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中等重复序列检测

  • 原创官网
  • 2025-05-24 21:31:04
  • 关键字:中等重复序列测试机构,中等重复序列测试周期,中等重复序列测试案例
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中等重复序列检测概述:检测项目1.重复单元长度范围测定(100-5000bp分辨率5bp)2.拷贝数变异率分析(CV≤2%,动态范围10^3-10^6)3.序列同源性比对率(阈值≥95%,BlastE-value≤1e-5)4.GC含量偏差度测试(允许偏差3%)5.甲基化修饰位点定位(覆盖度≥99%,精度1bp)6.二级结构自由能预测(ΔG值范围-50~0kcal/mol)检测范围1.人类基因组DNA样本(浓度≥20ng/μL)2.临床血液/组织FFPE样本(降解度≤30%)3.模式生物全基因组文库(插入片段300-800bp


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检测项目

1.重复单元长度范围测定(100-5000bp分辨率5bp)

2.拷贝数变异率分析(CV≤2%,动态范围10^3-10^6)

3.序列同源性比对率(阈值≥95%,BlastE-value≤1e-5)

4.GC含量偏差度测试(允许偏差3%)

5.甲基化修饰位点定位(覆盖度≥99%,精度1bp)

6.二级结构自由能预测(ΔG值范围-50~0kcal/mol)

检测范围

1.人类基因组DNA样本(浓度≥20ng/μL)

2.临床血液/组织FFPE样本(降解度≤30%)

3.模式生物全基因组文库(插入片段300-800bp)

4.法医STR复合扩增产物(扩增效率≥90%)

5.古DNA提取物(内源性DNA≥1%)

6.合成生物学载体构建体(载体长度≤50kb)

检测方法

ASTME2065-12(2020)核酸热力学特性测试规范

ISO/IEC23092-2:2021基因组数据编码技术要求

GB/T30988-2014多态性DNA分析技术规程

GB/T34796-2017核酸定量测序技术通则

ISO20395:2019二代测序文库质量评价方法

YY/T1596-2017高通量测序仪校准规范

检测设备

IlluminaNovaSeq6000:双通道SBS技术,通量6Tb/run

ThermoFisherQuantStudio7Pro:六色荧光通道qPCR系统

Agilent4200TapeStation:DNA完整性指数(DIN)测定

ABI3500xLGeneticAnalyzer:毛细管电泳片段分析

BeckmanCoulterCEQ8000:微卫星不稳定性自动分型系统

NanoporeGridIONX5:长读长实时测序平台(读长≥100kb)

Bio-RadCFXOpus96:高精度熔解曲线分析模块

SageSciencePippinHT:自动化核酸片段分选系统

QiagenQIAxcelAdvanced:全自动电泳芯片分析仪

CovarisM220:聚焦超声DNA片段化仪(150-500bp可调)

北检(北京)检测技术研究院【简称:北检院】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。

  以上是与中等重复序列检测相关的简单介绍,具体试验/检测周期、检测方法和仪器选择会根据具体的检测要求和标准而有所不同。北检研究院将根据客户需求合理的制定试验方案。

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