可送检的样品类型与对应检测项目
| 样品类型 | 典型应用场景 | 主要检测项目 | 常用方法 / 参考 |
|---|---|---|---|
| 牛血液与组织样 | 种公牛系谱确认、育种群系谱纠错与良种登记 | 微卫星DNA分型、个体识别基因型、亲子关系三联体判定 | GB/T 27642-2011 牛个体及亲子鉴定微卫星DNA法 |
| 毛囊与耳缘组织样 | 牧场现场采样送检、犊牛出生登记留样 | 基因组DNA提取质量核查、STR分型成功率 | 现场采样规范配合标准分型流程 |
| 冻精与胚胎样 | 人工授精亲本追溯、胚胎移植后代亲本确认 | 亲本与后代基因型比对、精液样本分型 | GB/T 27642-2011 分型体系延伸应用 |
| 肉样与可追溯产品样 | 优质牛肉溯源体系、品牌肉源核验 | 个体基因型与档案比对、来源一致性 | 微卫星与SNP标记组合比对 |
| 群体遗传评估样 | 保种群体遗传结构、近交系数控制 | 等位基因频率、遗传杂合度、亲缘关系矩阵 | 群体遗传学统计分析通用方法 |
| 其他畜种参照样 | 马属等畜种亲子鉴定参照 | 物种特异性标记分型与亲缘判定 | GB/T 26612-2011 纯血马DNA亲子鉴定技术规程（方法参照） |
检测项目
1. 微卫星STR分型：国际推荐组合位点多态性分型，片段精确到碱基水平
2. 个体识别：独一无二基因型建档，同群个体区分
3. 亲子关系判定：三联体与二联体比对，累积非父排除概率优于99.99%
4. 基因组DNA质量：提取浓度纯度与完整性核查，保障分型成功率
5. 遗传多样性指标：等位基因数、观测与期望杂合度、多态信息含量
6. 近交与亲缘评估：个体近交系数与亲缘关系矩阵计算
检测范围
1. 牛种范围：荷斯坦、西门塔尔、安格斯、和牛及地方黄牛品种
2. 样品形态：抗凝血、耳缘组织、带毛囊毛发、冻精、胚胎样
3. 应用对象：种公牛站、育种核心群、胚胎移植后代、品牌肉牛溯源
4. 群体类型：保种群、扩繁群、杂交改良群体
5. 参照畜种：纯血马等参照分子亲子鉴定方法的对象
检测方法
1. GB/T 27642-2011 牛个体及亲子鉴定微卫星DNA法
2. 多重PCR荧光标记扩增与毛细管电泳片段分型
3. 基因组DNA提取与浓度纯度测定通用流程
4. 亲权判定统计：亲权排除与似然比累计计算
5. 群体遗传结构分析：等位基因频率与杂合度统计
6. GB/T 26612-2011 纯血马DNA亲子鉴定技术规程（跨物种方法参照）
检测设备
1. 毛细管电泳遗传分析仪：荧光片段分型，分辨率1bp级
2. 梯度PCR仪：96孔多重扩增程序控制
3. 核酸蛋白测定仪：DNA浓度与纯度快速定量
4. 凝胶成像系统：DNA完整性与扩增产物电泳核查
5. 高速冷冻离心机：核酸提取分离
6. 超净工作台与防污染分区：前处理与扩增后区域物理隔离
7. 移液工作站：试剂配制与加样自动化
8. -80℃与-20℃样本冰箱：血样组织与DNA长期保存
9. 基因分型分析软件：等位基因判读与亲权计算
10. 数据库与档案系统：基因型记录、系谱比对与追溯管理