增仪

9.PerkinElmerLabChipGXTouch:芯片电泳分析系统

10.QiagenQIAxcelAdvanced:微毛细管电泳仪