检测项目
1.供体菌群筛选评估：病原微生物筛查、抗生素耐药基因检测、菌群多样性及丰度分析、潜在致病菌丰度评估。
2.受体基线状态评估：移植前肠道菌群结构分析、肠道炎症标志物检测、肠道屏障功能相关指标、基础免疫状态评估。
3.移植后菌群定植动态监测：特定供体菌株定植追踪、整体菌群结构演替分析、关键功能菌群丰度变化、菌群稳定性评估。
4.定植抗性功能评价：对特定病原菌（如艰难梭菌）的抑制能力测定、短链脂肪酸产生能力分析、胆汁酸代谢功能评估、抗菌肽表达水平间接评估。
5.菌群代谢产物分析：短链脂肪酸定量检测、次级胆汁酸谱分析、色氨酸代谢产物测定、其他菌群相关代谢物组学分析。
6.肠道屏障与免疫应答评估：血清脂多糖结合蛋白检测、连蛋白抗体检测、肠道特异性免疫球蛋白水平、炎症细胞因子谱分析。
7.菌群功能基因预测与分析：宏基因组功能基因注释、抗生素耐药基因池变化、碳水化合物活性酶谱分析、病原菌毒力因子筛查。
8.体外模型验证试验：人工肠道模型定植模拟、共培养病原菌抑制实验、代谢产物功能验证、上皮细胞屏障功能影响测试。
9.安全性相关监测：机会致病菌增殖监测、新型耐药基因出现预警、代谢产物毒性评估、免疫异常激活标志物检测。
10.长期疗效关联性分析：菌群定植持久性评估、临床症状改善与菌群指标的关联分析、复发预警微生物标志物探索。
检测范围
健康供体粪便样本、受体移植前基线粪便样本、受体移植后不同时间点（如第1天、第1周、第1月、第3月）的系列粪便样本、用于体外验证的粪菌移植制备物、模拟肠道环境的共培养物、受体的外周血样本、肠道类器官共培养上清
检测设备
1.高通量测序平台：用于对样本中微生物的脱氧核糖核酸进行深度测序，解析菌群物种组成与基因功能信息；具备双端测序能力，保障数据准确性。
2.实时荧光定量聚合酶链式反应仪：用于对特定细菌菌株或功能基因进行绝对或相对定量分析；具有高灵敏度和宽动态检测范围。
3.厌氧培养工作站：提供无氧恒温环境，用于肠道微生物的分离、纯化、培养以及体外相互作用实验；确保严格厌氧条件。
4.气相色谱-质谱联用仪：用于精确检测与定量粪便及培养液中短链脂肪酸等挥发性代谢产物；具备高分离效能和定性能力。
5.液相色谱-质谱联用仪：用于非挥发性代谢产物的定性与定量分析，如胆汁酸、色氨酸代谢物等；具有高分辨率与高灵敏度。
6.酶标仪：用于进行酶联免疫吸附试验，检测各类炎症因子、免疫球蛋白、肠道屏障相关蛋白等血清或粪便标志物。
7.生物信息学分析服务器：搭载专业生物信息软件，用于处理海量测序数据，进行物种注释、多样性分析、差异比较及功能预测。
8.超高效液相色谱仪：用于复杂生物样本中各类代谢物的高效分离，常与质谱检测器联用，是代谢组学分析的核心设备。
9.核酸自动提取仪：用于从粪便等复杂样本中高通量、标准化地提取微生物总脱氧核糖核酸或核糖核酸，保证提取质量与效率。
10.细胞培养与活体成像系统：用于构建体外肠道上皮细胞模型，观察菌群或其代谢产物对细胞屏障功能的影响及病原菌抑制过程。