检测项目

1.22q11.2微缺失综合征检测:覆盖TBX1、COMT等关键基因区域(hg38:chr22:19,000,000-21,500,000),分辨率达100kb

2.Prader-Willi/Angelman综合征15q11-q13区域检测:分析SNRPN、UBE3A等基因甲基化状态及拷贝数变异

3.Williams综合征7q11.23区域检测:ELN、LIMK1等基因缺失分析(hg38:chr7:72,700,000-74,100,000)

4.1p36缺失综合征检测:覆盖MMP23B、GABRD等基因(hg38:chr1:1,500,000-10,400,000),分辨率50kb

5.Y染色体微缺失(AZF区)检测:包含AZFa(sY84/sY86)、AZFb(sY127/sY134)、AZFc(sY254/sY255)标记物

检测范围

1.外周血基因组DNA样本:浓度≥10ng/μL(Qubit测定),OD260/280=1.8-2.0

2.羊水细胞样本:培养后细胞数≥10^5个/mL,污染率<1%

3.绒毛膜取样标本:重量≥10mg,母源细胞污染<5%

4.石蜡包埋组织样本:切片厚度4μm10片,肿瘤细胞占比>70%

5.产前筛查阳性样本:血清学筛查风险值≥1/250或NIPT提示高风险

检测方法

1.MLPA技术(MRC-HollandSALSA试剂盒):符合ISO17025:2017标准,探针密度≥40个/目标区域

2.微阵列比较基因组杂交(aCGH):执行AgilentSurePrintG3方案(分辨率≥60kb),参照GB/T30988-2014

3.荧光定量PCR(qPCR):采用TaqMan探针法(ABI7500系统),循环阈值CV≤2%

4.高通量测序(NGS):IlluminaNovaSeq平台PE150测序模式,平均深度≥30

5.FISH验证:遵循ISCN2020命名规范,使用AbbottVysis探针系统

检测设备

1.ThermoFisherQuantStudio5Real-TimePCR系统:96孔板荧光定量分析模块

2.AgilentSureScanMicroarrayScannerG4900DA:支持860K高密度芯片扫描

3.IlluminaNovaSeq6000测序仪:SP流动槽单次产出>1300Gb数据

4.BeckmanCoulterBiomeki7自动化工作站:移液精度CV≤3%(1-200μL)

5.QIAGENQIAxcelAdvanced系统:DNA片段分析范围100bp-5kb

6.OlympusBX53荧光显微镜:配备TRITC/FITC/DAPI三色滤光片组

7.CovarisM220聚焦超声破碎仪:DNA片段化精度50bp(目标长度200bp)

8.Bio-RadCFX96Touch深孔模块:支持384孔板qPCR反应体系

9.NanodropOne超微量分光光度计:测量范围2-27,500ng/μL(dsDNA)

10.EppendorfCentrifuge5430R:最大转速14,500rpm(301.5mL转子)