可送检的样品类型与对应检测项目

样品类型 典型应用场景 主要检测项目 常用方法 / 参考
土壤样品 根际微生物群落分析、耕地质量评价、污染场地修复效果评估 分离频度、可培养菌种群密度（CFU/g 干重）、优势菌群占比、真菌细菌比例、多样性指数 梯度稀释平板计数法、涂布与倾注培养结合、菌落形态归类统计，必要时辅以 16S rDNA 与内转录间隔区测序鉴定
植物根茎叶组织 植物内生菌资源调查、内生菌定殖规律研究、生物防治菌筛选 组织分离频度、内生菌定殖率、目标菌检出率、菌群组成、优势种群优势度 表面消毒组织切块分离法、PDA 培养基培养、末次漂洗液无菌验证、显微镜形态学观察
植物病组织与种子 植物病害病原鉴定、种传病害检验、病害普查与监测 病原菌分离频度、病原种类组成、优势病原占比、种传带菌率 病组织切块培养、单孢或单菌丝纯化、柯赫氏法则回接验证、GB/T 3543.5 健康检验规程
发酵基质与饲料 酒曲与酱醪菌群解析、青贮饲料品质控制、堆肥与生物有机肥功能菌评估 菌株分离频度、菌落总数、霉菌酵母构成比、功能菌定殖数量、杂菌污染度 选择性培养基平板分离、菌落计数器计数、生理生化试验与分子鉴定相结合
水体与沉积物 养殖水体微生物监测、湖泊河流微生物多样性调查、疫病预警 分离频度、异养菌总数、特定类群（如弧菌）占比、菌群季节演替规律 滤膜法与稀释涂布法、选择性培养基富集分离、菌落形态与分子条形码联合鉴定
昆虫与动物载体样本 传病媒介带菌研究、共生菌功能分析、寄生虫与共生微生物关系研究 载体带菌率、目标菌分离频度、菌群组成与多态性 组织匀浆稀释培养、PCR 与测序辅助鉴定、显微计数与形态分类相结合

检测项目

1. 分离频度：目标菌检出样本份数占总样本份数的百分比，样本量不少于30份以保证统计意义

2. 种群密度：可培养菌10²~10⁸ CFU/g（干重）量级，采用梯度稀释平板法计数

3. 优势种群占比：单一菌落类型占全部菌落比例达到30%以上判定为优势菌群

4. 多样性指数：Shannon-Wiener指数H'值范围0.5~4.5，Simpson优势度指数D值范围0.1~0.9

5. 目标菌检出限：选择性培养基结合PCR验证，检出限可低至1 CFU/25g

检测范围

1. 土壤样品：根际土、大田耕作层土、林地腐殖土、污染场地修复土等

2. 植物组织：水稻、小麦、玉米、烟草、药用植物的根、茎、叶及种子等

3. 植物病原菌：镰刀菌、疫霉菌、炭疽菌、丝核菌等真菌类及细菌性病原

4. 发酵基质：酒曲、酱醪、青贮饲料、堆肥、生物有机肥等

5. 水体及沉积物：养殖水体、湖泊河流水样、底泥沉积物等

检测方法

1. GB 4789.2-2022 食品安全国家标准 食品微生物学检验 菌落总数测定

2. GB/T 3543.5-1995 农作物种子检验规程 健康检验（种子带菌分离培养与频度统计）

3. ISO 4833-1:2013 食物链微生物学 微生物计数水平方法 30℃倾注平板菌落计数法

4. GB/T 19524.1-2004 肥料中粪大肠菌群的测定（平板分离计数法）

5. ISO 7218:2019 食物链微生物学 微生物学检验通用要求和指南（分离纯化与计数统计规范）

检测设备

1. 生物安全柜：洁净度ISO 5级，下降风速0.35-0.55m/s

2. 恒温培养箱：温度范围5-60℃，波动度±0.5℃

3. 霉菌培养箱：温度范围4-70℃，湿度控制40-95%RH

4. 高压蒸汽灭菌锅：灭菌温度105-135℃，容积50-100L

5. 振荡培养摇床：转速50-400rpm，控温精度±0.1℃

6. 菌落计数器：计数速度不低于500CFU/皿，放大倍率可调

7. 光学显微镜：放大倍数40-1600倍，配4/10/40/100倍物镜

8. 超低温冰箱：温度范围-86~-40℃，容积300-700L

9. 拍击式均质器：拍击速率3-12次/秒，处理量30-400mL

10. PCR扩增仪：温度范围4-99℃，升降温速率不低于5℃/s