检测项目
1.重复单元长度范围测定(100-5000bp分辨率5bp)
2.拷贝数变异率分析(CV≤2%,动态范围10^3-10^6)
3.序列同源性比对率(阈值≥95%,BlastE-value≤1e-5)
4.GC含量偏差度测试(允许偏差3%)
5.甲基化修饰位点定位(覆盖度≥99%,精度1bp)
6.二级结构自由能预测(ΔG值范围-50~0kcal/mol)
检测范围
1.人类基因组DNA样本(浓度≥20ng/μL)
2.临床血液/组织FFPE样本(降解度≤30%)
3.模式生物全基因组文库(插入片段300-800bp)
4.法医STR复合扩增产物(扩增效率≥90%)
5.古DNA提取物(内源性DNA≥1%)
6.合成生物学载体构建体(载体长度≤50kb)
检测方法
ASTME2065-12(2020)核酸热力学特性测试规范
ISO/IEC23092-2:2021基因组数据编码技术要求
GB/T30988-2014多态性DNA分析技术规程
GB/T34796-2017核酸定量测序技术通则
ISO20395:2019二代测序文库质量评价方法
YY/T1596-2017高通量测序仪校准规范
检测设备
IlluminaNovaSeq6000:双通道SBS技术,通量6Tb/run
ThermoFisherQuantStudio7Pro:六色荧光通道qPCR系统
Agilent4200TapeStation:DNA完整性指数(DIN)测定
ABI3500xLGeneticAnalyzer:毛细管电泳片段分析
BeckmanCoulterCEQ8000:微卫星不稳定性自动分型系统
NanoporeGridIONX5:长读长实时测序平台(读长≥100kb)
Bio-RadCFXOpus96:高精度熔解曲线分析模块
SageSciencePippinHT:自动化核酸片段分选系统
QiagenQIAxcelAdvanced:全自动电泳芯片分析仪
CovarisM220:聚焦超声DNA片段化仪(150-500bp可调)