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差异拷贝检测

  • 原创官网
  • 2025-05-27 19:04:57
  • 关键字:差异拷贝测试方法,差异拷贝测试标准,差异拷贝测试案例
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差异拷贝检测概述:检测项目1.序列比对率:≥98%有效reads比对率(hg38参考基因组)2.拷贝数变异频率:0.1%~50%动态范围检测3.GC含量偏差:5%内GC偏好性校正4.绝对定量精度:CV≤2%(10^2~10^7copies/μL)5.嵌合体识别:≥50bp片段嵌合率分析6.批次间差异:RSD≤3%(同源样本三次重复)检测范围1.基因组DNA:全基因组/靶向区域拷贝数分析2.细胞系样本:STR分型验证后的永生化细胞3.临床FFPE组织:肿瘤纯度≥30%的病理切片4.质粒标准品:10^1~10^9copies/


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检测项目

1.序列比对率:≥98%有效reads比对率(hg38参考基因组)

2.拷贝数变异频率:0.1%~50%动态范围检测

3.GC含量偏差:5%内GC偏好性校正

4.绝对定量精度:CV≤2%(10^2~10^7copies/μL)

5.嵌合体识别:≥50bp片段嵌合率分析

6.批次间差异:RSD≤3%(同源样本三次重复)

检测范围

1.基因组DNA:全基因组/靶向区域拷贝数分析

2.细胞系样本:STR分型验证后的永生化细胞

3.临床FFPE组织:肿瘤纯度≥30%的病理切片

4.质粒标准品:10^1~10^9copies/μL梯度稀释体系

5.mRNA药物:体外转录产物的完整性验证(RIN≥7.0)

6.微生物培养物:16SrRNA基因拷贝数校正

检测方法

1.ddPCR:ISO20395-2018生物技术标准

2.qPCR:GB/T30988-2014多色荧光检测法

3.NGS:ISO/IEC23041-2020高通量测序规范

4.MLPA:MRC-HollandSALSA技术方案v7

5.Sanger测序:GB/T29889-2013双向验证规程

6.微流控芯片:ASTME3025-18流体控制标准

检测设备

1.ThermoFisherQuantStudio6Pro:六通道荧光定量系统

2.Bio-RadQX200DropletDigitalPCR:微滴生成/读取一体机

3.IlluminaNovaSeq6000:双流动槽高通量测序仪

4.Agilent4200TapeStation:核酸完整性分析仪

5.BeckmanCoulterBiomeki7:自动化液体处理工作站

6.RocheLightCycler480II:96孔实时定量模块

7.OxfordNanoporeGridIONX5:长读长测序平台

8.EppendorfMastercyclerX50s:梯度PCR扩增仪

9.PerkinElmerLabChipGXTouch:芯片电泳分析系统

10.QiagenQIAxcelAdvanced:微毛细管电泳仪

北检(北京)检测技术研究院【简称:北检院】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

  以上是与差异拷贝检测相关的简单介绍,具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。

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